page_head_bg

Produkti

Transpozāzei pieejamā hromatīna noteikšana ar augstas caurlaidspējas sekvencēšanu (ATAC-seq)

ATAC-seq ir augstas caurlaidspējas sekvencēšanas metode genoma mēroga hromatīna pieejamības analīzei, kas ir svarīga gēnu ekspresijas globālajai epiģenētiskajai kontrolei.Sekvencēšanas adapteri tiek ievietoti atvērtajos hromatīna reģionos ar hiperaktīvu Tn5 transpozāzi.Pēc PCR amplifikācijas tiek izveidota sekvencēšanas bibliotēka.Visus atvērtos hromatīna reģionus var iegūt noteiktos telpas un laika apstākļos, ne tikai aprobežojoties ar transkripcijas faktora saistīšanās vietām vai noteiktu histonu modificētu reģionu.


Sīkāka informācija par pakalpojumu

Bioinformātika

Demonstrācijas rezultāti

Pakalpojuma priekšrocības

ØVisaptveroša analīze: profesionāls analīzes cauruļvads, lai apmierinātu dažādas pielāgotas analīzes vajadzības;

ØPlaša pieredze: līdz šim veiksmīgi pabeigti simtiem projektu, tostarp dzīvnieku un augu paraugi.

Pakalpojuma specifikācijas

Platforma: NovaSeq 6000 platforma, PE150

Bibliotēkas veids: 100–500 bp ievietošanas cDNS bibliotēka (atkarībā no pīķa sadalījuma)

Sekvencēšanas stratēģija: pārī beigas 150 bp

Ieteicamā datu izvade: 50 M nolasījumu

Prasību paraugs

Parauga veids: audi, dzīvas šūnas vai saldētas šūnas un tā tālāk

Šūnas skaits: ≥ 5×105precīzs šūnu skaits ir eksperimenta panākumu atslēga;

Audu svars: ≥ 200mg svaigu audu;

Pakalpojuma darba plūsma

logo_01

Eksperimenta dizains

logo_02

Paraugu piegāde

logo_03

DNS ekstrakcija

logo_04

Bibliotēkas celtniecība

logo_05

Secība

logo_06

Datu analīze

logo_07

Pēcpārdošanas pakalpojumi


  • Iepriekšējais:
  • Nākamais:

  • Bioinformātika

    2(1)

    1. 1. ATAC siltuma karte nolasa sadalījumu TSS un blakus reģionos (±3 kb)3(1)
    2. 2.Atvērtā hromatīna reģiona sadalījums dažādos genoma komponentos4(1)3.Diferencēta maksimālā zvanīšana starp grupām5(1)

    saņemt citātu

    Uzrakstiet savu ziņu šeit un nosūtiet to mums

    Nosūtiet mums savu ziņu: