Pilns baktēriju genoms
Pakalpojuma priekšrocības
● Dažādiem pētniecības mērķiem ir pieejamas vairākas secības noteikšanas stratēģijas
● Pilnīgs baktēriju genoms ar 0 Gap garantētu.
● Liela pieredze baktēriju genomu komplektēšanā ar vairāk nekā 10 000 komplektētu genomu.
● Profesionāla pēcpārdošanas tehniskā atbalsta komanda, kas atbilst specifiskākām pētniecības vajadzībām.
Pakalpojuma specifikācijas
| Secībastratēģija | Bibliotēka | Kvalitāte garantēta | Paredzamais apgrozības laiks |
| Nanopore 100X + Illumina 50X | Nanopore 20K PE150 | 0 sprauga | 30 dienas |
| PacBio HiFi 30X | PacBio 10K |
Bioinformātikas analīzes
● Neapstrādātu datu kvalitātes kontrole
● Genoma montāža
● Genoma komponentu analīze
● Gēnu funkcijas anotācija
● Salīdzinošā genoma analīze
Prasību paraugs un piegāde
Prasību paraugs:
PriekšDNS ekstrakti:
| Parauga veids | Summa | Koncentrēšanās | Tīrība |
| DNS ekstrakti | ＞ 2 μg | ＞ 20 ng/μl | OD260/280= 1,6-2,5 |
Audu paraugiem:
| Parauga veids | Ieteicamā paraugu apstrāde | Paraugu uzglabāšana un nosūtīšana |
| Baktērijas | Novērojiet baktērijas mikroskopā un savāciet baktērijas to eksponenciālajā fāzē Pārnes baktēriju kultūru (kas satur aptuveni 3-4,5e9 šūnas) 1,5 vai 2 ml eppendorfā.(Palieciet uz ledus) Centrifugējiet mēģeni 1 minūti pie 14000 g, lai savāktu baktērijas un uzmanīgi noņemtu supernatantu Noslēdziet mēģeni un sasaldējiet baktērijas šķidrā slāpeklī vismaz 30 minūtes.Uzglabājiet cauruli -80 ℃ ledusskapī. | Sasaldējiet paraugus šķidrā slāpeklī 3-4 stundas un uzglabājiet šķidrā slāpeklī vai -80 grādos līdz ilgstošai rezervēšanai.Nepieciešama paraugu piegāde ar sauso ledu. |
Pakalpojuma darba plūsma
Paraugu piegāde
Bibliotēkas celtniecība
Secība
Datu analīze
Pēcpārdošanas pakalpojumi
1. Baktēriju genoma cirks
2.Kodēšanas gēnu prognozēšana
3. Salīdzinošā genomikas analīze: filoģenētiskais koks
