Baktēriju un sēnīšu pilna genoma atkārtota sekvencēšana
Baktēriju un sēnīšu pilna genoma atkārtotas sekvencēšanas projekti ir izšķiroši svarīgi mikrobu genomikas attīstībai, ļaujot pabeigt un salīdzināt mikrobu genomus. Tas atvieglo fermentācijas inženieriju, rūpniecisko procesu optimizāciju un sekundāro metabolisma ceļu izpēti. Turklāt sēnīšu un baktēriju atkārtota sekvencēšana ir ļoti svarīga, lai izprastu vides adaptāciju, optimizētu celmus un atklātu ģenētiskās evolūcijas dinamiku, ar plašu ietekmi medicīnā, lauksaimniecībā un vides zinātnē.
Pakalpojuma priekšrocības
●Bioinformātiskā analīze ietver variantu noteikšanu:Sniedzot funkcionālu ieskatu atkārtoti sekvencētajos genomos.
● Plaša pieredzeAr tūkstošiem mikrobu atkārtotas sekvencēšanas projektu, ko veicam katru gadu, mēs piedāvājam vairāk nekā desmit gadu pieredzi, augsti kvalificētu analīzes komandu, visaptverošu saturu un lielisku pēcpārdošanas atbalstu.
●Pēcpārdošanas atbalsts:Mūsu apņemšanās sniedzas tālāk par projekta pabeigšanu, piedāvājot 3 mēnešu pēcpārdošanas servisa periodu. Šajā laikā mēs piedāvājam projekta uzraudzību, palīdzību problēmu novēršanā un jautājumu un atbilžu sesijas, lai atbildētu uz visiem ar rezultātiem saistītajiem jautājumiem.
Pakalpojuma specifikācijas
| Sekvencēšanas platforma | Sekvencēšanas stratēģija | Ieteicamie dati | Kvalitātes kontrole |
| Illumina NovaSeq | PE150 | 100x dziļums | Q30≥85% |
Parauga prasības
| Koncentrācija (ng/µL) | Kopējais daudzums (ng) | Tilpums (µl) |
| ≥1 | ≥60 | ≥20 |
Baktērijas: ≥1x107 šūnas
Vienšūnu sēnītes: ≥5x106-1x107 šūnas
Makro sēnītes: ≥4g
Pakalpojumu darba plūsma
Parauga piegāde
Bibliotēkas būvniecība
Sekvencēšana
Datu analīze
Pēcpārdošanas pakalpojumi
Ietver šādu analīzi:
- Sekvencēšanas datu kvalitātes kontrole
- Pielāgošana atsauces genomam
- Variantu izsaukšana: SNP un InDel
- Varianta anotācija
Variantu izsaukšana: SNP veidi
Variantu izsaukšana: InDel garuma sadalījums
Iepazīstieties ar BMKGene mikrobu genoma atkārtotas sekvencēšanas pakalpojumu sniegtajiem sasniegumiem, izmantojot atlasītu publikāciju kolekciju.
Jia, Y. et al. (2023) “Transkriptoma un pilna genoma atkārtotas sekvencēšanas apvienošana, lai pārbaudītu slimību rezistences gēnus kviešu pundurkrūmiem”,Starptautiskais molekulāro zinātņu žurnāls, 24(24). doi: 10.3390/IJMS242417356.
Dzjans, M. u.c. (2023) “Ampicilīna kontrolēta glikozes vielmaiņa ietekmē pāreju no tolerances uz rezistenci baktērijās”,Zinātnes attīstība, 9(10). doi: 10.1126/SCIADV.ADE8582/SUPPL_FILE/SCIADV.ADE8582_SM.PDF.
Yang, M. et al. (2022) “Aliidiomarina halalkaliphila sp. nov., haloalkalifila baktērija, kas izolēta no sodas ezera Iekšējās Mongolijas autonomajā reģionā, Ķīnā”, Int. J. Syst. Evol.Mikrobiols, 72, lpp. 5263. doi: 10.1099/ijsem.0.005263.
Zhu, Z., Wu, R. un Wang, G.-H. (2024) “Staphylococcus nepalensis ZZ-2023a genoma secība, izolēta no Nasonia vitripennis”,Mikrobioloģijas resursu paziņojumidoi: 10.1128/MRA.00802-23.
