Baktēriju un sēnīšu vesela genoma atkārtota secība
Baktēriju un sēnīšu visa genoma atkārtota secības projekti ir galvenie mikrobu genomikas uzlabošanai, ļaujot pabeigt un salīdzināt mikrobu genomus. Tas atvieglo fermentācijas inženieriju, rūpniecības procesu optimizāciju un sekundārā metabolisma ceļu izpēti. Turklāt sēnīšu un baktēriju atkārtota secība ir būtiska, lai izprastu vides adaptāciju, optimizētu celmus un atklātu ģenētiskās evolūcijas dinamiku, ar plašu ietekmi uz medicīnu, lauksaimniecību un vides zinātni.
Pakalpojumu priekšrocības
●Bioinformātiskā analīze ietver variantu zvanu:Sniedzot funkcionālu ieskatu atkārtotu genomos.
● Plaša kompetence: Ar tūkstošiem mikrobu atkārtotas secības projektu, kas tiek veikti katru gadu, mēs sniedzam vairāk nekā desmit gadu pieredzi, augsti kvalificētu analīzes komandu, visaptverošu saturu un lielisku atbalstu pēc pārdošanas.
●Pēcpārdošanas atbalsts:Mūsu apņemšanās pārsniedz projekta pabeigšanu ar 3 mēnešu pēcpārdošanas dienesta periodu. Šajā laikā mēs piedāvājam projektu turpinājumu, palīdzības novēršanu un Q&A sesijas, lai risinātu visus rezultātus saistītos jautājumus.
Pakalpojumu specifikācijas
| Sekvencēšanas platforma | Sekvencēšanas stratēģija | Ieteicamie dati | Kvalitātes kontrole |
| Illumina Novaseq | PE150 | 100x dziļums | Q30≥85% |
Parauga prasības
| Koncentrācija (ng/µl) | Kopējā summa (ng) | Tilpums (µL) |
| ≥1 | ≥60 | ≥20 |
Baktērijas: ≥1x107 šūnās
Vienšūnu sēnes: ≥5x106-1x107 šūnās
Makro sēnes: ≥4g
Servisa darba plūsma
Paraugu piegāde
Bibliotēkas celtniecība
Sekvencēšana
Datu analīze
Pēcpārdošanas pakalpojumi
Ietver šādu analīzi:
- Datu kvalitātes kontroles secība
- Saskaņošana ar atsauces genomu
- Varianta zvana: SNP un Indel
- Varianta anotācija
Varianta zvana: SNP tipi
Variantu izsaukums: Indel garuma sadalījums
Izpētiet sasniegumus, ko veicina BMKGENE mikrobu genoma atkārtotas secības pakalpojumi, izmantojot izstrādātu publikāciju kolekciju.
Jia, Y. et al. (2023) “Apvienojot transkriptu un veselu genoma atkārtotu secību, lai ekrāniski izturētu izturību pret kviešu punduriem”,Starptautiskais molekulāro zinātņu žurnāls, 24 (24). doi: 10.3390/ijms242417356.
Jiang, M. et al. (2023) “Ampicilīna kontrolēta glikozes metabolisms manipulē ar pāreju no tolerances uz izturību baktērijās”,Zinātnes sasniegumi, 9 (10). doi: 10.1126/sciadv.ade8582/Suppl_file/sciadv.ade8582_s.pdf.
Yang, M. et al. (2022) 'Aliidiomarina Halalkaliphila sp. Nov. J. Syst. Evol.Mikrobiols, 72, lpp. 5263. DOI: 10.1099/IJSEM.0.005263.
Zhu, Z., Wu, R. un Wang, G.-H. (2024) “Staphylococcus nepalensis ZZ-2023A genoma secība, izolēta no Nasonia Vitripennis”,Mikrobioloģijas resursu paziņojumiApvidū doi: 10.1128/mra.00802-23.
