-
ATAC-seq un RNS-seq integrēšana, lai atklātu gēnu ekspresijas regulējošos mehānismus
ATAC-seq un RNS-seq integrēšana, lai atklātu gēnu ekspresijas regulēšanas mehānismus no gēnu ekspresijas līdz gēnu regulācijai. Izpratne par to, kā mainās gēnu ekspresija dažādos bioloģiskos apstākļos, ir mūsdienu genomikas pamatmērķis. RNS sekvencēšana (RNS-seq) sniedz jaudu...Lasīt vairāk -
Multi-omikas pielietojumi biotehnoloģijā: no bioloģiskiem atklājumiem līdz inženiertehniskiem risinājumiem
Multi-omikas pielietojumi biotehnoloģijā: no bioloģiskiem atklājumiem līdz inženiertehniskiem risinājumiem. Biotehnoloģija izmanto dzīvus organismus, šūnas, bioloģiskās kopienas un biomolekulas, lai izstrādātu vērtīgus produktus, attīstītu tehnoloģijas un risinātu rūpnieciskās, vides un veselības problēmas...Lasīt vairāk -
SLAF-seq: rīks ģenētiskās variācijas atklāšanai dažādās populācijās
SLAF-seq: elastīga pieeja populācijas mēroga ģenētiskajiem pētījumiem. Kas ir SLAF-seq? Specifiskā lokusa amplificēto fragmentu sekvencēšana (SLAF-seq) ir samazinātas reprezentācijas genoma sekvencēšanas metode, ko izmanto, lai atklātu ģenētiskos marķierus visā genomā, neprasot atsauces genomu...Lasīt vairāk -
Augu īpašību atklāšana, izmantojot epigenomiku poliploīdu kultūraugu selekcijā
Augu īpašību atklāšana, izmantojot epigenomiku poliploīdu kultūraugu selekcijā 1. Ievads: Poliploīdu paradokss un ārpus DNS sekvencēm Daudzas no pasaules svarīgākajām kultūrām, tostarp maizes kvieši (Triticum aestivum), kokvilna (Gossypium hirsutum), rapsis (Brassica napus) un kartupeļi (Solanum t...Lasīt vairāk -
Atsauces genoma aizspriedumi: kāpēc ir svarīgi izvēlēties pareizo atsauces genomu
Atsauces genoma neobjektivitāte: kāpēc ir svarīgi izvēlēties pareizo atsauces genomu Neatkarīgi no tā, vai veicat pilna genoma sekvencēšanu (WGS), RNS sekvencēšanu (RNS-seq) vai samazinātas reprezentācijas sekvencēšanu, piemēram, SLAF-seq, viens no pirmajiem datu analīzes soļiem ir sekvencēšanas nolasījumu saskaņošana ar atsauces genomu...Lasīt vairāk -
Omikas stratēģijas ūdensdzīvnieku pētījumos
Omikas stratēģijas ūdensdzīvnieku pētījumos Ūdensdzīvnieki ietver zivis, gliemenes, vēžveidīgos, bentosus bezmugurkaulniekus un jūras mugurkaulniekus. Tiem raksturīga ievērojama sugu daudzveidība, unikālas genoma iezīmes un spēcīga fenotipiskā plastiskums, reaģējot uz vides izmaiņām...Lasīt vairāk -
No marķieru gēniem līdz visas kopienas DNS: visaptverošs amplikona un bise metagenomiskās sekvencēšanas salīdzinājums
No marķiergēniem līdz visas kopienas DNS: visaptverošs amplikona un bise metagenomiskās sekvencēšanas salīdzinājums. Pētījumi par mikrobu kopienām nodrošina pamatu slēptu mijiedarbību atklāšanai augsnē, ūdenī, zarnās un citās vides ekosistēmās. Lai atšifrētu...Lasīt vairāk -
Epigenetika reāllaikā: RNS modifikāciju atklāšana ar nanoporu tiešo sekvencēšanu
Epigenetika reāllaikā: RNS modifikāciju atklāšana ar nanoporu tiešo sekvencēšanu. Lai pilnībā izprastu šūnu funkciju, attīstību un slimības progresēšanu, mums jāskatās tālāk par pašu DNS sekvenci un jāizpēta papildu bioloģiskās informācijas slāņi, kas regulē gēnu aktivitāti...Lasīt vairāk -
Taksonomijas, funkcijas un metabolisma sasaiste, izmantojot multiomikas integrāciju
Taksonomijas, funkcijas un metabolisma sasaiste, izmantojot multiomikas integrāciju. Pieaugošā vairāku omikas tehnoloģiju izmantošana slimību un vides sistēmu pētīšanā ir radījusi pieaugošu nepieciešamību integrēt datu kopas dažādos bioloģijas līmeņos. Mikrobiomu pētījumos šī integrācija...Lasīt vairāk -
No parauga līdz secībai: Labākā prakse vides paraugu sagatavošanai mikrobiomu pētījumos
No parauga līdz secībai: labākā prakse vides paraugu sagatavošanai mikrobiomu pētījumos. Vides mikrobioloģija ir mainījusi mūsu izpratni par mikrobu ekosistēmām — no augsnes un ūdens līdz cilvēka ķermenim. Tomēr mikrobiomu pētījumu labākajā praksē viena patiesība paliek nemainīga...Lasīt vairāk -
Gadījuma izpēte: Lielākā un ģenētiski daudzveidīgākā augstienes kokvilnas grafa pangenoma izveide
Gadījuma izpēte: Lielākā un ģenētiski daudzveidīgākā augstienes kokvilnas grafa pangenoma izveide 2026. gadā. Agrīns izrāviens: Ir izveidots pasaulē lielākais un ģenētiski daudzveidīgākais augstienes kokvilnas (Gossypium hirsutum) grafa pangenoms. BMKGENE sadarbojās genoma sekvencēšanā (PacBio...Lasīt vairāk -
Īpaši ilga lasīšanas sekvencēšana: galvenais instruments augstas kvalitātes T2T genoma montāžai
Īpaši gara lasīšanas sekvencēšana: galvenais instruments augstas kvalitātes genoma montāžai T2T līmenī. Nepārtraukta references genomu attīstība. References genomi kalpo par pamata mugurkaulu genomikas un multi-omikas datu analīzei, un augstas kvalitātes references genomi ir izšķiroši padziļinātai sugu izpētei...Lasīt vairāk -
Kā uzlabota hWGS/WES analīze atbalsta precīzās onkoloģijas pētījumus
Kā uzlabota hWGS/WES analīze atbalsta precīzus onkoloģijas pētījumus Audzēja genomi ir unikāli sarežģīti. Atšķirībā no dzimumšūnu paraugiem, vēža audos var būt somatiskas mutācijas, kopiju skaita izmaiņas, strukturāli pārkārtojumi, klonāla heterogenitāte un atšķirīgas mutāciju pazīmes, kas atspoguļo ...Lasīt vairāk
