BMKMANU S1000 telpiskais transkripts
BMKMANU S1000 telpiskās transkripta tehniskā shēma
BMKMANU S1000 priekšrocības
1) Sub-šūnu izšķirtspēja: katrā uztveršanas apgabalā bija> 2 miljoni telpisku svītrkodu plankumu ar diametru 2,5 µm un 5 µm atstarpi starp plankumu centriem, ļaujot veikt telpisko transkripta analīzi ar sub-šūnu izšķirtspēju (5 µm).
2) Daudzlīmeņu izšķirtspējas analīze: elastīga daudzlīmeņu analīze no 100 μm līdz 5 μm, lai atrisinātu dažādas audu īpašības ar optimālu izšķirtspēju.
3) Visaptveroša transkripta profilēšana: no visa audu priekšmetstikliņa uzņemtos transkriptus var analizēt, neierobežojot mērķa gēnu skaitu un mērķa apgabalu.
Pakalpojuma specifikācijas
| Bibliotēka | Sekvences stratēģija | Ieteicama datu izvade |
| S1000 cDNS bibliotēka | BMKMANU S1000-Illumina PE150 | 60Gb/izlase |
Prasību paraugs
| Paraugs | Numurs | Izmērs | RNS kvalitāte |
| AZT iegultā audu blokāde | 2-3 bloki/ paraugs | Apm.6,8x6,8x6,8 mm3 | NIN ≥7 |
Lai iegūtu plašāku informāciju par paraugu sagatavošanas norādījumiem un pakalpojumu darbplūsmu, lūdzu, sazinieties ar aBMKGENE eksperts
Pakalpojuma darba plūsma
Eksperimenta dizains
Paraugu piegāde
Iepriekšeksperiments
Telpiskais svītrkods
Bibliotēkas celtniecība
Secība
Datu analīze
Pēcpārdošanas pakalpojumi
BMKMANU S1000 ģenerētie dati tiek analizēti, izmantojot BMKGENE neatkarīgi izstrādāto programmatūru “BSTMatrix”, tostarp:
1) Gēnu ekspresijas matricas ģenerēšana
2) HE attēlu apstrāde
3) saderīgs ar pakārtoto trešās puses programmatūru analīzei
4) Tiešsaistes “BSTViewer” palīdz iegūt vizualizācijas rezultātus dažādās izšķirtspējās.
1.Punktu klasterizācija
2.Telpiskais sadalījums
Npiezīme: izšķirtspējalīmenis=13 (100 µm, pa kreisi); 7 (50 µm, pa labi)
3.Marķiera izteiksmes pārpilnības klasterizācijas siltuma karte
4.Starpizlases datu analīze
