CircRNS sekvencēšana-illumina
Funkcijas
● RRNS samazināšanās, kam seko virziena bibliotēkas sagatavošana, nodrošinot ar virknei specifiskus secības datus.
● Bioinformatiskā darbplūsma ļauj circRNS prognozēt un ekspresijas kvantitatīvu noteikšanu
Pakalpojumu priekšrocības
●Visaptverošākas RNS bibliotēkas:Mēs izmantojam rRNS samazināšanos, nevis lineāro RNS samazināšanos pirms bibliotēkas, nodrošinot, ka sekvencēšanas dati ietver ne tikai circRNS, bet arī mRNS un lncRNS, ļaujot šo datu kopu kopīgu analīzi, kas nodrošina kopīgu analīzi
●Konkurences endogēno RNS (CERNA) tīklu izvēles analīze: Sniedzot dziļāku ieskatu šūnu regulēšanas mehānismos
●Plaša kompetence: Tā kā BMKGENE tiek apstrādāta vairāk nekā 20 000 paraugu, kas aptver dažādus paraugu veidus un lncRNS projektus, mūsu komanda katram projektam sniedz daudz pieredzes.
●Stingra kvalitātes kontrole: Mēs ieviešam galvenos vadības punktus visos posmos, sākot no parauga un bibliotēkas sagatavošanas līdz secībai un bioinformātikai. Šī rūpīgā uzraudzība nodrošina pastāvīgi augstas kvalitātes rezultātu piegādi.
● Pēcpārdošanas atbalsts: Mūsu apņemšanās pārsniedz projekta pabeigšanu ar 3 mēnešu pēcpārdošanas dienesta periodu. Šajā laikā mēs piedāvājam projektu turpinājumu, palīdzības novēršanu un Q&A sesijas, lai risinātu visus rezultātus saistītos jautājumus.
Parauga prasības un piegāde
| Bibliotēka | Platforma | Ieteicamie dati | Data QC |
| rRNS noplicināta virziena bibliotēka | Illumina PE150 | 16-20 GB | Q30≥85% |
Parauga prasības:
Nukleotīdi:
| Konc. (Ng/μl) | Daudzums (μg) | Tīrība | Godīgums |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280 = 1,7–2,5 OD260/230 = 0,5–2,5 Ierobežots vai bez olbaltumvielu vai DNS piesārņojuma, kas parādīts uz gēla. | Rin≥6,0; 5,0 ≥28s/18S≥1,0; ierobežots vai nav sākotnējais augstums |
● Augi:
Sakne, kāts vai ziedlapa: 450 mg
Lapa vai sēkla: 300 mg
Augļi: 1,2 g
● Dzīvnieks:
Sirds vai zarnas: 450 mg
Iekšējo orgeru vai smadzenes: 240 mg
Muskulis: 600 mg
Kauli, mati vai āda: 1,5 g
● Piesaista:
Kukaiņi: 9g
Crustacea: 450 mg
● pilnas asinis:2 caurules
● šūnas: 106 šūnās
● serums un plazma: 6 ml
Ieteicamā parauga piegāde
Konteiners: 2 ml centrifūgas caurule (nav ieteicams alvas folija)
Parauga marķēšana: grupa+replicate, piemēram, A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Sūtījums:
1. Sausais ledus: Paraugi jāiesaiņo maisos un jāapglabā sausā ledus.
2. RNASTABLĒTĀS CEĻAS: RNS paraugus var žāvēt RNS stabilizācijas caurulē (piemēram, RNastable®) un nosūtīt istabas temperatūrā.
Servisa darba plūsma
Eksperimenta dizains
Paraugu piegāde
RNS ekstrakcija
Bibliotēkas celtniecība
Sekvencēšana
Datu analīze
Pēcpārdošanas pakalpojumi
Bioinformātika
CircRNS prognozēšana: hromosomu sadalījums
Diferencēti izteiktas circRNS - vulkāna zemes gabals
Diferenciāli izteiktas circRNS - hierarhiska klasterizācija
CircRNS saimnieka gēnu funkcionālā bagātināšana
Izpētiet pētījumu sasniegumus, ko atvieglo Bmkgene circRNS sekvencēšanas pakalpojumi, izmantojot kuratoru publikāciju kolekciju.
Wang, X. et al. (2021) “CPSF4 regulē circRNS veidošanos un mikroRNS mediētu gēnu klusēšanu hepatocelulārā karcinomā”, Onkogēns 2021 40:25, 40 (25), 433. - 4351. Lpp. doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Xia, K. et al. (2023) “X OO reaģējošais transkripts atklāj apļveida RNS133 lomu slimību rezistencē, regulējot osaraba ekspresiju rīsos”, fitopatoloģijas pētījums, 5 (1), 1.-14. Lpp. doi: 10.1186/s42483-023-00188-8/skaitļi/6.
Y, H. et al. (2023) “CPSF3 modulē apļveida un lineāro transkriptu līdzsvaru hepatocelulārā karcinomā”. doi: 10.21203/Rs.3.RS-2418311/V1.
Džan, Y. et al. (2023) “CircRNS visaptverošs novērtējums cirozes kardiomiopātijā pirms un pēc aknu transplantācijas”, Starptautiskā imūnharmakoloģija, 114, 1. lpp. 109495. doi: 10.1016/j.intimp.2022.109495.
