● Poli-mRNS uztveršana pirms bibliotēkas sagatavošanas
● Papildu virziena mRNS bibliotēkas sagatavošana, lai iegūtu virknei specifiskus sekvencēšanas datus
● Gēnu ekspresijas un transkripta struktūras bioinformātiskā analīze
●Plaša pieredzeMūsu komanda BMKgene ir apstrādājusi vairāk nekā 600 000 paraugu, aptverot dažādus paraugu veidus, piemēram, šūnu kultūras, audus un ķermeņa šķidrumus. Katrā projektā mēs izmantojam bagātīgu pieredzi un esam veiksmīgi pabeiguši vairāk nekā 100 000 mRNS sekvencēšanas projektu dažādās pētniecības jomās.
●Stingra kvalitātes kontroleMēs ieviešam pamata kontroles punktus visos posmos, sākot no paraugu un bibliotēkas sagatavošanas līdz sekvencēšanai un bioinformātikai. Šī rūpīgā uzraudzība nodrošina nemainīgi augstas kvalitātes rezultātus, apliecinot, ka jūsu projekts ir uzticamās rokās.
●Visaptveroša anotācijaMēs izmantojam vairākas datubāzes, lai funkcionāli anotētu diferenciāli ekspresētos gēnus (DEG) un veiktu atbilstošas bagātināšanas analīzes. Šī visaptverošā pieeja sniedz ieskatu šūnu un molekulārajos procesos, kas ir transkriptomas atbildes pamatā, nodrošinot, ka esat pilnībā informēts par sava projekta rezultātiem.
●Pēcpārdošanas atbalstsMūsu saistības sniedzas tālāk par projekta pabeigšanu, nodrošinot 3 mēnešu pēcpārdošanas servisa periodu. Šajā laikā mēs piedāvājam projekta uzraudzību, palīdzību problēmu novēršanā un jautājumu un atbilžu sesijas, lai risinātu visus ar rezultātiem saistītos jautājumus.
| Bibliotēka | Sekvencēšanas stratēģija | Ieteicamie dati | Kvalitātes kontrole |
| Bagātināts ar poli A | Illumina PE150 DNBSEQ-T7 | 6–10 Gb | Q30≥85% |
Nukleotīdi:
| Koncentrācija (ng/μl) | Daudzums (μg) | Tīrība | Godprātība | |
| Standarta bibliotēka | ≥ 10 | ≥ 0,2 | OD260/280 = 1,7–2,5 OD260/230 = 0,5–2,5 Gelā redzams ierobežots vai nav redzams olbaltumvielu vai DNS piesārņojums. | Augiem: RIN≥4,0; Dzīvniekiem: RIN≥4,5; 5,0 ≥ 28S/18S ≥ 1,0; ierobežots vai nav bāzes līnijas pacēluma |
| Virziena bibliotēka | ≥ 10 | ≥ 0,2 | OD260/280 = 1,7–2,5 OD260/230 = 0,5–2,5 Gelā redzams ierobežots vai nav redzams olbaltumvielu vai DNS piesārņojums. | Augiem: RIN≥4,0; Dzīvniekiem: RIN≥4,5; 5,0 ≥ 28S/18S ≥ 1,0; ierobežots vai nav bāzes līnijas pacēluma |
| Augi | Dzīvnieks | Posmkāji | Pilnas asinis | Šūnas |
| Sakne, stublājs vai ziedlapa: 450 mg Lapa vai sēkla: 300 mg Augļi: 1,2 g | Sirds vai zarnas: 300 mg Iekšējie orgāni vai smadzenes: 240 mg Muskuļi: 450 mg Kauli, mati vai āda: 1 g | Kukaiņi: 6 g Vēžveidīgie: 300 mg | 1 tūbiņa | 106 šūnas |
Trauks: 2 ml centrifūgas mēģene (alvas folija nav ieteicama)
Parauga marķēšana: Grupēt+atkārtot, piemēram, A1, A2, A3; B1, B2, B3... ...
Sūtījums:
1. Sausais ledus: paraugi jāiepako maisos un jāaprok sausajā ledū.
2. RNS galda mēģenes: RNS paraugus var žāvēt RNS stabilizācijas mēģenē (piemēram, RNAstable®) un transportēt istabas temperatūrā.
Lai saņemtu informāciju par mūsu produktiem vai cenu sarakstu, lūdzu, atstājiet savu e-pasta adresi.
Mēs sazināsimies 24 stundu laikā.
Bioinformātika
Eikariotu mRNS sekvencēšanas analīzes darbplūsma
Bioinformātika
ØNeapstrādātu datu kvalitātes kontrole
ØAtsauces genoma izlīdzināšana
ØTranskripta struktūras analīze
ØIzteiksmes kvantifikācija
ØDiferenciālās izteiksmes analīze
ØFunkciju anotācija un bagātināšana
Atsauces genoma izlīdzināšana
Datu piesātinājums
Paraugu korelācija un bioloģisko atkārtojumu novērtēšana
Diferenciāli ekspresēti gēni (DEG)
DEG funkcionālā anotācija
DEG funkcionālā bagātināšana
Iepazīstieties ar BMKGene eikariotu NGS mRNS sekvencēšanas pakalpojumu sniegtajiem sasniegumiem, izmantojot atlasītu publikāciju kolekciju.
Huang, L. et al. (2023) “Triklozāns un triklokarbāns vājina zelta zivtiņu ožas spējas, ierobežojot smaržvielu atpazīšanu, traucējot ožas signālu pārraidi un traucējot ožas informācijas apstrādi”, Water Research, 233, 119736. lpp. doi: 10.1016/J.WATRES.2023.119736.
Jia, LJ et al. (2023) “Aspergillus fumigatus ietekmē cilvēka p11, lai novirzītu sēnītes saturošas fagosomas uz nedegradējošu ceļu”, Cell Host & Microbe, 31(3), 373.–388. lpp. e10. doi: 10.1016/J.CHOM.2023.02.002.
Džins, K. u.c. (2022) “TCP transkripcijas faktori, kas iesaistīti bambusa (Dendrocalamus latiflorus Munro) dzinumu attīstībā”, Frontiers in Plant Science, 13, 884443. lpp. doi: 10.3389/FPLS.2022.884443/BIBTEX.
Wen, X. et al. (2022) “Chrysanthemum lavandulifolium genoms un molekulārais mehānisms, kas ir dažādu kapitulu tipu pamatā”, Horticulture Research, 9. doi: 10.1093/HR/UHAB022.
Džans, Judzje u.c. (2023) “Kaskādes nanoreaktors sonodinamiskās terapijas uzlabošanai kolorektālā vēža gadījumā, izmantojot sinerģisku ROS palielināšanu un autofāgijas bloķēšanu”, Nano Today, 49, 101798. lpp. doi: 10.1016/J.NANTOD.2023.101798.