Illumina un BGI
Iespējas
●Platformas:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten un BGI-DNB-T7
●Secības režīmi:PE50, PE100, PE150, PE250
●Bibliotēku kvalitātes kontrole pirms secības noteikšanas
●Secības datu piegāde un kvalitātes kontrole:QC ziņojuma un neapstrādātu datu piegāde fastq formātā pēc Q30 nolasījumu demultipleksēšanas un filtrēšanas.
Pakalpojuma priekšrocības
●Sekvencēšanas pakalpojumu daudzpusība:klients var izvēlēties secību pēc joslas, plūsmas šūnas vai datu apjoma.
●Platformu daudzpusība:DNB bibliotēkas var pārsūtīt uz Illumina platformām
●Plaša pieredze Illumina sekvencēšanas platformā:ar tūkstošiem slēgtu projektu ar dažādām sugām.
●Secības kvalitātes kontroles ziņojuma piegāde:ar kvalitātes metriku, datu precizitāti un sekvencēšanas projekta vispārējo veiktspēju.
●Nobriedušu sekvencēšanas process:ar īsu izpildes laiku.
●Stingra kvalitātes kontrole: mēs ieviešam stingras kvalitātes kontroles prasības, lai garantētu nemainīgi augstas kvalitātes rezultātu piegādi.
Prasību paraugs*
Daļēja joslu secība
| Datu apjoms (X) | Koncentrācija (qPCR/nM) | Skaļums |
| X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
| 50 Gb ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 20 μl |
| X ≥ 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 20 μl |
Viena josla (Illumina)
| Platforma | Koncentrācija (qPCR/nM) | Skaļums |
| HiSeq X Ten | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
| NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
| NovaSeq X | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
| BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
Papildus koncentrācijai un kopējam daudzumam ir nepieciešams arī piemērots maksimuma modelis.
Lūdzu, sazinieties ar mums, ja jūsu paraugi neatbilst izejmateriāla prasībām.
Pakalpojuma darbplūsma
Bibliotēkas kvalitātes kontrole
Secība
Datu kvalitātes kontrole
Projekta piegāde
Bibliotēkas kvalitātes kontroles ziņojums
Pirms secības, bibliotēkas apjoma un sadrumstalotības novērtēšanas tiek sniegts ziņojums par bibliotēkas kvalitāti.
Secības kvalitātes kontroles ziņojums
1. tabula. Statistika par secības datiem.
| ID paraugs | BMKID | Neapstrādāti lasījumi | Neapstrādāti dati (bp) | Tīri lasījumi (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22 870 120 | 6 861 036 000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14 717 867 | 4 415 360 100 | 96.00 | 98.95 | 93,89 | 37.08 |
1. attēls. Kvalitātes sadalījums pa nolasījumiem katrā paraugā
2. attēls. Bāzes satura sadalījums
3. attēls. Nolasītā satura sadalījums secības datos
