条形reklāmkarogs-03

Produkti

Illumina iepriekš sagatavotas bibliotēkas

Illumina sekvencēšanas tehnoloģija, kuras pamatā ir sekvencēšana ar sintēzi (SBS), ir globāli atzīta NGS inovācija, kas ir atbildīga par vairāk nekā 90% no pasaules sekvencēšanas datiem. SBS princips ietver fluorescenti iezīmētu atgriezenisku terminatoru attēlveidošanu, pievienojot katru dNTP, un pēc tam tos sašķeļot, lai varētu iekļaut nākamo bāzi. Tā kā katrā sekvencēšanas ciklā ir visi četri ar atgriezenisko terminatoru saistītie dNTP, dabiskā konkurence samazina iekļaušanas neobjektivitāti. Šī daudzpusīgā tehnoloģija atbalsta gan viena lasījuma, gan pārotu galu bibliotēkas, kas piemērotas dažādiem genomikas pielietojumiem. Illumina sekvencēšanas augstās caurlaidspējas iespējas un precizitāte novieto to kā stūrakmeni genomikas pētījumos, dodot zinātniekiem iespēju atklāt genomu sarežģījumus ar nepārspējamu detalizāciju un efektivitāti.

Mūsu iepriekš sagatavoto bibliotēku sekvencēšanas pakalpojums ļauj klientiem sagatavot sekvencēšanas bibliotēkas no dažādiem avotiem (mRNS, pilna genoma, amplikona, 10x bibliotēkām u.c.). Pēc tam šīs bibliotēkas var nosūtīt uz mūsu sekvencēšanas centriem kvalitātes kontrolei un sekvencēšanai Illumina platformās.


Pakalpojuma informācija

Demonstrācijas rezultāts

Funkcijas

Platformas:Illumina NovaSeq 6000 un NovaSeq X Plus

Sekvencēšanas režīmi:PE150 un PE250

Bibliotēku kvalitātes kontrole pirms sekvencēšanas

Sekvencēšanas datu kvalitātes kontrole un piegāde:Kvalitātes kontroles ziņojuma un neapstrādātu datu piegāde fastq formātā pēc Q30 nolasījumu demultipleksēšanas un filtrēšanas

 

 

Pakalpojuma priekšrocības

Sekvencēšanas pakalpojumu daudzpusība:Klients var izvēlēties sekvencēšanu pēc joslas, plūsmas šūnas vai nepieciešamā datu apjoma (daļēja joslu sekvencēšana).

Plaša pieredze darbā ar Illumina sekvencēšanas platformu:ar tūkstošiem slēgtu projektu ar dažādām sugām. 

Sekvencēšanas kvalitātes kontroles ziņojuma piegāde:ar kvalitātes rādītājiem, datu precizitāti un sekvencēšanas projekta kopējo sniegumu.

Nobriedis sekvencēšanas process:ar īsu apgrozījuma laiku.

Stingra kvalitātes kontroleMēs ieviešam stingras kvalitātes kontroles prasības, lai garantētu nemainīgi augstas kvalitātes rezultātu piegādi.

 

 

Parauga platformas

Platforma

Plūsmas šūna

Sekvencēšanas režīms

Vienība

Paredzamā izlaide

NovaSeq X

10B (8 joslas)

PE150

Viena josla

Daļēja josla

375 GB / josla

25B (8 joslas)

PE150

Viena josla

Daļēja josla

1000 Gb/josla

NovaSeq 6000

SP plūsmas šūna (2 joslas)

PE250

Plūsmas šūna

Viena josla

Daļēja josla

325–400 miljoni nolasījumu / josla

S4 plūsmas šūna (4 joslas)

PE150

Plūsmas šūna

Viena josla

Daļēja josla

~800 Gb / josla

Parauga prasības

 

Datu apjoms (X)

Koncentrācija (qPCR/nM)

Apjoms

Daļēja joslu secība

 

 

X ≤ 10 Gb

≥ 1 nM

≥ 25 μl

10 GB < X ≤ 50 GB

≥ 2 nM

≥ 25 μl

50 GB < X ≤ 100 GB

≥ 3 nM

≥ 25 μl

X > 100 GB

≥ 4 nM

≥ 25 μl

Joslu secība

Uz joslu

≥ 1,5 nM / bibliotēkas fonds

≥ 25 μl / bibliotēkas kopums

Papildus koncentrācijai un kopējam daudzumam ir nepieciešams arī piemērots pīķu modelis.

Piezīme. Zemas daudzveidības bibliotēku joslu sekvencēšanai ir nepieciešama PhiX pievienošana, lai nodrošinātu stabilu bāzu noteikšanu.

Iesakām iesniegt iepriekš apkopotas bibliotēkas kā paraugus. Ja jums ir nepieciešams, lai BMKGENE veiktu bibliotēku apvienošanu, lūdzu, skatiet

bibliotēkas prasības daļējai joslu secībai.

Bibliotēkas lielums (Peak karte)

Galvenajam pīķim jābūt 300–450 bp robežās.
Bibliotēkām jābūt vienam galvenajam pīķim, bez adaptera piesārņojuma un bez primeru dimēriem.

Lūdzu, sazinieties ar mums, ja jūsu paraugi neatbilst izejmateriālu prasībām.

Pakalpojumu darbplūsma

parauga sagatavošana

Bibliotēkas kvalitātes kontrole

Sekvencēšana

Sekvencēšana

Datu analīze

Datu kvalitātes kontrole

Parauga kvalitātes kontrole

Projekta piegāde


  • Iepriekšējais:
  • Tālāk:

  • Bibliotēkas kvalitātes kontroles ziņojums

    Pirms sekvencēšanas, bibliotēkas apjoma novērtēšanas un fragmentācijas tiek sniegts ziņojums par bibliotēkas kvalitāti.

     

    Sekvencēšanas kvalitātes kontroles ziņojums

     

    1. tabula. Sekvencēšanas datu statistika.

    Parauga ID

    BMKID

    Neapstrādāti lasījumi

    Neapstrādāti dati (bp)

    Tīri nolasījumi (%)

    Q20 (%)

    Q30 (%)

    GC (%)

    C_01

    BMK_01

    22 870 120

    6 861 036 000

    96,48

    99,14

    94,85

    36,67

    C_02

    BMK_02

    14 717 867

    4 415 360 100

    96,00

    98,95

    93,89

    37.08

    1. attēls. Kvalitātes sadalījums pa nolasījumiem katrā izlasē

    A9

    2. attēls. Pamata satura sadalījums

    A10

    3. attēls. Nolasītā satura sadalījums sekvencēšanas datos

    A11

     

    saņemt cenu piedāvājumu

    Uzrakstiet savu ziņojumu šeit un nosūtiet to mums

    Nosūtiet mums savu ziņojumu: