Produkti

DNS/RNS sekvencēšana – nanoporu sekvencētājs

DNS/RNS sekvencēšana — nanoporu sekvencēja piedāvātais attēls

ONT sekvencēšana ir vienas molekulas reāllaika elektrisko signālu sekvencēšanas tehnoloģija, kuras pamatā ir nanoporas, katras platformas sekvencēšanas princips ir vienāds.Divpavedienu DNS/RNS saistās ar nanoporu proteīnu, kas iestrādāts bioplēvē un atritinās zem motora proteīna pavada, sprieguma starpības ietekmē no abām bioplēves pusēm DNS/RNS virknes iet cauri nanoporu kanāla proteīnam noteiktā vietā. likme.Dažādu DNS/RNS virknes bāzu ķīmisko īpašību atšķirību dēļ, vienai bāzei vai DNS molekulai izejot cauri nanoporu kanālam, tas izraisīs dažādu elektrisko signālu izmaiņas.Atklājot un atbilstot šiem signāliem, var aprēķināt atbilstošos bāzes tipus un pabeigt secības noteikšanu reāllaikā.

Sazinies ar mums

Sīkāka informācija par pakalpojumu

Demonstrācijas rezultāts

Pakalpojuma informācija Funkcijas

Platforma	Bibliotēkas lielums	Teorētiskā datu ienesīgums (vienā šūnā)	Vienas bāzes precizitāte	Lietojumprogrammas
Nanopore	8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNS-PCR	70–90 Gb/šūna	85-92%	SV izsaukšana, de novo, pilna garuma sekvencēšana, Iso-Seq, gēnu anotācija, DNS metilēšanas noteikšana

Pakalpojuma priekšrocības

● Vairāk nekā 5 gadu pieredze PacBio sekvencēšanas platformā ar tūkstošiem slēgtu projektu ar dažādām sugām.
● BMKGENE ir oficiālais Oxford Nanopore partneris ar divu platformu RNS/DNS sertifikātu.
● Ir plaši izplatīti sekvenceru modeļi ar pilnu aprīkojumu un pietiekamu sekvences caurlaidspēju.
● Pamatojoties uz Nanopore platformu, vairāk nekā 10 Denovo dzīvnieku un augu pētījumi ir publicēti starptautiski atzītos žurnālos.

Prasību paraugs

Parauga veids

Summa

Koncentrācija (Qubit®)

Apjoms

Tīrība

Citi

Genomiskā DNS

Atkarīgs no datu prasības

≥20ng/μl

≥15 μl

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1,5；

Skaidrs maksimums pie 260 nm, bez piesārņojuma

Koncentrācija jāmēra ar Qubit un Qubit/Nanopore ≤ 2

Kopējā RNS

≥1,2 μg

≥100μg/μl

≥15 μl

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5；nav piesārņojuma

RIN vērtība ≥7,5

Pakalpojuma darbplūsma

Parauga sagatavošana

Bibliotēkas celtniecība

Secība

Datu analīze

Projekta piegāde

Iepriekšējais: DNS/RNS sekvencēšana – Illumina sekvencētājs

Nākamais: Specifiska lokusa pastiprinātā fragmentu secība (SLAF-Seq)

DNS parauga datu kvalitātes novērtējums

1. tabula. Statistika par tīriem datiem.

BMKID	rawSeqNum	rawSumBase	cleanSeqNum	cleanSumBase	cleanN50Len	cleanN90Len	cleanMeanLen	cleanMaxLen	cleanMeanQual
DNS_BMK01	1 218 239	26.37	1 121 736	25.90	28 014	15 764	23 090	143 181	9