DNBSEQ iepriekš sagatavotas bibliotēkas
Funkcijas
●Platforma:MGI-DNBSEQ-T7
●Sekvencēšanas režīmi:PE150
●Illumina bibliotēku pārsūtīšana uzMGI:ļaujot sekvencēt lielus datu apjomus par zemām izmaksām.
●Bibliotēku kvalitātes kontrole pirms sekvencēšanas.
●Sekvencēšanas datu kvalitātes kontrole un piegāde:Kvalitātes kontroles ziņojuma un neapstrādātu datu piegāde fastq formātā pēc Q30 nolasījumu demultipleksēšanas un filtrēšanas.
Priekšrocības
●Sekvencēšanas pakalpojumu daudzpusība:Klients var izvēlēties secību pēc joslas vai datu apjoma.
●Augsta datu izvade:1500 Gb/josla
●Sekvencēšanas kvalitātes kontroles ziņojuma piegāde:ar kvalitātes rādītājiem, datu precizitāti un sekvencēšanas projekta kopējo veiktspēju.
●Nobriedis sekvencēšanas process:ar īsu apgrozījuma laiku.
●Stingra kvalitātes kontroleMēs ieviešam stingras kvalitātes kontroles prasības, lai garantētu nemainīgi augstas kvalitātes rezultātu piegādi.
Parauga prasības
| Datu apjoms (X) | Koncentrācija (qPCR/nM) | Apjoms | |
| Daļēja josla
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1nM | ≥ 25 μl |
| 10 GB < X ≤ 50 GB | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 GB < X ≤ 100 GB | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 GB | ≥ 4 nM | ||
| Viena josla | Uz joslu | ≥ 1,5 nM / bibliotēkas fonds | ≥ 25 μl / bibliotēkas fonds |
Papildus koncentrācijai un kopējam daudzumam ir nepieciešams arī piemērots pīķu modelis.
Piezīme. Zemas daudzveidības bibliotēku joslu sekvencēšanai ir nepieciešama PhiX pievienošana, lai nodrošinātu stabilu bāzu noteikšanu.
Iesakām iesniegt iepriekš apkopotas bibliotēkas kā paraugus. Ja jums ir nepieciešams, lai BMKGENE veiktu bibliotēku apvienošanu, lūdzu, skatiet
bibliotēkas prasības daļējai joslu secībai.
Bibliotēkas lielums (Peak karte)
Galvenajam pīķim jābūt 300–450 bp robežās.
Bibliotēkām jābūt vienam galvenajam pīķim, bez adaptera piesārņojuma un bez primeru dimēriem.
Pakalpojumu darbplūsma
Bibliotēkas kvalitātes kontroles ziņojums
Pirms sekvencēšanas, bibliotēkas apjoma novērtēšanas un fragmentācijas tiek sniegts ziņojums par bibliotēkas kvalitāti.
Sekvencēšanas kvalitātes kontroles ziņojums
1. tabula. Sekvencēšanas datu statistika.
| Parauga ID | BMKID | Neapstrādāti lasījumi | Neapstrādāti dati (bp) | Tīri nolasījumi (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22 870 120 | 6 861 036 000 | 96,48 | 99,14 | 94,85 | 36,67 |
| C_02 | BMK_02 | 14 717 867 | 4 415 360 100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
1. attēls. Kvalitātes sadalījums pa nolasījumiem katrā izlasē
2. attēls. Pamata satura sadalījums
3. attēls. Nolasītā satura sadalījums sekvencēšanas datos
