Evolūcijas ģenētika

Evolucionārie ģenētiskie pētījumi tiecas izprast populāciju evolūcijas trajektoriju, izmantojot polimorfisma informāciju genoma sekvencēs. BMKCloud Evolutionary Genetics cauruļvads ir izstrādāts, lai analizētu WGS jeb specifiskā lokusa amplificētā fragmenta (SLAF) datus no lielām populācijām. Pēc neapstrādāto datu kvalitātes kontroles nolasījumi tiek saskaņoti ar atsauces genomu un tiek izsaukti varianti. Cauruļvads ietver filoģenētiskā koka konstruēšanu, galveno komponentu analīzi (PCA), populācijas struktūras analīzi, saiknes nelīdzsvarotības analīzi (LD), selektīvās slaucīšanas analīzi un kandidātu gēnu analīzi.