Produkti

Sēnīšu genoms

Biomarķieru tehnoloģijas nodrošina sēnīšu genoma aptauju, smalku genomu un penes pilnīgu genomu atkarībā no konkrētā pētījuma mērķa.Genoma sekvencēšanu, montāžu un funkcionālo anotāciju var panākt, apvienojot nākamās paaudzes sekvencēšanu + trešās paaudzes sekvencēšanu, lai panāktu augsta līmeņa genoma montāžu.Hi-C tehnoloģiju var izmantot arī, lai atvieglotu genoma montāžu hromosomu līmenī.

Platforma:PacBio turpinājums II

Nanopore PromethION P48

Illumina NovaSeq platforma

Sazinies ar mums

Sīkāka informācija par pakalpojumu

Demonstrācijas rezultāti

Pakalpojuma priekšrocības

● Dažādiem pētniecības mērķiem ir pieejamas vairākas secības noteikšanas stratēģijas

● Liela pieredze sēņu genomu komplektēšanā ar vairāk nekā 10 000 samontētu pene-pilnu genomu.

● Profesionāla pēcpārdošanas tehniskā atbalsta komanda, kas atbilst specifiskākām pētniecības vajadzībām.

Pakalpojuma specifikācijas

apkalpošana	Sekvences stratēģija	Kvalitāte garantēta	Paredzamais apgrozības laiks
Sēnīšu smalkā karte	Illumina 50X+Nanopore 100X	Contig N50≥2 Mb	35 darba dienas
Sēnīšu smalkā karte	PacBio HiFi 30X	Contig N50≥2 Mb	35 darba dienas
Sēnīšu pene-pilnīga karte	Illumina 50X+Nanopore 100X (Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X	Hromosomu noenkurošanas attiecība >90%	45 darba dienas

Bioinformātikas analīzes

● Neapstrādātu datu kvalitātes kontrole

● Genoma montāža

● Genoma komponentu analīze

● Gēnu funkcijas anotācija

● Salīdzinošā genoma analīze

Prasību paraugs un piegāde

Prasību paraugs:

PriekšDNS ekstrakti:

Parauga veids	Summa	Koncentrēšanās	Tīrība
DNS ekstrakti	＞ 1,2 μg	＞ 20 ng/μl	OD260/280= 1,6-2,5

Audu paraugiem:

Parauga veids

Ieteicamā paraugu apstrāde

Paraugu uzglabāšana un nosūtīšana

Vienšūnu sēne

Novērojiet raugu mikroskopā un savāciet to eksponenciālajā fāzē

Pārnes kultūru (kas satur aptuveni 3-4,5e9 šūnas) 1,5 vai 2 ml eppendorfā.(Palieciet uz ledus)

Centrifugējiet mēģeni 1 minūti pie 14000 g, lai savāktu baktērijas un uzmanīgi noņemtu supernatantu

Noslēdziet mēģeni un sasaldējiet baktērijas šķidrā slāpeklī vismaz 1-3 stundas.Uzglabājiet cauruli -80 ℃ ledusskapī.

Sasaldējiet paraugus šķidrā slāpeklī 3-4 stundas un uzglabājiet šķidrā slāpeklī vai -80 grādos līdz ilgstošai rezervēšanai.Nepieciešama paraugu piegāde ar sauso ledu.

Makro sēne

Ieteicami audi aktīvas augšanas fāzē.

Noskalojiet audus ar endotoksīnu nesaturošu ūdeni, pēc tam 70% etonālu.

Saglabājiet paraugu krio-mēģenēs.