条形reklāmkarogs-03

Produkti

Cilvēka visa eksoma sekvencēšana

Cilvēka pilna eksoma sekvencēšana (hWES) ir plaši atzīta par izmaksu ziņā efektīvu un spēcīgu sekvencēšanas metodi slimību izraisošu mutāciju noteikšanai. Lai gan eksoni veido tikai aptuveni 1,7% no visa genoma, tiem ir izšķiroša nozīme, tieši atspoguļojot kopējo olbaltumvielu funkciju profilu. Jāatzīmē, ka cilvēka genomā vairāk nekā 85% ar slimībām saistīto mutāciju izpaužas olbaltumvielu kodēšanas reģionos. BMKGENE piedāvā visaptverošu un elastīgu cilvēka pilna eksoma sekvencēšanas pakalpojumu ar divām dažādām eksonu uztveršanas stratēģijām, kas pieejamas dažādu pētniecības mērķu sasniegšanai.


Pakalpojuma informācija

Demonstrācijas rezultāti

Pakalpojuma funkcijas

● Pieejami divi eksoma paneļi, kuru pamatā ir mērķa bagātināšana ar zondēm: Sure Select Human All Exon v6 (Agilent) un xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT).

● Sekvencēšana ar Illumina NovaSeq.

● Bioinformātikas process, kas vērsts uz slimību vai audzēju analīzi.

Pakalpojuma priekšrocības

Mērķi olbaltumvielu kodēšanas reģions: Uztverot un sekvencējot olbaltumvielu kodējošos reģionus, hWES tiek izmantots, lai atklātu ar olbaltumvielu struktūru saistītus variantus.

Izmaksu ziņā efektīvs:hWES iegūst aptuveni 85% no cilvēka slimībām saistītajām mutācijām no 1% cilvēka genoma.

Augsta precizitāteAr augstu sekvencēšanas dziļumu hWES atvieglo gan bieži sastopamu variantu, gan retu variantu noteikšanu ar frekvenci, kas zemāka par 1%.

Stingra kvalitātes kontroleVisos posmos, sākot no paraugu un bibliotēkas sagatavošanas līdz sekvencēšanai un bioinformātikai, mēs ieviešam piecus galvenos kontroles punktus. Šī rūpīgā uzraudzība nodrošina nemainīgi augstas kvalitātes rezultātu sasniegšanu.

Visaptveroša bioinformātikas analīzeMūsu pētījumu plūsma sniedzas tālāk par atsauces genoma variāciju identificēšanu, jo tajā ir iekļauta uzlabota analīze, kas paredzēta, lai īpaši risinātu pētniecības jautājumus, kas saistīti ar slimību ģenētiskajiem aspektiem vai audzēju analīzi.

Pēcpārdošanas atbalsts:Mūsu apņemšanās sniedzas tālāk par projekta pabeigšanu, piedāvājot 3 mēnešu pēcpārdošanas servisa periodu. Šajā laikā mēs piedāvājam projekta uzraudzību, palīdzību problēmu novēršanā un jautājumu un atbilžu sesijas, lai atbildētu uz visiem ar rezultātiem saistītajiem jautājumiem.

Parauga specifikācijas

Eksonu uztveršanas stratēģija

Sekvencēšanas stratēģija

Ieteicamā datu izvade

Sure Select Human All Exon v6 (Agilent)

vai xGen Exome hibridizācijas panelis v2 (IDT)

 

Illumina NovaSeq PE150

5–10 Gb

Mendeli slimību/reto slimību gadījumā: > 50x

Audzēja paraugiem: ≥ 100x

Parauga prasības

Parauga veids

 

 Summa(Qubit®)

 

Koncentrācija 

Apjoms

 

 

 Tīrība (NanoDrop™)

 

Genomiskā DNS

 

≥ 50 ng
≥ 6 ng/μL
≥ 15 μL
 
OD260/280 = 1,8–2,0
 
nav degradācijas, nav piesārņojuma

 

Bioinformātika

WES_BI darba plūsma_Slimība-01

hWES slimības paraugu bioinformātiskā analīze ietver:

● Sekvencēšanas datu kvalitātes kontrole

● Atsauces genoma saskaņošana

● SNP un InDels identifikācija

● SNP un InDels funkcionālā anotācija

WES_BI darba plūsma_Audzējs-01

Audzēja paraugu bioinformātiskā analīze ietver:

● Sekvencēšanas datu kvalitātes kontrole

● Atsauces genoma saskaņošana

● SNP, InDels un somatisko variāciju identificēšana

● Dzimumšūnu variantu identificēšana

● Mutāciju signatūru analīze

● Dzinēja gēnu identificēšana, pamatojoties uz funkciju pastiprinošām mutācijām

● Mutāciju anotācija zāļu uzņēmības līmenī

● Heterogenitātes analīze – tīrības un ploiditātes aprēķins

Pakalpojumu darba plūsma

parauga piegāde

Parauga piegāde

Pilota eksperiments

DNS ekstrakcija

Bibliotēkas sagatavošana

Bibliotēkas būvniecība

Sekvencēšana

Sekvencēšana

Datu analīze

Datu analīze

数据上传-01

Datu piegāde

Pēcpārdošanas pakalpojumi

Pēcpārdošanas pakalpojumi


  • Iepriekšējais:
  • Tālāk:

  • Datu kvalitātes kontrole – eksomu uztveršanas statistika

     

    wps_doc_22

     

    Variantu identifikācija – InDels

    图片36

    Paplašinātā analīze: kaitīgo SNP/InDels identificēšana un izplatība – Circos diagramma

     

    图片37

    Audzēja analīze: somatisko mutāciju identificēšana un izplatība – Circos diagramma

     

    图片38

     

    Audzēja analīze: klonālās līnijas

     

    图片39

     

    saņemt cenu piedāvājumu

    Uzrakstiet savu ziņojumu šeit un nosūtiet to mums

    Nosūtiet mums savu ziņojumu: