Transkripts ir saikne starp genoma ģenētisko informāciju un bioloģiskās funkcijas proteomu.Transkripcijas līmeņa regulēšana ir vissvarīgākais un visplašāk pētītais organismu regulēšanas veids.Transkripta sekvencēšana var sekvencēt transkriptu jebkurā brīdī vai jebkuros apstākļos ar izšķirtspēju, kas ir precīza vienam nukleotīdam. Tā var dinamiski atspoguļot gēnu transkripcijas līmeni, vienlaikus identificēt un kvantitatīvi noteikt retus un normālus transkriptus un sniegt strukturālo informāciju konkrētu atšifrējumu paraugs.
Pašlaik transkripta sekvencēšanas tehnoloģija ir plaši izmantota agronomijā, medicīnā un citās pētniecības jomās, tostarp dzīvnieku un augu attīstības regulēšanā, vides pielāgošanā, imūnās mijiedarbībā, gēnu lokalizācijā, sugu ģenētiskajā evolūcijā un audzēju un ģenētisko slimību noteikšanā.
