Produkti

Viena kodola RNS sekvencēšana

Atsevišķas šūnas uztveršanas un individuālās bibliotēkas veidošanas tehnikas attīstība apvienojumā ar augstas caurlaidības sekvencēšanu ļauj veikt gēnu ekspresijas pētījumus katrā šūnā.Tas nodrošina dziļāku un pilnīgāku kompleksu šūnu populāciju sistēmas analīzi, kurā lielā mērā tiek novērsta to neviendabīguma maskēšana, ņemot visu šūnu vidējo rādītāju.

Tomēr dažas šūnas nav piemērotas, lai tās veidotu vienas šūnas suspensijā, tāpēc ir nepieciešamas citas parauga sagatavošanas metodes – kodola ekstrakcija no audiem, tas ir, kodolu tieši ekstrahē no audiem vai šūnas un sagatavo viena kodola suspensijā viena kodola suspensijai. šūnu sekvencēšana.

BMK nodrošina 10× Genomics ChromiumTM balstītu vienas šūnas RNS sekvencēšanas pakalpojumu.Šis pakalpojums ir plaši izmantots pētījumos, kas saistīti ar slimībām, piemēram, imūno šūnu diferenciāciju, audzēja neviendabīgumu, audu attīstību utt.

Telpiskā transkripta mikroshēma: 10 × Genomika

Platforma: Illumina NovaSeq platforma

Sazinies ar mums

Sīkāka informācija par pakalpojumu

Bioinformātika

Demonstrācijas rezultāti

Tehniskais princips

Kodolu izolēšana tiek panākta ar 10× Genomics ChromiumTM, kas sastāv no astoņu kanālu mikrofluidikas sistēmas ar dubultām krustojumiem.Šajā sistēmā gēla lodītes ar svītrkodiem un grunti, enzīmiem un vienu kodolu tiek iekapsulētas nanolitra izmēra eļļas pilē, radot gēla lodītes emulsiju (GEM).Kad GEM ir izveidots, katrā GEM tiek veikta šūnu līze un svītrkodu atbrīvošana.mRNS tiek reversi transkribētas cDNS molekulās ar 10 × svītrkodiem un UMI, uz kurām tālāk attiecas standarta sekvencēšanas bibliotēkas konstrukcija.

Audi nav piemēroti vienas šūnas suspensijas pagatavošanai

Šūna / audi	Iemesls
Nesvaigi saldēti audi	Nevar iegūt jaunas vai sen saglabātas organizācijas
Muskuļu šūnas, megakariocīti, tauki…	Šūnas diametrs ir pārāk liels, lai iekļūtu instrumentā
Aknas…	Pārāk trausls, lai salauztu, nespēj atšķirt atsevišķas šūnas
Neironu šūna, smadzenes…	Jutīgāks, viegli stresains, mainīs secības rezultātus
Aizkuņģa dziedzeris, vairogdziedzeris…	Bagāts ar endogēniem enzīmiem, kas ietekmē vienas šūnas suspensijas veidošanos

Viena kodola vs vienas šūnas

Viena kodola	Vienšūnas
Neierobežots šūnu diametrs	Šūnas diametrs: 10-40 μm
Materiāls var būt saldēti audi	Materiālam jābūt svaigam audumam
Zems sasaldētu šūnu stress	Enzīmu apstrāde var izraisīt šūnu stresa reakciju
Sarkanās asins šūnas nav jāizņem	Sarkanās asins šūnas ir jānoņem
Kodolenerģija pauž bioinformāciju	Visa šūna pauž bioinformāciju