-
Pilna garuma mRNS sekvencēšana-Nanopore
RNS sekvencēšana ir bijusi nenovērtējams instruments visaptverošai transkriptu analīzei.Neapšaubāmi, tradicionālā īsā lasīšanas secība šeit ir panākusi daudzus svarīgus uzlabojumus.Tomēr tas bieži saskaras ar ierobežojumiem pilna garuma izoformu identifikācijā, kvantitatīvā noteikšanā un PCR novirzē.
Nanoporu sekvencēšana atšķiras no citām sekvencēšanas platformām ar to, ka nukleotīdus nolasa tieši bez DNS sintēzes un rada ilgu nolasījumu desmitiem kilobāzu.Tas dod iespēju tieši nolasīt pilna garuma stenogrammas un risināt problēmas izoformu līmeņa pētījumos.
Platforma：Nanopore PromethION
Bibliotēka:cDNS-PCR
-
De novo pilna garuma transkripta sekvencēšana - PacBio
De novopilna garuma transkripta sekvencēšana, kas pazīstama arī kāDe novoIso-Seq izmanto PacBio sekvencēra priekšrocības lasīšanas garumā, kas nodrošina pilna garuma cDNS molekulu sekvencēšanu bez pārtraukumiem.Tas pilnībā izvairās no kļūdām, kas rodas transkripta montāžas posmos, un konstruē vienotas kopas ar izoformas līmeņa izšķirtspēju.Šīs unigēnās kopas nodrošina spēcīgu ģenētisko informāciju kā “atsauces genomu” transkripta līmenī.Turklāt šis pakalpojums apvienojumā ar nākamās paaudzes sekvencēšanas datiem nodrošina precīzu izoformas līmeņa izteiksmes kvantitatīvo noteikšanu.
Platforma: PacBio Sequel IIBibliotēka: SMRT zvanu bibliotēka -
Eikariotu mRNS sekvencēšana-Illumina
mRNS sekvencēšana ļauj profilēt visas mRNS, kas transkriptētas no šūnām īpašos apstākļos.Tā ir jaudīga tehnoloģija gēnu ekspresijas profila, gēnu struktūru un noteiktu bioloģisko procesu molekulāro mehānismu atklāšanai.Līdz šim mRNS sekvencēšana ir plaši izmantota fundamentālajos pētījumos, klīniskajā diagnostikā, zāļu izstrādē utt.
Platforma: Illumina NovaSeq 6000
-
Neatsauces mRNS sekvencēšana — Illumina
mRNS sekvencēšana izmanto nākamās paaudzes sekvencēšanas paņēmienu (NGS), lai noteiktā periodā, kurā tiek aktivizētas dažas īpašas funkcijas, uztvertu RNS (mRNS) no eikariota.Garākais transkripts tika saukts par "Unigene" un tika izmantots kā atsauces secība turpmākai analīzei, kas ir efektīvs līdzeklis, lai pētītu sugas molekulāro mehānismu un regulējošo tīklu bez atsauces.
Pēc transkripta datu apkopošanas un unigēnas funkcionālās anotācijas
(1) Tiks veikta SNP analīze, SSR analīze, CDS prognozēšana un gēnu struktūra.
(2) Tiks veikta unigēnās ekspresijas kvantitatīva noteikšana katrā paraugā.
(3) Atšķirīgi izteikti unigēni starp paraugiem (vai grupām) tiks atklāti, pamatojoties uz unigēno ekspresiju
(4) Tiks veikta diferencēti izteiktu unigēnu klasterizācija, funkcionālā anotācija un bagātināšanas analīze.
-
Gara nekodēta secība-Illumina
Garās nekodējošās RNS (lncRNS) ir RNS molekulu veids, kuru garums pārsniedz 200 nt un kurām ir raksturīgs ārkārtīgi zems kodēšanas potenciāls.LncRNS kā galvenais loceklis nekodējošās RNS galvenokārt atrodams kodolā un plazmā.Sekvencēšanas tehnoloģiju un bioinformtikas attīstība ļauj identificēt daudzas jaunas lncRNS un saistīt tās ar bioloģiskām funkcijām.Uzkrājošie pierādījumi liecina, ka lncRNS ir plaši iesaistīta epiģenētiskajā regulēšanā, transkripcijas regulēšanā un pēctranskripcijas regulēšanā.
-
Mazā RNS sekvencēšana-Illumina
Mazā RNS attiecas uz nekodējošu RNS molekulu klasi, kuru garums parasti ir mazāks par 200 nt, ieskaitot mikro RNS (miRNS), mazo interferences RNS (siRNS) un piwi-interacting RNS (piRNS).
MikroRNS (miRNS) ir endogēnu mazu RNS klase, kuras garums ir aptuveni 20–24 nt, un kam šūnās ir dažādas svarīgas regulējošas lomas.miRNS ir iesaistīts daudzos dzīvības procesos, kas atklāj audu specifisku un stadijai specifisku ekspresiju un ir ļoti konservēts dažādās sugās.
-
cirRNS sekvencēšana-Illumina
Visa transkripta sekvencēšana ir paredzēta, lai profilētu visu veidu RNS molekulas, tostarp kodējošās (mRNS) un nekodējošās RNS (tostarp lncRNS, cirRNS un miRNS), kuras noteiktā laikā transkribē noteiktas šūnas.Visa transkripta sekvencēšana, kas pazīstama arī kā “kopējā RNS sekvencēšana”, ir paredzēta, lai atklātu visaptverošus regulējošos tīklus transkripta līmenī.Izmantojot NGS tehnoloģiju, ir pieejamas visu transkripta produktu sekvences ceRNS analīzei un kopīgai RNS analīzei, kas ir pirmais solis uz funkcionālo raksturojumu.CirRNS-miRNS-mRNS bāzes ceRNS regulējošā tīkla atklāšana.
-
Visa transkripta sekvencēšana – Illumina
Visa transkripta sekvencēšana ir paredzēta, lai profilētu visu veidu RNS molekulas, tostarp kodējošās (mRNS) un nekodējošās RNS (tostarp lncRNS, cirRNS un miRNS), kuras noteiktā laikā transkribē noteiktas šūnas.Visa transkripta sekvencēšana, kas pazīstama arī kā “kopējā RNS sekvencēšana”, ir paredzēta, lai atklātu visaptverošus regulējošos tīklus transkripta līmenī.Izmantojot NGS tehnoloģiju, ir pieejamas visu transkripta produktu sekvences ceRNS analīzei un kopīgai RNS analīzei, kas ir pirmais solis uz funkcionālo raksturojumu.CirRNS-miRNS-mRNS bāzes ceRNS regulējošā tīkla atklāšana.
-
Prokariotu RNS sekvencēšana
Prokariotu RNS sekvencēšana izmanto nākamās paaudzes sekvencēšanu (NGS), lai atklātu RNS klātbūtni un daudzumu noteiktā brīdī, analizējot mainīgo šūnu transkriptu.Mūsu uzņēmuma prokariotu RNS sekvencēšana ir īpaši vērsta uz prokariotiem ar atsauces genomiem, nodrošinot jūs ar transkriptu profilēšanu, gēnu struktūras analīzi utt. Tā ir plaši izmantota fundamentālo zinātņu pētniecībā, zāļu izpētē un attīstībā un daudz ko citu.
Platforma: Illumina NovaSeq 6000
-
Metatranskripta sekvencēšana
Metatranskripta sekvencēšana nosaka mikrobu (gan eikariotu, gan prokariotu) gēnu ekspresiju dabiskajā vidē (ti, augsnē, ūdenī, jūrā, izkārnījumos un zarnās). Konkrēti, šis pakalpojums ļauj iegūt visu komplekso mikrobu kopienu gēnu ekspresijas profilu, taksonomisko analīzi. sugu, dažādi izteiktu gēnu funkcionālās bagātināšanas analīze un daudz kas cits.
Platforma: Illumina NovaSeq 6000
