WGS (Nanopore)

Pilna genoma atkārtota sekvencēšana ar Nanopore ir populāra metode genoma variantu, īpaši strukturālo variantu (SV), identificēšanai, kurus precīzāk var noteikt ar garās lasīšanas sekvencēšanu nekā ar īsās lasīšanas sekvencēšanu. BMKCloud TGS-WGS (Nanopore) cauruļvads ir izstrādāts, lai analizētu datus no WGS projektiem ar Nanopore, izmantojot augstas kvalitātes, labi anotētu atsauces genomu. Analīze sākas ar nolasīšanas apgriešanu un kvalitātes kontroli, kam seko saskaņošana ar atsauces genomu, SV izsaukšana un ar SV saistīto gēnu funkcionālā anotācija, izmantojot vairākas datubāzes.