Cirrna sequencing-ilumumina
Toetoetra
● RRNA DEPTION NARAO NATAON'IRENA TAMIN'NY FIVORIANA FIVORIANA, ARA-BAIBOLY ARA-BAIBOLY SORATRAN'ANDRIAMANITRA.
● Ny asa bioinformatic bioinformatic dia ahafahan'ny vinavinan'ny Circrna sy ny fomba fitenenana
Tombontsoa amin'ny serivisy
●Beboka feno momba ny RNA bebe kokoa:Mampiasa RRNE RRNE fa tsy deplettion ao amin'ny fiomanana amin'ny tranomboky mialoha ny RNA, dia miantoka fa ny angon-drakitra Sequencing dia tsy ny Circrna ihany fa Mrna sy Lncrna, manome ny famakafakana iraisana amin'ireto datasets ireto
●Ny famakafakana safidy momba ny tambajotra (Cerna) mifaninana: Manome fahatsapana lalindalina kokoa amin'ny mekanika momba ny sela
●Expertise be dia be: Miaraka amin'ny firaketana an-tsoratra momba ny fanodinana santionany 20 000 ao amin'ny BMKGENE, manondraka ireo karazana santionany sy tetikasa LNCRNA, ny ekipanay dia manana traikefa betsaka amin'ny tetikasa rehetra.
●Fifehezana tsara: Manatanteraka ireo teboka mifehy ny fifehezana fototra amin'ny dingana rehetra isika, avy amin'ny santionany sy ny fanamboarana trano hipetrahana sy ny bioinformatics. Ity fanaraha-maso ara-tsaina ity dia miantoka ny fandefasana ny valiny avo lenta tsy miova.
● Fanohanana ny varotra: Ny fanoloran-tenantsika dia miitatra mihoatra ny fahavitan'ny tetikasa miaraka amin'ny vanim-potoana serivisy mandritra ny 3 volana aorian'ny famarotana. Mandritra izao fotoana izao, manolotra fanampiana momba ny fanarahana ny tetikasa izahay, fanampiana fanampiana, ary ny fivoriana Q & A Seeks mba hamahana ireo fanontaniana mifandraika amin'ny valiny.
Fangatahana santionany sy fanaterana
| -BOKIN'NY Vavolombelon'i Jehovah | Lampihazo | Data | Data QC |
| Rrna dia nihena ny trano fitehirizam-bokatra | Illumina Pe150 | 16-20 gb | Q30≥85%% |
Fangatahana santionany:
Nucleotides:
| Conc. (Ng / μl) | Vola (μg) | fahadiovana | Tsy Nivadika |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260 / 280 = 1.7-2.5 OD260 / 230 = 0.5-2.5 Voafetra na tsy misy proteinina na dna fisarahana aseho amin'ny gel. | Rin≥6.0; 5.0≥28s / 18S≥1.0; voafetra na tsy misy fototra fototra |
● Zavamaniry:
Faka, stem na petal: 450 mg
Ravina na voa: 300 mg
Voankazo: 1.2 g
● biby:
Fo na tsinay: 450 mg
Viscera na atidoha: 240 mg
Hozatra: 600 mg
Taolana, volo na hoditra: 1.5g
● Arthropod:
Bibikely: 9g
Crustacea: 450 mg
● ra tanteraka:2 fantsona
● Ny sela: 106 sela
● serum sy ranon-dra: 6 ml
Fanaterana santionany
Fitaovana: 2 ml centrifuge Tube (Tin Foil tsy voalaza)
Famantarana modely: Vondrona vondrona + ohatra ohatra A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Fandefasana:
1. Ny ranomandry-maina: ny santionany dia mila fatana ao anaty kitapo ary alevina amin'ny ranomandry maina.
2. Fantsona rnabe: Ny santionany RNA dia azo maina ao amin'ny Tube RNA Stabilization (ohatra, rnastable®) ary nalefa tamin'ny mari-pana.
Mikoriana ny asa fanompoana
Famolavolana fanandramana
Fanaterana sampana
Fanesorana RNA
Fanamboarana trano
Sequencing
Famakafakana data
Serivisy serivisy
Bioinformatics
Faminaniana ny Circrna: fizarana chromosomal
Samy hafa samy hafa circrnas - plot volkano
Samy hafa samy hafa circrnnas - fambolena hierarchical
Ny fanatsarana ny fototarazo an'ny Circrna
Diniho ny fandrosoana ara-pikarohana izay manamora ny serivisy BMKGENE 'CINDCRNA Services amin'ny alàlan'ny fanangonana boky vita an-tsoratra.
Wang, X. et al. (2021) 'CPSF4 dia mifehy ny fananganana Circrna sy ny Microrkieded Gene Gene Deneiling Carcinoma Carcinoma', Oncogene 2021 40:25, 40 (25), p. 4338-4351. Doi: 10.1038 / S41388-021-01867-6.
Xia, K. et al. . Doi: 10.1186 / s42483-023-00188-8 / tarehimarika / 6.
Y, H. et al. (2023) 'CPSF3 dia manova ny fifandanjan'ny sombin-tsipika boribory sy tsipika amin'ny carcinoma hepatocellular'. Doi: 10.21203 / Rs.3.Rs-2418311 / V1.
Zhang, Y. et al. . 109495. Doi: 10.1016 / J.Itimp.2022.109495.
