Genome holatra
Tombontsoa amin'ny serivisy
● Paikady filaharana maromaro azo ampiasaina ho an'ny tanjona fikarohana samihafa
● Tena za-draharaha amin'ny fivorian'ny génomique holatra miaraka amin'ny génome pen-complete 10.000 mahery mitambatra.
● Ekipa mpanohana ara-teknika matihanina aorian'ny varotra manatanteraka filàna fikarohana manokana kokoa.
Service Specifications
| fanompoana | Strategy Sequencing | Miantoka ny kalitao | Tombanana ny fotoana fihodinana |
| Sarintany tsara holatra | Illumina 50X+Nanopore 100X | Contig N50≥2 Mb | 35 andro fiasana |
| PacBio HiFi 30X | |||
| Fungal pene-complete sarintany | Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X | Ny tahan'ny chromosome anchoring> 90% | 45 andro fiasana |
Famakafakana bioinformatics
● Fanaraha-maso ny kalitaon'ny angona manta
● Fivoriambe genome
● Famakafakana singa génome
● Famaritana momba ny asan'ny fototarazo
● Famakafakana génomika fampitahana
Santionany takiana sy ny fanaterana
Santionany takiana:
HO AN'NYADN nalaina:
| Karazana santionany | vola | fifantohana | fahadiovana |
| ADN nalaina | > 1,2 g | > 20 ng/μl | OD260/280= 1.6-2.5 |
Ho an'ny santionan'ny tissue:
| Karazana santionany | Fitsaboana santionany soso-kevitra | Santionany fitahirizana sy fandefasana |
| Holatra unicellular | Jereo eo ambanin'ny mikraoskaopy ny masirasira ary angony ao anatin'ny dingan'ny exponential azy Alefaso ny kolontsaina (misy sela 3-4.5e9 eo ho eo) ao anaty eppendorf 1.5 na 2 ml.(Mitohy amin'ny gilasy) Atsofohy ny fantsona mandritra ny 1 minitra amin'ny 14000 g mba hanangonana bakteria sy hanala tsara ny supernatant Asio tombo-kase ny fantsona ary avelao ny bakteria amin'ny azota azota mandritra ny 1-3 ora farafahakeliny.Tehirizo ao anaty vata fampangatsiahana -80 ℃ ny fantsona. | Afangaro ny santionany amin'ny azota ranoka mandritra ny 3-4 ora ary tehirizo ao anaty azota ranona na -80 degre ho famandrihana maharitra.Ilaina ny fandefasana santionany miaraka amin'ny gilasy maina. |
| Holatra Macro | Tissue ao anatin'ny dingana mitombo mavitrika no soso-kevitra. Sasao amin'ny rano tsy misy endotoxine ny tavy, avy eo 70% ethonal. Tehirizo ny santionany amin'ny cryo-tubes. |
Fizotry ny asa fanompoana
Fanaterana santionany
Fananganana tranomboky
Sequencing
Famakafakana angona
Serivisy aorian'ny varotra
1.Circos diagram amin'ny singa génomika holatra
2. Famakafakana génomika fampitahana: Hazo filogenetika
