Products

Fanadihadiana momba ny fikambanana Genome-wide

Sary nasongadina ny Genome-wide Association Analysis

Ny fandalinana ny fikambanan'ny genome-wide (GWAS) dia mikendry ny hamantatra ireo karazana fototarazo (genotype) izay mifandray amin'ny toetra manokana (phenotype).Ny fandalinana GWAS dia manadihady ireo marika fototarazo mamakivaky ny génome iray manontolo amin'ny olona marobe ary maminavina ny fikambanan'ny genotype-phenotype amin'ny alàlan'ny famakafakana statistika amin'ny haavon'ny mponina.Nampiasaina be dia be izy io tamin'ny fikarohana momba ny aretin'olombelona sy ny fitrandrahana fototarazo miasa amin'ny toetra sarotra amin'ny biby na zavamaniry.

Mifandraisa aminay

Service Details

Vokatra Demo

Publication nasongadina

1. Tombontsoa amin'ny serivisy

● Raharaha Tetikasa Be: hatramin'ny niorenany tamin'ny 2009, ny BMKGENE dia nahavita tetikasa karazana an-jatony tamin'ny fikarohana momba ny mponina GWAS, nanampy ireo mpikaroka hamoaka lahatsoratra maherin'ny 100, ary nahatratra 500 ny fitambaran'ny fiantraikany.
● Mpanadihady matihanina.
● Fandinihana fohy.
● fitrandrahana angon-drakitra marina.

2. Famaritana momba ny serivisy

Type	Haben'ny mponina	Tetika sy halalin'ny sequencing
SLAF-GWAS	Laharana santionany ≥200	Ny haben'ny genome <400M, miaraka amin'ny ref-genome, WGS no soso-kevitra
		Haben'ny genome ≤ 1G, Tags 100K ary 10X
		1G ≤ Haben'ny Genome ≤ 2G, Tags 200K ary 10X
		Haben'ny genome > 2G, Tags 300K ary 10X
WGS-GWAS	Laharana santionany ≥200	10X isaky ny santionany

3. Fifantenana fitaovana

Karazana samihafa, subspecies, landraces/genebanks/fianakaviana mifangaro/harena voajanahary

Karazana samihafa, subspecies, landraces

Fianakaviana half-sib/fianakaviana feno/herinaratra

4. Famakafakana momba ny bioinformation

● Famakafakana fiaraha-mientana maneran-tany
● Famakafakana sy fitiliana ny SNP manan-danja
● Famaritana momba ny fototarazon'ny kandida

5. Fandefasana asa fanompoana

Famolavolana andrana

Fanaterana santionany

fitrandrahana RNA

Fananganana tranomboky

Sequencing

Famakafakana angona

Serivisy aorian'ny varotra

teo aloha: Fizarana RNA nokleary tokana

Manaraka:

a.Phenotype QC

Histograma fitsinjarana matetika

Statistika fenotype

b.Famakafakana fikambanana (Modely: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)

Vidin'ny QQ

Manhattan Plot

TAOM-	Journal	IF	Lohateny
2022	NC	17.69	Fototry ny génomika ny giga-chromosomes sy ny giga-genome amin'ny hazo peony Paeonia ostii
2015	NP	7.43	Ny dian-tongotra an-trano dia mametraka ny faritra génomika manan-danja amin'ny agronomika amin'ny soja
2018	MP	9.32	Ny famerimberenan'ny génome manontolo amin'ny fanangonana eran'izao tontolo izao amin'ny fidirana amin'ny fanolanana dia manambara ny fototarazony amin'ny fahasamihafan'ny ecotype azy
2022	HR	7.29	Ny famakafakana ny fikambanan'ny genome-wide dia manome fomba fijery molekiola momba ny fiovaovan'ny voajanahary amin'ny haben'ny voan'ny pasteky