Famakafakana ny Fifandraisana manerana ny Genome
Fizotran'ny asa
Tombony amin'ny serivisy
●Fahaizana manokana sy firaketana an-tsoratra momba ny famoahanaNoho ny traikefa ananany tao amin'ny GWAS, ny BMKGene dia nahavita tetikasa an-jatony momba ny karazana fikarohana momba ny mponina ao amin'ny GWAS, nanampy ireo mpikaroka hamoaka lahatsoratra maherin'ny 100, ary nahatratra 500 ny fitambaran'ny fiantraikany.
● Fanadihadiana feno momba ny bioinformatika: ny fomba fiasa dia ahitana ny famakafakana ny fifandraisan'ny toetran'ny SNP, izay manolotra andiana fototarazo kandidà sy ny fanamarihana momba ny fiasany mifandraika amin'izany.
●Ekipa bioinformatika mahay sy tsingerin'ny fanadihadiana fohyManana traikefa betsaka amin'ny famakafakana genomika mandroso ny ekipan'ny BMKGene, ka afaka manao famakafakana feno ao anatin'ny fotoana fohy.
●Fanohanana aorian'ny varotra:Mihoatra ny fahavitan'ny tetikasa ny fanoloran-tenanay miaraka amin'ny fe-potoana fanompoana aorian'ny fivarotana 3 volana. Mandritra io fotoana io, dia manolotra fanaraha-maso ny tetikasa, fanampiana amin'ny famahana olana, ary fivoriana Fanontaniana sy Valiny izahay mba hamaliana izay fanontaniana mifandraika amin'ny vokatra.
Fepetra takiana sy fepetra takiana amin'ny serivisy
| Karazana filaharana | Ambaratonga mponina atolotra | Tetikady filaharana | Fepetra takiana amin'ny nokleotida |
| Filaharan'ny ADN manontolo | Santionany 200 | 10x | Fifantohana: ≥ 1 ng/ µL Totaliny ≥ 30ng Fahasimbana na fahalotoana voafetra na tsy misy mihitsy |
| Sombin-javatra Nohamafisina tao amin'ny Loka Manokana (SLAF) | Halalin'ny marika: 10x Isan'ny marika: < 400 Mb: WGS no soso-kevitra < 1Gb: marika 100K 1Gb > 2Gb: marika 300K Marika 500k fara-fahabetsany | Fifantohana ≥ 5 ng/µL Totaliny ≥ 80 ng Gel Agarose: tsy misy na voafetra ny fahasimbana na ny loto
|
Fifantenana fitaovana
Karazana, zana-karazana, karazana tany/bankin'ny fototarazo/fianakaviana mifangaro/loharano dia samihafa
Karazana, zana-karazana, karazana tany samihafa
Fianakaviana iray tampo/fianakaviana iray tampo/loharano dia
Fikorianan'ny Asa Fanompoana
Famolavolana fanandramana
Fanaterana santionany
Fitrandrahana ARN
Fananganana tranomboky
Filaharana
Famakafakana angon-drakitra
Serivisy aorian'ny fivarotana
Tafiditra ao anatin'izany ireto fanadihadiana manaraka ireto:
- Fanadihadiana ny fifandraisana manerana ny genome: modely LM, LMM, EMMAX, FASTLMM
- Fanamarihana ara-paikany momba ny fototarazo kandidà
Famakafakana ny fifandraisan'ny toetra SNP - teti-dratsin'i Manhattan
Famakafakana ny fifandraisan'ny toetra SNP - teti-QQ
Jereo ireo fandrosoana notohanan'ny serivisy de GWAS an'ny BMKGene amin'ny alàlan'ny fanangonana boky sy gazety voakarakara tsara:
Lv, L. et al. (2023) 'Fahatakarana ny fototarazon'ny fandeferana amoniaka ao amin'ny razor clam Sinonovacula constricta amin'ny alàlan'ny fandalinana ny fifandraisana manerana ny genome',Fiompiana anaty rano, 569, p. 739351. doi: 10.1016/J.AQUACULTURE.2023.739351.
Li, X. et al. (2022) 'Ny fanadihadiana multi-omics amin'ny karazana vary amboahaolo 398 dia mampiseho faritra genomika mifandraika amin'ny fiompiana, ny toetran'ny metabolite, ary ny fiantraikany manohitra ny fivontosana',Zavamaniry Molekiola, 15(8), p. 1367–1383. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.
Li, J. et al. (2022) 'Famaritana ny fifandraisan'ny genome amin'ny fenotypes Hulless Barely amin'ny tontolo iainana hain-tany',Sisintany amin'ny Siansa momba ny Zavamaniry, 13, p. 924892. doi: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX.
Zhao, X. et al. (2021) 'Ny GmST1, izay mandika sulfotransferase, dia manome fanoherana ny karazana viriosy mosaic soja G2 sy G3',Zavamaniry, Sela & Tontolo Iainana, 44(8), p. 2777–2792. doi: 10.1111/PCE.14066.
