mRNA-seq (NGS) – De novo

Ny fandaharana mRNA dia ahafahana mijery ny mombamomba ny transcript mRNA rehetra ao anaty sela amin'ny fepetra manokana ary teknolojia ampiasaina betsaka amin'ny sehatra fikarohana isan-karazany. Ny fantsona BMKCloud De novo mRNA-seq dia natao handinihana ireo tranomboky fandaharana poly-A manankarena rehefa tsy misy genome fanondroana azo ampiasaina. Manomboka amin'ny fanaraha-maso ny kalitao ny fantsona, arahin'nyvaovaoNy fanangonana transcript sy ny fisafidianana andiana unigene. Ny fanadihadiana ny rafitry ny unigene dia maminavina ny filaharan'ny kaody (CDS) sy ny famerimberenana filaharana tsotra (SSR). Aorian'izay, ny fanadihadiana ny fanehoana samihafa dia mahita ireo fototarazo maneho samihafa (DEG) eo amin'ireo fepetra nosedraina, arahin'ny fanamarihana momba ny fiasa sy ny fanatsarana ny DEG mba hahazoana fahatakarana ara-biolojika.