BMKCloud Log in

Products

Single- Nuclei RNA Sequencing

Ny fampandrosoana ny fisamborana sela tokana sy ny fomba fanamboarana trano fitehirizam-bokatra, miaraka amin'ny fanodinana avo lenta, dia nanova ny fandaharam-potoana tamin'ny fandaharam-potoana tamin'ny ambaratonga sela. Ity fahatapahana ity dia ahafahana mamakafaka lalina kokoa sy feno momba ny mponina sela saro-pantarina, handrenesana ny fetra mifandraika amin'ny fampitana ny fototarazo amin'ny alàlan'ny sela rehetra sy ny fiarovana ny tena heterogeneity ao anatin'ireo mponina ireo. Na dia misy tombony azo esorina aza ny sela-sela-sela-sela (SCRNA-SEQ), dia miatrika fanamby amin'ny tisy sasantsasany izay manasongadina ny fampiatoana sela tokana ary mitaky santionany vaovao. Ao amin'ny BMKGENE, dia niresaka momba an'io sakana io izahay amin'ny alàlan'ny fanolorana ny RNA RNA RNA Ity fomba fiasa ity dia manitatra ny spektrika santionany am-pahalalana amin'ny fandalinana transcriptome amin'ny ambaratonga tokana.

Ny fitokonana ny nuclei dia tanterahana amin'ny alàlan'ny chomium chromium Innovative Chumium Chumium, izay manasongadina rafitra microfluidika microfluidika valo miaraka amin'ny fiampitana indroa. Ao anatin'ity rafitr'ity tontolo ity, ny vorondrano gel izay mampiditra ny barcode, ny primers, ny enzimme, ary ny fototry ny iray dia misy ny sokajin-tsofina iray ao amin'ny sokajin-tsolika avy any Nanoliter, dia namorona ny gel bead-in-emulsion (vatosoa). Taorian'ny fananganana vatosoa dia misy ao anaty vatosoa tsirairay ny sela sy ny famotsorana barcode. Taorian'izay, mrna molekiola niatrika ny fanolorana ny fanodinana ho any Cdnas, mampiditra ny 10x barcode ary mpamantatra molekiola tokana (umis). Ireo CDNAS ireo dia iharan'ny fanamboarana tranomboky fenitra fenitra, manamora ny hentitra sy ny fitrandrahana feno momba ny profiley Generaly amin'ny ambaratonga tokana.

Platform: 10 × Genomics Chromium sy Illumina noveSEQ

Mifandraisa aminay

Service antsipirihany

Bioinformatics

Vokatry ny demo

Nasongadina boky

Tetikasa ara-teknika

Ny fitokonana ny nuclei dia tanterahana amin'ny 10 × Genomics Chromium ™, izay rafitra microfluidika microfluidika valo miaraka amin'ny fiampitana indroa. Amin'ity rafitr'ity tontolo ity, ny voromailala misy barcode sy ny primes, ny anzima ary ny sela iray dia misy ny sokajin-tsofina iray ao anaty menaka manoliter-sizeds, ka niteraka an'i Gel Bead-in-emulsion (vatosoa). Vantany vao miforona ny vatosoa, ny lysis sela ary ny famotsorana ny barcode dia atao ao anaty vatosoa tsirairay. Mrna dia mifamadika amin'ny molekiola CDNO miaraka amin'ny 10 × Barcode sy Umi, izay iharan'ny fanamboarana tranomboky sequencing fenitra.

Toetoetra

● Fanomanana ny fiatoam-bokatra tokana avy amin'ny tavy froven

● Ny fananganana gel bead-in-emulsion (vatosoa) narahin'ny cdna synthesis

● Ny vakana tsirairay ao anaty vatosoa iray dia enta-mavesatra amin'ny primers misy fizarana 4:

rambony poly (dt) ho an'ny mrna priming sy cdna synthesis,

Mpanondro molekular tsy manam-paharoa (UMI) mba hanitsiana ny fitambaran-jotra

10x barcode

Famatorana ny filaharan'ny ampahany amin'ny fizarana 1 sequencing primer

tombony

RNA Singleus Ndreus RNA dia namorona ny fetran'ny sela RNA Slow RNA, izay mamela:

● Ny fampiasana santionany mangatsiaka ary tsy voafetra ihany ny santionany vaovao

● Tsy mila fanesorana ny sela mena taloha

● Diameter sela tsy manam-petra

● Santionany be dia be izay azo ekena amin'ny famakafakana, ao anatin'izany ny karazan-tsarimihetsika sy marefo marefo izay mora tohina amin'ny sela clumping na fandringanana mandritra ny fisarahana

Santionany izay tsy azo halaina amin'ny alàlan'ny sela RNA RNA tokana ary mendrika ny hanoratana ny RNA tokana RNA:

Sela / tavy	antony
Tavy frozen	Tsy afaka mahazo fikambanana vaovao na efa voavonjy
Sela hozatra, Megakaryocyte, tavy ...	Ny sela sela dia lehibe loatra raha miditra amin'ny zavamaneno
Aty ...	Voarakotra loatra ka tapaka, tsy afaka manavaka ireo sela tokana
Neuron Cell, Brain ...	Mora tohina sy mora kokoa ny adin-tsaina, hanova ny valin'ny fandefasana
Pancreas, tiroida ...	Manankarena amin'ny enzogous enzogous, miantraika amin'ny famokarana fampiatoana sela tokana

Single-nucleus vs sela tokana

Single-nucleus	afa-tsy sela
Diameter sela tsy manam-petra	Diaroka sela: 10-40 μm
Ny fitaovana dia mety ho tavy mangatsiaka	Ny fitaovana dia tsy maintsy ho tavy vaovao
Fihenjanana ambany sela mangatsiaka	Ny fitsaboana anzima dia mety hiteraka fanehoan-kevitra sela
Tsy misy sela mena tokony hesorina	Ny sela mena dia mila esorina
Ny nokleary dia maneho ny bioinformation	Ny sela iray manontolo dia maneho bioinformation

fepetra arahana

Fangatahana santionany

-BOKIN'NY Vavolombelon'i Jehovah

Paikady Sequencing

Data natolotra

Ny fifehezana kalitao

Tavaha biby ≥ 200 mg

Tissue fototra ≥ 400 mg

10x Genomics Sn CDNA LIBRARY

Illumina Pe150

Ny 100k pe dia mamaky isaky ny sela

(100-200 GB)

700-1200 Noklei / Noram-pinoana sy ny tsy fivadihan-tsakafo hita ao amin'ny microscope

Raha mila fanazavana fanampiny momba ny fitarihana santionany sy ny serivisy serivisy, azafady azafady mba hiresaka amin'ny aExpert bmkgene

Mikoriana ny asa fanompoana

Teo aloha: Zavamaniry / biby fitambaran'ny genome

Manaraka: Famakafakana fikambanana genome-wide

Dia ahitana ny famakafakana manaraka:

● Ny fanaraha-maso kalitao: Isan'ny sela, ny fitetezana gene, ny famantarana ny sela, ny molekiola RNA ary ny fomba fitenenana

● Famakafakana santionany ao anaty:

Sela clustering sy fanangonam-borona

Famakafakana fanehoana fanalehin-kevitra: Famantarana ny doka ao anaty klusters

Ny fanangonam-bola sy ny fanatsarana ny kluster degs

● Famakafakana vondrona:

Fitambaran'ny angon-drakitra

Famakafakana fanehoana fanazaran-tena: Famantarana ny doka amin'ny vondrona

Ny fanangonam-bidy sy ny fanatsarana ny Dogs vondrona

● Famakafakana lalindalina kokoa:

Famakafakana sela

Fandinihana pseudotime

Famakafakana ny serasera conle (cellphoneb)

Gene Set Analysis (GSEA)

Famakafakana inner-santion

CLUEL CLUSTERINGE:

Fandinihana ny fomba samy hafa: Cluster Degs

Famakafakana vondrona inter-vondrona

Fandinihana ny fomba fanehoana: Vondrona vondrona

Famakafakana lalindalina:

Fandinihana pseudotime:

Famakafakana sela:

Diniho ny fandrosoana fanamorana ny serivisy Singam-panadian'ny RNA bmkgene RNA

Wang, L. et al. (2021) Ny famakafakana sela-sela tokana dia manambara ny fijanonan'ny havokavoka ao amin'ny Asthma-fanoherana ny steroidNy fizotry ny Akademia nasionaly momba ny siansa any Etazonia, 118 (2), p. E2005590118. Doi: 10.1073 / pnas.2005590118

Zheng, H. et al. .Frontier ao amin'ny Immunology, 13, p. 879824. Doi: 10.3389 / fimmu.2022.879824 / Bibtex.

Tian, H. et al. (2023) Ny "Transcriptome sela-sela tokana dia tsy misy valiny momba ny heterogeneity sy ny famelabelarana ny valin-kafatra amin'ny leukocytes taorian'ny fanaovana vaksiny miaraka amin'ny edwardiella tsy mihetsika ao amin'ny Flounder (Paralichthyl) ',Aquaculture, 566, p. 739238. Doi: 10.1016 / J.A.AachArure.2023.739238.

Yu, Y. et al. .Homamiadana gastric, 26 (5), p. 798-813. Doi: 10.1007 / S10120-023-01409-x / metaly.