Small RNA Sequencing-Illumina
Toetoetra
● Fanomanana tranomboky mifantina habe.
● Famakafakana bioinformatika mifototra amin'ny faminaniana sy ny tanjona miRNA.
Tombontsoa amin'ny serivisy
●Extensive Expertise: Santionany maherin'ny 300 no nokarakarainay, izay ahitana karazana santionany isan-karazany. Mitondra ny harenan'ny fahaiza-manao izahay isaky ny tetikasa.
●Fanaraha-maso kalitao henjana: Mampihatra teboka fanaraha-maso fototra manerana ny dingana rehetra izahay, manomboka amin'ny fanomanana santionany ka hatramin'ny fanomanana tranomboky, ny filaharana ary ny bioinformatika. Ny fanaraha-maso tsara ataonay dia miantoka ny fandefasana vokatra avo lenta tsy tapaka.
●Famakafakana bioinformatika feno:Izy io dia mamela ny famantarana ireo miRNA fantatra sy novokarina, famantarana ireo kendrena miRNAs, ary fanoritsoritana sy fanatsarana mifanaraka amin'izany miaraka amin'ny angon-drakitra marobe (KEGG, GO).
●Fanohanana aorian'ny varotra: Takatsika ny maha zava-dehibe ny fanatrehana, izany no mahatonga ny fanoloran-tenantsika mihoatra ny fahavitan'ny tetikasa miaraka amin'ny fe-potoana 3 volana aorian'ny fivarotana. Mandritra izany fotoana izany, manolotra fanaraha-maso ny tetikasa, fanampiana famahana olana, ary fotoam-pivoriana Q&A izahay mba hamahana ireo fanontaniana mifandraika amin'ny valiny.
Santionany takiana sy ny fanaterana
| -BOKIN'NY Vavolombelon'i Jehovah | Platform | Angona soso-kevitra | Takelaka data QC |
| Habe nofantenana | Illumina SE50 | 10M-20M mamaky | Q30≥85% |
Santionany takiana:
Nucleotides:
| Conc.(ng/μl) | Vola (μg) | fahadiovana | Tsy Nivadika |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Voafetra na tsy misy fandotoana proteinina na ADN aseho amin'ny gel. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; voafetra na tsy misy elevation baseline |
● Zavamaniry:
Root, Stem na Petal: 450 mg
Ravina na voa: 300 mg
Voankazo: 1,2 g
● Biby:
Fo na tsinay: 450 mg
Viscera na ati-doha: 240 mg
Hozatra: 600 mg
Taolana, volo na hoditra: 1,5g
● Arthropoda:
bibikely: 9g
Crustacea: 450 mg
● Ra manontolo: 2 tavy
● sela: 106 sela
● Serum sy Plasma:6 mL
Fanaterana santionany soso-kevitra
Container: 2 ml centrifuge tube (tsy soso-kevitra)
Famaritana santionany: Vondrona + adika ohatra A1, A2, A3; B1, B2, B3.
fandefasana:
1. Dry-ice: Ny santionany dia mila atao anaty kitapo ary alevina ao anaty ranomandry maina.
2. Tube RNAstable: Ny santionany RNA dia azo maina ao anaty fantsona fanamafisana RNA (ohatra RNAstable®) ary alefa amin'ny mari-pana amin'ny efitrano.
Fizotry ny asa fanompoana
Famolavolana andrana
Fanaterana santionany
fitrandrahana RNA
Fananganana tranomboky
Sequencing
Famakafakana angona
Serivisy aorian'ny varotra
Bioinformatics
● Fanaraha-maso ny kalitaon'ny angona manta
● Fanasokajiana RNA kely
● famakafakana fanehoan-kevitra miRNA sy fanehoan-kevitra samihafa
● fototarazo kendrena miRNA sy fanoritsoritana fototarazo kendrena miRNA amin'ny fomba samihafa
● Famaritana ny fototarazo kendrena sy fanatsarana ny fiasan'ny fototarazo miRNA
Famantarana ny miRNA: rafitra sy halaliny
Fiteny tsy mitovy amin'ny miRNA - clustering hiearchical
Fanambarana miasa amin'ny tanjona amin'ny miRNA tsy mitovy
Tadiavo ny fivoaran'ny fikarohana nataon'ny BMKGene'sRNA sequence services amin'ny alàlan'ny fanangonana boky voarindra.
Chen, H. et al. (2023) 'Ny otrikaretina virosy dia manakana ny biosynthesis saponin sy ny photosynthesis ao amin'ny Panax notoginseng',Physiology sy Biochemistry, 203, p. 108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al. (2023) 'Ny zavamaniry FYVE misy proteinina FREE1 dia mifandray amin'ny singa microprocessor mba hanakanana ny biogenesis miRNA',EMBO tatitra, 24(1). doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. et al. (2023) 'Ny MicroRNA Ame-Bantam-3p dia manara-maso ny fivoaran'ny pupal larva amin'ny alàlan'ny fikendrena ireo sehatra mitovy amin'ny epidermal mitombo 8 Gene (megf8) ao amin'ny tantely, Apis mellifera',Gazety iraisam-pirenena momba ny siansa molekule, 24(6), p. 5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al. (2018) 'Fanadihadiana mitambatra ny MiRNA sy ny fototarazo mifandraika amin'ny kalitaon'ny hena dia manambara fa ny Gga-MiR-140-5p dia misy fiantraikany amin'ny famafazana tavy ao anaty akoho',Fisiolojia sela sy biochemistry, 46(6), p. 2421–2433. doi: 10.1159/000489649.
