-
PacBio-Whakaahua-Katoa-Katoa (Kaore he Tohutoro)
Amplicon (16S/18S/ITS) papaaapapa kua whakawhanakehia me nga tau o te wheako i roto i te rangahau kaupapa kanorau moroiti, kei roto he tātaritanga taketake me te tātaritanga whaiaro: ko te tātaritanga taketake e hipokina ana te ihirangi tātari auraki o te rangahau moroiti o naianei, he taonga me te matawhānui te ihirangi tātari, ka whakaatuhia nga hua tātaritanga i roto i te ahua o nga ripoata kaupapa;He kanorau te ihirangi o te tātaritanga whaiaro.Ka taea te kowhiri i nga tauira ka taea te whakarite ngawari i runga i te purongo tātari taketake me te kaupapa rangahau, kia tutuki ai nga whakaritenga whaiaro.Pūnaha whakahaere Windows, ngawari me te tere.
-
PacBio-Whakaahua-Katoa-Katoa (Kaore he Tohutoro)
Ko te tango i nga raraunga raupapa Isoform a Pacific Biosciences (PacBio) hei whakaurunga, ka taea e tenei Taupānga te tautuhi i nga raupapa tuhinga roa-katoa (kare he huihuinga).Ma te maapiri i nga raupapa-roa ki te ira tohutoro, ka taea te whakatika i nga tuhinga e nga ira mohio, nga tuhinga, nga rohe whakawaehere, me etahi atu. I tenei keehi, ka taea te tautuhi tika ake o nga hanganga mRNA, penei i te taapiri rereke, me etahi atu.Ko te tātaritanga tahi me nga raraunga raupapa tuhinga a NGS e taea ai te whakamaaramatanga matawhānui me te inenga tika ake i roto i nga korero i te taumata tuhinga, e whai hua nui ana ki te whakaputanga rerenga rereke me te tātari mahi.
-
Nga kete taputapu
Ko te BMKCloud he papaaaaao koiora e whakarato ana i te otinga kotahi-mutu mo nga kaupapa genomic, e tino whakawhirinakihia ana e nga kairangahau i roto i nga momo waahi tae atu ki nga rongoa, ahuwhenua, taiao, me etahi atu. , rauemi rorohiko, pātengi raraunga tūmatanui, akoranga ipurangi bioinformtic, me etahi atu. He maha nga taputapu koiora e whakamahia ana e BMKCloud tae atu ki nga tohu ira, nga taputapu ira kukuwhatanga, ncRNA, te mana kounga raraunga, te huihuinga, te whakatikatika, te tangohanga raraunga, nga whakarereketanga, nga tatauranga, te whakaputa ahua, te raupapa. tātari, etc.
-
RNA iti
Ko nga RNA iti he momo RNA kore-waehere poto me te roa toharite o te 18-30 nt, tae atu ki te miRNA, siRNA me te piRNA.Ko enei RNA iti kua nui te korero ka uru ki roto i nga momo tukanga koiora penei i te whakahekenga o te mRNA, te aukati i te whakamaoritanga, te hanga heterochromatin, me etahi atu. Ko te turanga tātari raupapa he tātari paerewa me te keri raraunga matatau.I runga i te turanga o nga raraunga RNA-seq, ka taea e te tātari paerewa te whakatutuki i te tohu me te matapae miRNA, te matapae ira whainga miRNA, te whakamaarama me te tātari korero.Ko te tātaritanga matatau ka taea te rapu me te tangohanga miRNA, te whakaputa hoahoa Venn, te miRNA me te hanga whatunga ira ira.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
Ko te NGS-WGS he papaahanga tātari-a-ira-ira-ira katoa, i whakawhanakehia i runga i te turanga o nga wheako nui i roto i nga Hangarau Biomarker.Ma tenei papaahi ngawari ki te whakamahi ka taea te tuku tere i te rerenga mahi tātaritanga ma te whakarite noa i etahi tawhā taketake, e tika ana mo nga raraunga raupapa DNA i hangaia mai i te papaaho Illumina me te papa raupapa BGI.Ka tukuna tenei turanga ki runga i te tūmau rorohiko mahi teitei, e whakamana ana i te tātari raraunga tino pai i roto i te wa poto.E waatea ana te keri raraunga whaiaro i runga i te turanga o te tātaritanga paerewa, tae atu ki te patai ira ira, hoahoa tuatahi PCR, aha atu.
-
mRNA( Tohutoro)
Ko te Transcriptome te hononga i waenga i nga korero ira ira me te paati o te mahi koiora.Ko te whakaritenga taumata tuhi te mea tino nui me te tino ako i nga tikanga ture mo nga rauropi.Ka taea e te raupapa tuhinga te whakaraupapa i te tuhinga i nga wa katoa, i raro ranei i tetahi ahuatanga, me te whakatau tika ki te nucleotide kotahi. tauira tuhinga motuhake.
I tenei wa, kua whakamahia nuitia te hangarau raupapa tuhinga i roto i te agronomy, te rongoa me etahi atu mara rangahau, tae atu ki te ture whanaketanga kararehe me te tipu, te urutau taiao, te taunekeneke aukati, te waahi ira, te whanaketanga momo ira me te puku me te kitenga mate ira.
-
Metagenomics (NGS)
I hoahoatia tenei papa taapapa mo te tātari raraunga metagenomic shotgun i runga i nga tau o te wheako.Kei roto ko te rerengamahi whakauru kei roto i nga momo tātaritanga metagenomics e hiahiatia ana tae atu ki te tukatuka raraunga, nga rangahau taumata-momo, nga rangahau taumata-whakamahi ira, te whakakao metagenome, me etahi atu. , te whakatakotoranga tawhā, te whakaputa ahua whaiaro, etc.
-
LncRNA
Ko nga RNA kore-whakawaehere roa (lncRNA) he momo tuhi me te roa atu i te 200 nt, kaore e taea te tohu i nga pūmua.Ko nga taunakitanga whakahiato e whakaatu ana ko te nuinga o nga lncRNA ka tino mahi.Ko nga hangarau raupapa teitei me nga taputapu tātari bioinformatic e whakamana ana i a tatou ki te whakaatu i nga raupapa lncRNA me te whakatuu korero kia pai ake ai, me te arahi i a tatou ki te rapu i nga lncRNA me nga mahi tino nui.Kei te whakahīhī a BMKCloud ki te whakarato ki o taatau kaihoko te papahanga tātari raupapa lncRNA kia tutuki tere, pono me te ngawari te tātari lncRNA.
-
GWAS
Ko te rangahau hononga ira-whanui (GWAS) e whai ana ki te tautuhi i nga momo ira (genotype) e hono ana ki nga ahuatanga motuhake (phenotype).Ka tirotirohia e nga rangahau a GWA nga tohu ira e whakawhiti ana i te ira katoa o te maha o nga tangata takitahi me te matapae i nga hononga tohu-ira ma te tātari tauanga i te taumata taupori.Ka kitea pea e te resequencing-ira-ira katoa nga momo ira katoa.Ma te hono me nga raraunga tohutoro, ka taea te tukatuka GWAS ki te tautuhi i nga SNP e pa ana ki te tohu tohu, nga QTL me nga ira kaitono, e kaha tautoko ana i te whakatipu kararehe/tipu hou.Ko te SLAF he rautaki whakaraupapa ira ira tangata ngawari, e kitea ana nga tohu toha-whanui ira, SNP.Ko enei SNP, hei tohu tohu ira rapoi, ka taea te tukatuka mo nga rangahau hononga me nga ahuatanga kua tohua.He rautaki whai hua ki te tautuhi i nga ahuatanga uaua e pa ana ki nga rereketanga ira.
-
Nanopore Ko nga tuhinga roa-katoa
Ko nga momo ahua rereke me te rereke rereke i roto i nga rauropi he tikanga ira nui hei whakahaere i te whakaputanga ira me te rereketanga o te pūmua.Ko te tautuhi tika o nga hanganga tuhinga te putake mo te rangahau hohonu o nga tauira ture whakaputa ira.Ko te papa raupapa raupapa Nanopore kua angitu te kawe mai i te rangahau transcriptomic ki te taumata-isoform.I hoahoatia tenei papahanga tātari ki te tātari i nga raraunga RNA-Seq i hangaia i runga i te papaapapa Nanopore i runga i te turanga o te tohutoro tohutoro, e tutuki ai nga tātaritanga kounga me te ine i roto i te taumata ira me te taumata tuhinga.
