BMKCloud Log in

Hua

Te Whakaraupapa Whakamaunga Whakaora Chromatin (ChIP-seq)

Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ChIP-seq) Whakaaturanga Whakaaturanga

Ko te ChIP-Seq e whakarato ana i te tohu ira-a-whanui o nga whaainga DNA mo te whakarereketanga histone, nga take tuhi, me etahi atu pūmua e pa ana ki te DNA.Ka whakakotahihia e ia te kowhiringa o te chromatin immuno-precipitation (ChIP) ki te whakahoki mai i nga kohinga pūmua-DNA motuhake, me te kaha o te raupapa reanga-whakatupuranga (NGS) mo te raupapatanga teitei o te DNA whakaora.I tua atu, na te mea ka hoki mai nga kohinga pūmua-DNA mai i nga pūtau ora, ka taea te whakataurite nga waahi here ki nga momo pūtau me nga kopa rereke, i raro ranei i nga ahuatanga rereke.Ko nga tono mai i nga ture tuhi ki nga huarahi whanaketanga ki nga tikanga mate me tua atu.

Paerewa: Illumina NovaSeq Platform

Whakapā mai

Nga Taipitopito Ratonga

Bioinformatics

Hua Whakaaturanga

Painga Ratonga

● Paerewa: Illumina NovaSeq Platform, PE150

● Momo whare pukapuka: 100-500bp whakauru te whare pukapuka DNA (e whakawhirinaki ana ki te tohatoha tihi)

● Rautaki raupapa: Paired-Mutu 150 bp

● Tohua te whakaputanga raraunga: 6 Gb raw raraunga/tauira.

Nga Whakaritenga Tauira

Te rahinga DNA: ≥ 70 ng, te tihi matua o te 100 ki te 500 bp

Rōrahi tauira: ≥ 10 μl

OD260/280 = 1.8 ki te 2.0 kaore he paheketanga, he poke RNA ranei

Rerengamahi whakamatautau

Te Rerenga Mahi Ratonga

tuku tauira

Te tuku tauira

Te Whakaritenga Whare Pukapuka

Te hanga whare pukapuka

Whakaraupapa

Whakaraupapa

Te tātari raraunga

Te tātari raraunga

I muri i te hoko Ratonga

Nga ratonga muri-hoko

Tōmua: Raupapa Metagenomic -NGS

Panuku: Katoa te raupapa tuhinga - Illumina

1. Te tohatoha whakarangatira teitei

2. MA te papa o te tihi rerekee

3.Tuhinga KEGG

4. GO whakarōpūtanga

whiwhi korero

Tuhia to korero ki konei ka tukuna mai ki a matou

Huangā kāwai

Tukuna mai to korero ki a matou: