BMKCloud Log in
条形banner-03

Hua

Tangata Katoa Exome Sequencing

Ko te raupapatanga o waho katoa (WES) e kiia ana he rautaki raupapa whai hua mo te tautuhi i nga huringa mate-mate.Ahakoa he 1.7% noa iho o te ira ira tangata ka tangohia e nga exons, he tohu tika te ahua o nga mahi pūmua katoa.I roto i te ira tangata, kua korerohia he neke atu i te 85% o nga huringa e pa ana ki nga mate ka puta i roto i te rohe whakawaehere pūmua.

Kei te tuku a BMKGENE i nga ratonga whakamaarama whanui me te ngawari o te tangata me nga momo rautaki hopu exon e waatea ana ki te whakatutuki i nga whaainga rangahau.

Paerewa: Illumina NovaSeq Platform


Nga Taipitopito Ratonga

Hua Whakaaturanga

Painga Ratonga

● Wāhi Waehere Pūmua: mā te hopu me te whakaraupapa i te rohe whakawaehere pūmua, ka whakamahia te hWES ki te whakaatu i ngā rerekētanga e pā ana ki te hanganga pūmua;
● Tika Tino: me te hohonutanga o te raupapa raupapatanga, ka taea e te hWES te kimi i nga momo rereke noa me nga rereke onge me nga iarere iti iho i te 1%;
● Utu Whaihua: Ko te hWES ka puta mai i te 85% o nga huringa mate tangata mai i te 1% o te genome tangata;
● E rima nga tikanga QC tino e hipoki ana i te mahinga katoa me te Q30>85% kua whakamanahia.

Tauira Tauira

Paerewa

 

Whare Pukapuka

 

Rautaki Hopu Exon

 

 Tūtohu Rautaki Whakaraupapa

 

 

 

Illumina NovaSeq Platform

 

PE150

Agilent SureSelect Tangata Katoa Exon V6

IDT xGen Exome Hyb Paewhiri V2

5 Gb

10 Gb

Nga Whakaritenga Tauira

Momo Tauira

 

 Te nui(Qubit® )

 

Rōrahi

 

 Te aro

 

 

 Pure(NanoDrop™ )

 

DNA genomic

 

≥ 300 ng
≥ 15 μL
≥ 20 ng/μL
 
OD260/280=1.8-2.0
 
kahore he paheketanga, kahore he poke

 

Te Hohonu Whakaraupapa Manakohia

Mo nga mate Mendelian/mate onge: te hohonu o te raupapa whai hua i runga ake i te 50×
Mo nga tauira pukupuku: te hohonu o te raupapa whai hua i runga ake i te 100×

Bioinformatics

WES_BI rerenga mahi_Mauiui-01
WES_BI rerenga mahi_Tumor-01

Te Rerenga Mahi Ratonga

tuku tauira

Te tuku tauira

Whakamatau pairati

tangohanga DNA

Te Whakaritenga Whare Pukapuka

Te hanga whare pukapuka

Whakaraupapa

Whakaraupapa

Te tātari raraunga

Te tātari raraunga

数据上传-01

Te tuku raraunga

I muri i te hoko Ratonga

Nga ratonga muri-hoko


  • Tōmua:
  • Panuku:

  • 1.Tautauranga Whakatikanga

    Ripanga 1 Tauanga o te hua mapi

     

    wps_doc_19

    Ripanga 2 Tatauranga mo te hopu exome

    wps_doc_2

    2.Huritanga rereke

    Whakaatu 1 Tatauranga o SNV me InDel

    wps_doc_4

    wps_doc_3


     

    3.Atatari Ake

    Whakaahua 2 Circos maata o Genome-whanui kino SNV me InDel

    wps_doc_5 wps_doc_6

    Ripanga 3 Te tirotiro i nga ira mate-mate

    wps_doc_7 wps_doc_8 wps_doc_9

     

    whiwhi korero

    Tuhia to korero ki konei ka tukuna mai ki a matou

    Tukuna mai to korero ki a matou: