Whakaraupapa Metatranscriptome
Nga waahanga ratonga
● te paheketanga o te rRNA ka whai i te whakarite pukapuka mRNA aronga.
● Whakaraupapa i runga i te Illumina NovaSeq.
Painga Ratonga
●Akohia nga Huringa o nga Hapori Microbial Matatini:Ka puta tenei i te taumata tuhi me te torotoro i nga ira hou.
●Te Whakamarama i nga Mahi a te Hapori Microbial ki te Kaihautu, Taiao ranei.
●Matawhānui Bioinformatic Analysis: Ma tenei e whakaatu he tirohanga mo te taakehatanga hapori me nga titonga mahi, tae atu ki te tātaritanga whakaputanga ira rereke.
●Whakaaturanga Ira Nui:Te whakamahi i nga putunga mahi ira ira mo nga korero korero ira mo nga hapori microbial.
●Tautoko i muri i te hoko:Ko ta matou herenga ka toro atu ki tua atu i te otinga kaupapa me te 3 marama i muri i te hokonga ratonga. I roto i tenei wa, ka tukuna e matou he kaupapa whai ake, he awhina rapurongoa, me nga huihuinga Q&A hei whakatika i nga patai e pa ana ki nga hua.
Whakatakotoranga Ratonga
| Paparanga raupapa | Rautaki Raupapa | Raraunga e taunaki ana | Mana Kounga Raraunga |
| Illumina NovaSeq | PE150 | 12Kb | Q30≥85% |
Nga Whakaritenga Tauira
| Kukū (ng/µL) | Te tapeke (µg) | Rōrahi (µL) | OD260/280 | OD260/230 | RIN |
| ≥50 | ≥1.0 | ≥20 | 1.8-2.0 | 1.0-2.5 | ≥6.5 |
Rere Mahi Ratonga
Te tuku tauira
Te hanga whare pukapuka
Whakaraupapa
Te tātari raraunga
Nga ratonga muri-hoko
Kei roto ko te tātaritanga e whai ake nei:
● Whakaraupapa Mana Kounga Raraunga
● Huihuinga Tuhituhi
● Taxonomic Annotation and Abundance
● Whakaaturanga Mahi me te Awhina
● Te Inenga Whakaaturanga me te Tatautanga Rerekē
Te tohatoha takoha o ia tauira:
Te tātaritanga kanorau Beta: UPGMA
Tuhituhi mahi - Haere nui
Te nui o te taakete rereke - LEFSE
Tuhurahia nga ahunga whakamua i whakahaerea e nga ratonga raupapa tuhinga tuhinga meta a BMKGene na roto i te kohinga whakaputanga.
Lu, Z. et al. (2023) 'Ko te manawanui o te waikawa o nga huakita e whakamahi ana i te lactate o te raupapa Bacteroidales ka whai waahi ki te aukati i te waikawa ruminal i roto i nga koati i urutau ki te kai tino aro nui',Te Kai Kararehe, 14, api 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.
Waiata, Z. et al. (2017) 'Te wetewete i te microbiota mahi matua i roto i te FERMENTATION STOCK-state tuku iho e nga amplicons teitei me te raupapa metatranscriptomics',Frontiers in Microbiology, 8(HUL). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL.
Wang, W. et al. (2022) 'Nga Mycoviruses I kitea mai i te Tirohanga Metatranscriptomics o te Phytopathogenic Alternaria Fungus',Nga huaketo, 14(11), wh. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.
Wei, J. et al. (2022) 'Ko te tātari metatranscriptome whakarara e whakaatu ana i te paheketanga o nga metabolites tuarua o te tipu na te pokai namu me o raatau tohu whekau',Te rāpoi ngota rauropi, 31(15), wh.3999–4016. doi: 10.1111/MEC.16557.
