BMKCloud Log in
条形banner-03

Hua

Te Whakaraupapa Ira Katoa Te Tipu/Karehe

Ko te raupapa-a-ira-ira katoa, e mohiotia ana ko WGS, ka taea te whakaatu i nga rerekee noa me te onge i runga i te ira katoa tae atu ki te Single Nucleotide Polymorphism (SNP), te Whakamuku Whakauru (InDel), te rereketanga o te Hanganga (SV), me te Rerekē Tau Tārua (CNV). ).Ko nga SV he waahanga nui ake o te turanga rereke atu i nga SNP, he nui ake te paanga ki te genome, he nui te paanga ki nga rauropi ora.Ko te panui-roa ka taea te tautuhi tika ake i nga kongakonga nui me nga rereketanga uaua na te mea he maamaa ake te panui o te chromosomal ki nga rohe uaua penei i te tukuruatanga o te tandem, nga rohe whai rawa GC/AT, me nga rohe rerekee.

Paerewa: Illumina, PacBio, Nanopore


Nga Taipitopito Ratonga

Hua Whakaaturanga

Whakaputa Whakaaturanga

1.Ratonga Painga

He wheako nui ki te raupapa ira mo te neke atu i te 1000 momo.

Neke atu i te 800 nga keehi kua whakaputaina me te nui o te paanga whakahiato neke atu i te 4000.

Te tātari bioinformatics matawhānui mo te waea rereke me te tātari mahi.

2. Whakaritenga Ratonga

Paerewa

Whare Pukapuka

E taunakitia ana te hohonutanga

Maramarama

PE 150

Mo te SNP, InDel te waea ≥ 10x

Mo te SV, CNY te waea ≥ 30x

 

 

Nanopore

 

8 kb

Mo te SV, CNY te waea ≥ 20x

Pacbio

CCS

15 kb

Mo te SNP, InDel, SV, CNY te waea ≥ 10x

3. Tauira Whakaritenga

Paerewa

Conc.(ng/μL)

 

Te moni (ng)

 

Maamaa

 

Ko te kara o te Agarose

 

OD260/280

OD260/230

1. Maamaa te roopu matua me te kore he iti raneika kitea te paheketanga i runga i te gel.

2. Karekau, he iti ranei te RNA, te poke pūmua ranei

 

Maramarama

≥1

≥30

 

-

-

Nanopore

 

≥30

Kei runga i te tukunga raraunga

10μg/pūtau

1.7-2.2

≥1.5

Pacbio

CCS

≥50

1.7-2.2

1.8-2.5

4. Te Whakamaramatanga o te Mataora

wps_doc_3

5. Rere Mahi Mahi

tuku tauira

Te tuku tauira

Whakamatau pairati

tangohanga DNA

Te Whakaritenga Whare Pukapuka

Te hanga whare pukapuka

Whakaraupapa

Whakaraupapa

Te tātari raraunga

Te tātari raraunga

数据上传-03

Te tuku raraunga


  • Tōmua:
  • Panuku:

  • 1) Te Tauanga o te Mahere Genome

    Ripanga 1 Te tatauranga o te hua mapi

    wps_doc_5

    Whakaahua 1 Te tohatoha o te rahi whakauru me te panui panui.

    wps_doc_14 wps_doc_6

     

    2) Rapu rereke

    Whakaahua 2 Nga tatauranga me te tuhipoka o SNP/INDEL/SV i waenga i nga Tauira

    wps_doc_7 wps_doc_8

     

    Whakaahua 3 Te tohatoha ira-whanui o nga waahi

    wps_doc_9

    3) Tuhituhi mahi o nga rereketanga

    wps_doc_10 wps_doc_11 wps_doc_12

     

    2019

    Nga korero mo te taiao

    Ko te resequencing-ira-ira katoa e whakaatu ana i te takenga mai o Brassica napus me te waahi ira i whai waahi ki te whakapai ake

    2020

    PNAS

    Te takenga mai o te kukuwhatanga me te hitori o te kainga o te ika koura (Carassius auratus)

    2021

    Te Tuhituhi Biotechnology Plant

    Tohutoro tohutoro o nga momo jute e rua kua whakatipuria

    2021

    Te Tuhituhi Biotechnology Plant

    Nga waitohu ira o te huawhenua me te kakano hinu allopolyploid Brassicajuncea me te waahi ira e whakahaere ana i te whakaemi o nga glucosinolates

    2019

    Tipu Molecular

    Ko te resequence-genome-katoa o te kohinga o te ao katoa o nga whakaurunga rapeseed e whakaatu ana i te putake ira o te rerekeetanga o te momo rauropi.

    2022

    Rangahau Ahuone

    Ko te tātari hononga-a-nui-a-ira e whakaatu ana i nga tirohanga irapoi ki te rereketanga o te rahi o te kakano merengi

    2021

    Journal of Experimental Botany

    Ko te rangahau hononga-a-nui-a-ira e whakaatu ana i nga momo rereke o te GhSAD1 e tuku ana i te maeke makariri i roto i te miro

    2021

    Journal of Experimental Botany

    Ko te rangahau hononga-a-whanui me te whakatairite tuhinga e whakaatu ana i te pukapuka QTL me nga ira kaitono e whakahaere ana i te rahi o te puapua i roto i te rapeseed.

    whiwhi korero

    Tuhia to korero ki konei ka tukuna mai ki a matou

    Tukuna mai to korero ki a matou: