-
Whakaraupapa Metatranscriptome
Ko te raupapa metatranscriptome e whakaatu ana i te whakaputanga ira o nga moroiti (eukaryotes me te prokaryotes) i roto i nga taiao taiao (ara, te oneone, te wai, te moana, te tai, me te punuakau.) Inaa, ma enei ratonga ka taea e koe te tiki i nga whakaaturanga whakaaturanga ira katoa o nga hapori microbial uaua, tātaritanga taake. o nga momo, tātaritanga whakarangatira mahi o nga ira rerekee te whakaatu, me etahi atu.
Paerewa: Illumina NovaSeq Platform
-
Genome harore
Ko te Hangarau Biomarker e whakarato ana i te rangahau ira ira, ira pai me te pene-oti ira o te harore i runga i te whainga rangahau motuhake.Ko te raupapa ira, te huihuinga me te tuhinga mahi ka taea te whakatutuki ma te whakakotahi i te raupapa o muri-whakatupuranga + Te raupapa reanga tuatoru ki te whakatutuki i te huihuinga genome taumata-tiketike.Ka taea hoki te whakamahi hangarau Hi-C hei whakahaere i te huihuinga ira i te taumata chromosome.
Paparanga:PacBio Sequel II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq Platform
-
Nga kete taputapu
Ko te BMKCloud he papaaaao koiora e whakarato ana i te otinga kotahi-mutu mo nga kaupapa genomic, e tino whakaponohia ana e nga kairangahau i roto i nga momo waahi tae atu ki nga rongoa, ahuwhenua, taiao, me etahi atu. Kei te kaha a BMKCloud ki te whakarato i nga ratonga whakauru, pono me te whai hua tae atu ki nga papaaaata rangahau bioinformatic me nga taputapu. , rauemi rorohiko, pātengi raraunga tūmatanui, akoranga ipurangi bioinformtic, aha atu. He maha nga taputapu bioinformatic e whakamahia ana e BMKCloud tae atu ki te tohu ira, nga taputapu ira kukuwhatanga, ncRNA, te mana o te kounga raraunga, te huihuinga, te whakatikatika, te tangohanga raraunga, nga whakarereketanga, nga tatauranga, te hanga ahua, te raupapa. tātari, etc.
-
Bacteria Complete Genome
Ko te Hangarau Biomarker e whakarato ana i te ratonga raupapa mo te hanga ira ira huakita katoa me te kore aputa.Ko te rerenga mahi matua o te huakita kua oti te hanga ira ko te raupapatanga o nga reanga tuatoru, te huihuinga, nga korero mahi me te tātari bioinformatic matatau ki te whakatutuki i nga whaainga rangahau motuhake.Ma te whakakitenga matawhānui o te ira ira huakita e kaha ana ki te whakaatu i nga tikanga taketake kei raro i a raatau mahi koiora, ka taea hoki te whakarato tohutoro nui mo nga rangahau ira i roto i nga momo eukaryotic teitei ake.
Paparanga:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq Platform
PacBio Sequel II
-
RNA iti
Ko nga RNA iti he momo RNA kore-waehere poto me te roa toharite o te 18-30 nt, tae atu ki te miRNA, siRNA me te piRNA.Ko enei RNA iti kua nui te korero kua uru ki roto i nga momo tukanga koiora penei i te whakahekenga o te mRNA, te aukati i te whakamaoritanga, te hanga heterochromatin, me etahi atu. Ko te turanga tātari raupapa he tātari paerewa me te keri raraunga matatau.I runga i te turanga o nga raraunga RNA-seq, ka taea e te tātari paerewa te whakatutuki i te tohu me te matapae miRNA, te matapae ira whainga miRNA, te whakamaarama me te tātari korero.Ka taea e te tātaritanga matatau te rapu me te tangohanga miRNA, te whakaputa hoahoa Venn, te miRNA me te hanga whatunga ira ira.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
Ko te NGS-WGS he papaahanga tātari-a-ira-ira-ira katoa, i whakawhanakehia i runga i te turanga o nga wheako nui ki nga Hangarau Biomarker.Ma tenei papaahi ngawari ki te whakamahi ka taea te tuku tere o te rerenga mahi tātaritanga ma te whakarite noa i etahi tawhā taketake, e tika ana mo nga raraunga raupapa DNA i hangaia mai i te papaaho Illumina me te papa raupapa BGI.Ka tukuna tenei turanga ki runga i te tūmau rorohiko mahi teitei, e whakamana ana i te tātari raraunga tino pai i roto i te wa poto.Kei te waatea te keri raraunga whaiaro i runga i te turanga o te tātaritanga paerewa, tae atu ki te patai ira ira, hoahoa tuatahi PCR, aha atu.
-
mRNA( Tohutoro)
Ko te Transcriptome te hononga i waenga i nga korero ira ira me te paati o te mahi koiora.Ko te whakaritenga taumata whakawhiti te mea tino nui me te tino ako i nga tikanga ture mo nga rauropi.Ka taea e te raupapa tuhinga te whakaraupapa i te tuhinga i nga wa katoa, i raro ranei i tetahi ahuatanga, me te whakatau tika ki te nucleotide kotahi. tauira tuhinga motuhake.
I tenei wa, kua whakamahia nuitia te hangarau raupapa tuhinga i roto i te agronomy, te rongoa me etahi atu mara rangahau, tae atu ki te ture whanaketanga kararehe me te tipu, te urutau taiao, te taunekeneke aukati, te waahi ira, te whanaketanga momo ira me te mate pukupuku me te mate ira.
-
Metagenomics (NGS)
Ko tenei papahanga tātari i hangaia mo te tātari raraunga metagenomic shotgun i runga i nga tau o te wheako.Kei roto ko te rerengamahi whakauru kei roto i nga momo tātaritanga metagenomics e hiahiatia ana tae atu ki te tukatuka raraunga, nga rangahau taumata-momo, nga rangahau taumata-mahinga ira, te whakakao metagenome, me etahi atu. , te whakatakotoranga tawhā, te whakaputa ahua whaiaro, etc.
-
LncRNA
Ko nga RNA kore-waehere roa (lncRNA) he momo tuhi me te roa atu i te 200 nt, kaore e taea te tohu i nga pūmua.Ko nga taunakitanga whakahiato e whakaatu ana ko te nuinga o nga lncRNA ka tino mahi.Ko nga hangarau raupapa teitei me nga taputapu tātari bioinformatic e whakamana ana i a tatou ki te whakaatu i nga raupapa lncRNA me nga korero tuunga kia pai ake, ka arahi i a tatou ki te rapu i nga lncRNA me nga mahi tino nui.Kei te whakahīhī a BMKCloud ki te whakarato ki o taatau kaihoko te papahanga tātari raupapa lncRNA ki te whakatutuki i te tātaritanga lncRNA tere, pono me te ngawari.
-
GWAS
Ko te rangahau hononga ira-whanui (GWAS) e whai ana ki te tautuhi i nga momo ira (genotype) e hono ana ki nga ahuatanga motuhake (phenotype).Ka tirotirohia e nga rangahau a GWA nga tohu ira e whakawhiti ana i te ira tangata katoa me te matapae i nga hononga tohu-ira ma te tātari tauanga i te taumata taupori.Ka kitea pea e te resequencing-ira-ira katoa nga momo ira katoa.Ma te hono me nga raraunga tohu, ka taea te tukatuka GWAS ki te tautuhi i nga SNP e pa ana ki te tohu tohu, nga QTL me nga ira kaitono, e kaha tautoko ana i te whakatipu kararehe/tipu hou.Ko te SLAF he rautaki whakaraupapa ira ira tangata ngawari, e kitea ana nga tohu tohatoha ira-whanui, SNP.Ko enei SNP, hei tohu tohu ira rapoi, ka taea te tukatuka mo nga rangahau hononga me nga ahuatanga kua tohua.He rautaki whai hua ki te tautuhi i nga ahuatanga uaua e pa ana ki nga rereketanga ira.
-
Nanopore Ko nga tuhinga roa-katoa
Ko nga momo ahua rereke me te rereke rereke i roto i nga rauropi he tikanga ira nui hei whakahaere i te whakaputanga ira me te kanorau pūmua.Ko te tautuhi tika o nga hanganga tuhinga te putake mo te rangahau hohonu o nga tauira ture whakaputa ira.Ko te papa raupapa raupapa Nanopore kua angitu te kawe mai i te rangahau whakawhiti ki te taumata-isoform.I hoahoatia tenei papahanga tātari hei tātari i nga raraunga RNA-Seq i hangaia i runga i te papaapapa Nanopore i runga i te turanga o te tohutoro tohutoro, e tutuki ana i nga tātaritanga kounga me te ine i roto i te taumata ira me te taumata tuhinga.
-
porowhita-RNA
Ko te RNA porowhita(circRNA) he momo RNA kore-waehere, ka kitea nei he mahi nui i roto i nga kupenga ture e whai waahi ana ki te whakawhanake, te aukati i te taiao, me era atu. He rereke mai i nga ngota ngota RNA raina, hei tauira mRNA, lncRNA, 3' me te 5' ka honoa nga pito o te circRNA ki te hanga i te hanganga porowhita, e ora ai i te nakunaku o te exonuclease me te noho pumau atu i te nuinga o te RNA raina.Kua kitea nga mahi rereke a CircRNA ki te whakahaere i te whakaaturanga ira.Ka taea e CircRNA te mahi hei ceRNA, e herea ana te miRNA whakataetae, e mohiotia ana ko te hautai miRNA.Ka whakamanahia e te papahanga tātari raupapa CircRNA te hanganga circRNA me te tātari korero, te matapae whaainga me te tātari tahi me etahi atu momo ngota ngota RNA
