Производи

Секвенционирање на ДНК/РНК – Секвенционер на нанопори

Секвенционирање на ДНК/РНК – Избрана слика за секвенционер на нанопори

ONT секвенционирањето е технологија за секвенционирање на електрични сигнали во реално време со една молекула базирана на нанопори, принципот на секвенционирање на секоја платформа е ист.Двоверижна ДНК/РНК ќе се поврзе со нанопорозниот протеин вграден во биофилмот и ќе се одмотува под водството на моторниот протеин, под дејство на напонската разлика од двете страни на биофилмот, нишките ДНК/РНК поминуваат низ протеинот на нанопорниот канал на одредено стапка.Поради разликите во хемиските својства на различните бази на жицата ДНК/РНК, кога една база или ДНК молекула поминува низ каналот на нанопори, тоа ќе предизвика промена на различни електрични сигнали.Со откривање и одговарање на овие сигнали, може да се пресметаат соодветните типови на бази и да се заврши откривањето на низата во реално време.

Контактирајте не

Детали за услугата

Демо резултат

Детали за услугата Карактеристики

Платформа	Големина на библиотеката	Теоретски принос на податоци (по клетка)	Точност со една основа	Апликации
Нанопор	8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR	70-90 Gb / ќелија	85-92%	Повикување SV, De novo, Секвенционирање со целосна должина, Iso-Seq, Прибелешка на гени, Откривање на метилација на ДНК

Предности на услугата

● Повеќе од 5 години искуство на платформата за секвенционирање PacBio со илјадници затворени проекти со различни видови.
● BMKGENE е официјален партнер на Oxford Nanopore, со двојна платформа RNA/DNA сертификат.
● Постојат мејнстрим модели на секвенционери со комплетна опрема и доволна пропусност на секвенционирање.
● Врз основа на платформата Nanopore, повеќе од 10 истражувања на Denovo за животни и растенија се објавени во меѓународно реномирани списанија.

Примерок барања

Тип на примерок

износ

Концентрација (Qubit ®)

Волумен

Чистота

Други

Геномска ДНК

Зависи од барањето податоци

≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1,5;

Чист врв на 260 nm, без контаминации

Концентрацијата треба да се мери со Qubit и Qubit/Nanopore ≤ 2

Вкупна РНК

≥1,2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5; нема контаминации

Вредност на RIN ≥7,5

Работен тек на услугата

Подготовка на примерок

Изградба на библиотека

Секвенционирање

Анализа на податоци

Испорака на проектот

Претходно: Секвенционирање на ДНК/РНК – Секвенционер на Илумина

Следно: Секвенционирање на фрагменти засилени со специфичен локус (SLAF-Seq)

Проценка на квалитетот на податоците на примерокот на ДНК

Табела 1. Статистика за чисти податоци.

BMKID	rawSeqNum	rawSumBase	cleanSeqNum	cleanSumBase	чист N50 Лен	чист N90 Лен	cleanMeanLen	cleanMaxLen	cleanMeanQual
DNA_BMK01	1.218.239	26.37	1.121.736	25,90 часот	28.014	15.764	23.090	143.181	9

Проценка на квалитетот на податоците на примерокот на РНК

Табела 1. Статистика за чисти податоци.

Име на датотека	ИД на клиентот	Прочитано бр	Основен бр	N50	Средна должина	Максимална должина	MeanQscore
RNA_BMK001	C2	8.947.708	4.047.230.083	398	452	129.227	П12