Производи

Секвенционирање на ДНК/РНК - секвенсер на нанопор

Секвенционирање на ДНК/РНК - Нанопоре секвенсер Извршена слика

Секвенционирањето на ONT е единечна технологија за секвенционирање на електрични сигнали во реално време, базирана на нанопори, принципот на секвенционирање на секоја платформа е ист. ДНК/РНК со двојно влакно ќе се врзува за нанопорозен протеин вграден во биофилмот и да се одвикне под олово на моторниот протеин, под дејство на напон разлика од двете страни на биофилмот, ДНК/РНК-низите минуваат низ протеинот на каналот на нанопоре во одредена стапка. Поради разликите во хемиските својства на различните основи на влакната на ДНК/РНК, кога единечна база или ДНК молекула минува низ каналот нанопоре, тоа ќе предизвика промена на различни електрични сигнали. Со откривање и одговара на овие сигнали, може да се пресметаат соодветните типови бази, а може да се заврши откривањето на секвенцата во реално време.

Контактирајте не

Детали за услугата

Демо резултат

Карактеристики на детали за услугата

Платформа	Големина на библиотеката	Теоретски принос на податоци (по ќелија)	Едно-базна точност	Апликации
Нанопор	8kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR	70-90 GB/ќелија	85-92%	SV Calling, De Novo, секвенционирање со целосна должина, ISO-Seq, прибележување на гени, откривање на метилација на ДНК

Предности на услугата

● Над 5 години искуство на платформата за секвенционирање на Pacbio со илјадници затворени проекти со разни видови.
● BMKGene е официјален партнер на Оксфорд Нанопор, со двојна платформа РНК/ДНК сертификација.
● Постојат мејнстрим модели на секвенци со целосна опрема и доволен проток на секвенционирање.
● Врз основа на платформата нанопор, објавени се повеќе од 10 истражувања за животни и растителни деново во меѓународно реномирани списанија.

Барања за примероци

Тип на примерок

Количина

Концентрација (qubit ®)

Волумен

Чистота

Други

Геномска ДНК

Зависи од барањата за податоци

≥ 20ng/μl

≥15μl

OD260/280 = 1,7-2.2;

OD260/230≥1.5

Јасен врв на 260 nm ， нема загадувања

Концентрацијата треба да се мери со qubit и qubit/nanopore ≤ 2

Вкупно РНК

.21,2 μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280 = 1,7-2,5;

OD260/230 = 0,5-2,5 ； Без загадувања

Вредност на Рин ≥7,5

Услужен проток на работа

Подготовка на примерок

Библиотека изградба

Секвенцирање

Анализа на податоците

Испорака на проектот

Претходно: Илумина претходно изработени библиотеки

Следно: Специфично-локус засилен секвенционирање на фрагменти (SLAF-Seq)

Проценка на квалитетот на податоците на примерокот на ДНК

Табела 1. Статистика за чисти податоци.

Bmkid	RawSeqnum	Rawsumbase	CleanseQnum	Cleansumbase	Cleann50len	Cleann90len	CleanMeanlen	CleanMaxlen	CleanMeanqual
DNA_BMK01	1.218.239	26,37	1.121.736	25,90	28.014	15.764	23,090	143.1181	9

Проценка на квалитетот на податоците на примерокот на РНК

Табела 1. Статистика за чисти податоци.

Име на датотека	Клиентид	ReadNum	Басенум	N50	Lindl length	Максимална должина	MeanqScore
RNA_BMK001	C2	8.947.708	4.047.230.083	398	452	129,227	П12