Производи

Секвенцирање на ДНК/РНК – секвенцер на нанопори

Секвенцирање на ДНК/РНК – Нанопорен секвенцер Препорачана слика

ONT секвенционирањето е технологија за секвенционирање на електрични сигнали во реално време со една молекула, базирана на нанопори, а принципот на секвенционирање на секоја платформа е ист. Двоверижната ДНК/РНК ќе се врзе за нанопорозниот протеин вграден во биофилмот и ќе се одмотува под водство на моторниот протеин, под дејство на разликата во напонот од двете страни на биофилмот, ДНК/РНК нишките минуваат низ протеинот на нанопорниот канал со одредена брзина. Поради разликите во хемиските својства на различните бази на ДНК/РНК нишката, кога една база или молекула на ДНК поминува низ каналот на нанопорите, тоа ќе предизвика промена на различните електрични сигнали. Со откривање и кореспондирање со овие сигнали, може да се пресметаат соодветните типови бази и може да се заврши откривањето на секвенцата во реално време.

Контактирајте не

Детали за услугата

Резултат од демо-резонацијата

Детали за услугата Карактеристики

Платформа	Големина на библиотеката	Теоретски принос на податоци (по ќелија)	Точност на една база	Апликации
Нанопори	8Kb, 10kb, 20kb, Ултрадолго, cDNA-PCR	70-90Gb/ќелија	85-92%	SV повикување, De novo, секвенционирање со целосна должина, Iso-Seq, генска анотација, откривање на метилација на ДНК

Предности на услугата

● Над 5 години искуство на платформата за секвенционирање PacBio со илјадници затворени проекти со различни видови.
● BMKGENE е официјален партнер на Oxford Nanopore, со двојна платформа за РНК/ДНК сертификација.
● Постојат мејнстрим модели на секвенцери со комплетна опрема и доволен проток на секвенционирање.
● Врз основа на платформата Nanopore, повеќе од 10 истражувања на Denovo за животни и растенија се објавени во меѓународно реномирани списанија.

Примерни барања

Тип на примерок

Износ

Концентрација (Qubit ®)

Јачина на звук

Чистота

Други

Геномска ДНК

Зависи од барањата за податоци

≥20 нг/μл

≥15 μl

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1,5;

Јасен врв на 260 nm, без контаминација

Концентрацијата треба да се мери со Qubit и Qubit/Nanopore ≤ 2

Вкупна РНК

≥1,2 μg

≥100 μg/μl

≥15 μl

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5; без контаминација

Вредност на RIN ≥7,5

Работен тек на услугата

Подготовка на примероци

Изградба на библиотека

Секвенционирање

Анализа на податоци

Испорака на проектот

Претходно: Готови библиотеки на Illumina

Следно: Секвенционирање на специфичен локус со засилени фрагменти (SLAF-Seq)

Проценка на квалитетот на податоците од примерокот на ДНК

Табела 1. Статистика за чисти податоци.

БМКИД	rawSeqNum	rawSumBase	cleanSeqNum	cleanSumBase	cleanN50Len	cleanN90Len	cleanMeanLen	cleanMaxLen	cleanMeanQual
DNA_BMK01	1.218.239	26.37	1.121.736	25,90	28.014	15.764	23.090	143.181	9

Проценка на квалитетот на податоците од примерокот на РНК

Табела 1. Статистика за чисти податоци.

Име на датотека	ИД на клиентот	ЧитајБрој	BaseNum	N50	Средна должина	Максимална должина	Среден резултат
RNA_BMK001	C2	8.947.708	4.047.230.083	398	452	129.227	Q12