ØВисоко искуство: Преку 200.000 примероци се обработени во BMK кои покриваат различни типови примероци, вклучувајќи клеточна култура, ткиво, телесни течности итн. и над 7.000 проекти mRNA-Seq затворени кои покриваат различни области на истражување.
ØСтрог систем за контрола на квалитетот: Основните контролни точки за квалитет низ сите чекори, вклучувајќи подготовка на примерок, подготовка на библиотека, секвенционирање и биоинформатика се под строг мониторинг со цел да се дадат висококвалитетни резултати.
ØДостапни се повеќе бази на податоци за прибелешки за функции и студии за збогатување за исполнување на различни истражувачки цели.
ØУслуги по продажба: Услугите по продажбата важат 3 месеци по завршувањето на проектот, вклучувајќи следење на проекти, решавање проблеми, прашања и одговори на резултатите итн.
Библиотека | Стратегија за секвенционирање | Препорачани податоци | Контрола на квалитет |
Поли А збогатен | Illumina PE150 | 6 GB | Q30≥85% |
Нуклеотиди:
Чистота | Интегритет | износ |
OD260/280≥1,7-2,5 OD260/230≥0,5-2,5Ограничена или никаква контаминација на протеини или ДНК е прикажана на гелот. | За растенија: RIN≥6,5;За животни: RIN≥7;28S/18S≥1,0;ограничена или без основна височина | Конц.≥30 ng/μl;Волумен ≥ 10 μl;Вкупно ≥ 1,5 μg |
Ткиво: Тежина (суво):≥ 1 g
*За ткиво помало од 5 mg, препорачуваме да се испрати флеш замрзнато (во течен азот) примерок од ткиво.
Клеточна суспензија:Број на клетки = 3×106- 1×107
*Препорачуваме да се испорача замрзнат клеточен лизат.Во случај таа ќелија да брои помала од 5×105, се препорачува блиц замрзната во течен азот, што е подобро за микро екстракција.
Примероци од крв:Волумен≥1 ml
Микроорганизам:Маса ≥ 1 g
Контејнер: Цевче за центрифуга од 2 ml (не се препорачува лимена фолија)
Обележување на примерокот: Група + реплика на пр. A1, A2, A3;Б1, Б2, Б3... ...
Испорака:
Биоинформатика
Еукариотски Работен тек на анализа на секвенционирање на mRNA
Биоинформатика
ØКонтрола на квалитетот на необработените податоци
ØРеферентно усогласување на геномот
ØАнализа на структурата на преписот
ØКвантификација на изразот
ØАнализа на диференцијални изрази
ØПрибелешка и збогатување на функцијата
1.mRNA крива на заситеност на податоци
2.Анализа на диференцијални изрази-Вулканска парцела
3.KEGG прибелешка на DEG
4.GO класификација на DEG