Еволутивна генетика
Предности на услугата
Такаги и др.,Весник на растенија, 2013 година
●Сеопфатна биоинформатичка анализа:Овозможување на проценка на генетска разновидност, што го рефлектира еволутивниот потенцијал на видовите и откривање на сигурна филогенетска врска помеѓу видовите со минимизирано влијание на конвергентна еволуција и паралелна еволуција
●Факултативна прилагодена анализа: како што е проценката на времето и брзината на дивергенција врз основа на варијации на ниво на нуклеотид и аминокиселини.
●Широка експертиза и евиденција за објавување: BMKgene има акумулирано масовно искуство во популацијата и еволутивните генетика проекти повеќе од 15 години, опфаќајќи илјадници видови, итн. И придонесе за над 1000 проекти на високо ниво објавени во природни комуникации, молекуларни растенија, списание за биотехнологија на растенијата, итн.
● Високо квалификуван тим за биоинформатика и циклус на кратки анализи: Со големо искуство во напредната анализа на геномиката, тимот на БМКГЕНЕ дава сеопфатни анализи со брзо време на пресврт.
● Поддршка за пост-продажба:Нашата заложба се протега надвор од завршувањето на проектот со 3-месечен период на услуга по продажба. За тоа време, ние нудиме следење на проектот, помош за смена на проблеми и сесии за Q&A за решавање на какви било прашања поврзани со резултатите.
Спецификации и барања за услуги
| Вид на секвенционирање | Препорачана скала на население | Стратегија за секвенцирање | Барања за нуклеотид |
| Секвенционирање на целото геном | ≥ 30 лица, со 10 лица од секоја подгрупа
| 10x | Концентрација: ≥ 1 ng/ μL Вкупна количина 20ng Ограничена или без деградација или загадување |
| Засилен фрагмент од специфичен локус (SLAF) | Длабочина на ознаката: 10x Број на ознаки: <400 MB: се препорачува WGS <1 GB: 100K ознаки 1 GB > 2 GB: 300K ознаки Макс 500к ознаки | Концентрација ≥ 5 ng/μL Вкупна количина ≥ 80 ng Nanodrop OD260/280 = 1,6-2.5 Агарозен гел: Не или ограничена деградација или загадување
|
Проток на работа на услуги
Дизајн на експерименти
Испорака на примерок
Библиотека изградба
Секвенцирање
Анализа на податоците
Услуги по продажба
Услугата вклучува анализа на структурата на населението (филогенетско дрво, ПЦА, табела за стратификација на населението), разновидност на населението и избор на популација (нерамнотежа на врската, селективна избирање на поволни места). Услугата исто така може да вклучува прилагодена анализа (на пр. Време на дивергенција, проток на гени).
*Демо резултатите прикажани овде се сите од геномите објавени со BMKgene
1. Анализата на револуцијата содржи конструкција на филогенетско дрво, структура на население и ПЦА врз основа на генетски варијации.
Филогенетското дрво претставува таксономски и еволутивни односи меѓу видови со обичен предок.
ПЦА има за цел да ја визуелизира блискоста помеѓу под-популациите.
Структурата на населението покажува присуство на генетски различна под-популација во однос на алелните фреквенции.
Чен, Ет. ал.,Pnas, 2020 година
2.селективен замав
Селективниот замав се однесува на процес со кој е избрана поволна локација и се зголемуваат фреквенциите на поврзаните неутрални места и оние на неискористените места се намалени, што резултира во намалување на регионалните.
Откривање на геном ширум геном на селективните региони на метеж се обработува со пресметување на генетскиот индекс на население （π ， fst, tajima's d) на сите СНП во рамките на лизгачкиот прозорец (100 kb) на одреден чекор (10 kb).
Разновидност на нуклеотид (π
Таџима г.
Индекс на фиксација (FST)
Ву, Ет. ал.,Молекуларно растение, 2018 година
3.еген проток
Ву, Ет. ал.,Молекуларно растение, 2018 година
4.демографска историја
Angанг, Ет. ал.,Природна екологија и еволуција, 2021 година
5. Време на дивергенција
Angанг, Ет. ал.,Природна екологија и еволуција, 2021 година
Истражете ги напредокот олеснети од еволутивните услуги за генетика на BMKgene преку курирана колекција на публикации:
Хасаниар, Ак и др. (2023) „Откривање на молекуларни маркери на СНП и гени на кандидати поврзани со отпорност на вирусот SACBROOD кај ларвите APIS Cerana Cerana од страна на целиот геном,“,Меѓународен весник на молекуларни науки, 24 (7). doi: 10.3390/IJMS24076238.
Chai, J. et al. (2022) „Откривање на див, генетски чист кинески гигант Саламандер создава нови можности за зачувување“,Зоолошко истражување, 2022, том. 43, број 3, страници: 469-480, 43 (3), стр. 469–480. doi: 10.24272/j.issn.2095-8137.2022.101.
Хан, М. и др. (2022) „Филогеографска шема и еволуција на населението Историја на домородниот Елимус Сибирикус Л. на платото Кингхаи-Тибетан“,Граници во растителна наука, 13, стр. 882601. Doi: 10.3389/fpls.2022.882601/bibtex.
Wang, J. et al. (2022) „Геномски увид во еволуцијата на Лонган од склопување на геном на ниво на хромозом и геномика на населението на пристапот на Лонсан“,Истражување на хортикултура, 9. doi: 10.1093/hr/uhac021.
