Долго некодирање на секвенционирање - Illumina
Предности на услугата
●Заедничка анализа на mRNA и lncRNAСо комбинирање на квантификацијата на транскриптите на mRNA со проучувањето на lncRNA и нивните цели, можно е да се добие длабински преглед на регулаторниот механизам што лежи во основата на клеточниот одговор.
●Обемна експертизаОбработевме над 230.000 примероци, опфаќајќи различни цели на примероци и проекти. Внесуваме богатство од експертиза во секој проект.
●Заедничка анализа на mRNA и lncRNAЈа комбинираме квантификацијата на транскриптите на mRNA со проучувањето на lncRNA и нивните цели, што овозможува да се добие длабински преглед на регулаторниот механизам што лежи во основата на клеточниот одговор.
●Ригорозна контрола на квалитетотНие имплементираме основни контролни точки во сите фази, од подготовка на примероци до подготовка на библиотека, секвенционирање и биоинформатика. Нашето прецизно следење гарантира испорака на конзистентно висококвалитетни резултати.
●Сеопфатна анотацијаКористиме повеќе бази на податоци за функционално анотирање на диференцијално експресираните гени (DEG) и извршување на соодветни анализи за збогатување. Овој сеопфатен пристап дава увид во клеточните и молекуларните процеси што лежат во основата на транскриптомскиот одговор, осигурувајќи дека ќе ги добиете сите можни информации за податоците од вашиот експеримент.
●Поддршка по продажбатаРазбираме колку е важно да бидеме присутни, затоа нашата посветеност се протега и по завршувањето на проектот со 3-месечен постпродажен период на услуга. Во овој период, нудиме следење на проектот, помош при решавање проблеми и сесии со прашања и одговори за да одговориме на сите прашања поврзани со резултатите.
Потребни примероци и испорака
| Библиотека | Платформа | Препорачани податоци | Квалитет на податоци |
| rRNA исцрпена насочена библиотека | Илумина PE150 | 10-16 ГБ | Q30≥85% |
Нуклеотиди:
| Концентрација (ng/μl) | Количина (μg) | Чистота | Интегритет |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Ограничена или никаква контаминација со протеини или ДНК е прикажана на гелот. | RIN≥6,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; ограничено или никакво покачување на базалната линија |
● Растенија:
Корен, стебло или ливче: 450 мг
Лист или семе: 300 мг
Овошје: 1,2 г
● Животно:
Срце или црева: 450 мг
Високи органи или мозок: 240 мг
Мускули: 600 мг
Коски, коса или кожа: 1,5 г
● Членконоги:
Инсекти: 9 г
Ракови: 450 мг
● Цела крв:2 цевки
● Клетки: 106 клетки
● Серум и плазма: 6 мл
Препорачана достава на примероци
Контејнер: центрифугална епрувета од 2 ml (не се препорачува употреба на лимена фолија)
Означување на примероци: Групирај+повтори на пр. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Испорака:
1. Сув мраз: Примероците треба да се спакуваат во кеси и да се закопуваат во сув мраз.
2. РНК-стабилни епрувети: Примероците на РНК може да се сушат во епрувета за стабилизација на РНК (на пр. RNAstable®) и да се испратат на собна температура.
Тек на работа на услугата
Дизајн на експеримент
Достава на примероци
Екстракција на РНК
Изградба на библиотека
Секвенционирање
Анализа на податоци
Постпродажни услуги
Биоинформатика
- Сурови податоци
- Квалитет на податоци
- Усогласување на геномот
- Структура на гени (алтернативно сплајсирање, оптимизација на структурата на гени и предвидување на нови гени)
- Квантификација на генската експресија
- Анализа на диференцијална експресија
- DEG анотација и збогатување + Диференцијално експресирани lncRNA целни гени
- Идентификација на транскрипт
- Идентификација на lncRNA (конзервација на lncRNA и позната lncRNA)
- Предвидување на целните гени на lncRNA
- Квантификација на експресијата на lncRNA
- Заедничка анализа со податоци од mRNA
Анализа на диференцијална генска експресија (DEGs)
Квантификација на експресијата на lncRNA – кластерирање
Збогатување на целните гени на lncRNA
Анализа на позицијата на заедничката mRNA и lncRNA – графикон на Circos (средниот круг е mRNA, а внатрешниот круг е lncRNA)
Истражете ги напредоците овозможени од услугите за еквенцирање на lncRNA на BMKGene преку курирана колекција на публикации.
Џи, Х. и др. (2020) „Идентификација, функционално предвидување и клучна верификација на lncRNA на lncRNA поврзани со студен стрес кај црн дроб на стаорци“,Научни извештаи2020 10:1, 10(1), стр. 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Џиа, З. и др. (2021) „Интегративната транскриптомска анализа го открива имунолошкиот механизам за сој од обичен крап отпорен на CyHV-3“,Граници во имунологијата, 12, стр. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Ванг, XJ и др. (2022) „Приоритизација базирана на мулти-омична интеграција на конкурентските ендогени регулаторни мрежи на РНК кај ситноклеточен рак на белите дробови: Молекуларни карактеристики и кандидати за лекови“,Граници во онкологијата, 12, стр. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xiao, L. et al. (2020) „Генетска дисекција на мрежата на коекспресија на гени што лежи во основата на фотосинтезата кај Populus“,Весник за растителна биотехнологија, 18(4), стр. 1015–1026. doi: 10.1111/PBI.13270.
Женг, Х. и др. (2022) „Глобална регулаторна мрежа за дисрегулирана генска експресија и абнормална метаболичка сигнализација во имуните клетки во микросредината на Грејвсова болест и Хашимотов тироидитис“,Граници во имунологијата, 13, стр. 879824. дои: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
