-
Метагеномско секвенционирање (NGS)
Метагеномот се однесува на збирка од вкупен генетски материјал од мешана заедница на организми, како што се метагеном на животната средина, човечки метагеном, итн. Содржи геноми на микроорганизми што можат да се одгледуваат и не се одгледуваат.Метагеномското секвенционирање е молекуларна алатка која се користи за анализа на мешаните геномски материјали извлечени од примероците од животната средина, што обезбедува детални информации за разновидноста и изобилството на видовите, структурата на популацијата, филогенетскиот однос, функционалните гени и корелацијата мрежа со факторите на животната средина.
Платформа:Illumina NovaSeq6000
-
Метагеномско секвенционирање-Нанопор
Метагеномијата е молекуларна алатка која се користи за анализа на мешаните геномски материјали извлечени од примероци од животната средина, која обезбедува детални информации за разновидноста и изобилството на видовите, структурата на популацијата, филогенетскиот однос, функционалните гени и мрежата на корелација со факторите на животната средина итн. Платформите за секвенционирање нанопори неодамна беа воведени до метагеномски студии.Неговите извонредни перформанси во должината на читање во голема мера ја подобрија метагеномската анализа на долниот тек, особено склопувањето на метагеномот.Искористувајќи ги предностите на должината на читање, метагеномската студија заснована на Нанопор може да постигне поконтинуирано склопување во споредба со метагеномијата на пушки.Објавено е дека метагеномијата базирана на Nanopore успешно генерира целосни и затворени бактериски геноми од микробиомите (Moss, EL, et. al.,Nature Biotech, 2020)
Платформа:Nanopor PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Подединицата на 16S и 18S rRNA која содржи и високо конзервирани и хиперпроменливи региони е совршен молекуларен отпечаток за идентификација на прокариотски и еукариотски организми.Искористувајќи ги предностите на секвенционирањето, овие ампликони може да се таргетираат врз основа на зачуваните делови и хиперпроменливите региони можат целосно да се карактеризираат за микробна идентификација што придонесува за студии кои покриваат анализа на микробиолошка разновидност, таксономија, филогенеја, итн. Едномолекула во реално време (SMRT ) секвенционирањето на платформата PacBio овозможува добивање на високо прецизни долги отчитувања, кои би можеле да покриваат ампликони со целосна должина (приближно 1,5 Kb).Проширениот поглед на генетското поле значително ја подобри резолуцијата во прибелешката на видовите во заедницата на бактерии или габи.
Платформа:Продолжение на PacBio II
-
16S/18S/ITS Секвенционирање на засилувачи-NGS
Секвенционирањето на ампликони 16S/18S/ITS има за цел да ја открие филогенијата, таксономијата и изобилството на видови во микробната заедница со истражување на PCR производи на генетски маркери за домаќинство кои содржат и високоразговорени и хиперпроменливи делови.Воведувањето на овие совршени молекуларни отпечатоци од страна на Woeses et al, (1977) го поттикнува профилирањето на микробиомот без изолација.Секвенционирањето на 16S (бактерии), 18S (габи) и внатрешен транскрибиран простор (ITS, габи) овозможува идентификација на обилните видови, како и на ретки и неидентификувани видови.Оваа технологија стана широко применета и главна алатка за идентификација на диференцијален микробен состав во различни средини, како што се човечка уста, црева, измет итн.
Платформа:Illumina NovaSeq6000
-
Повторно секвенционирање на целиот геном на бактериски и габички
Повторното секвенционирање на целиот геном на бактерии и габи е критична алатка за комплетирање на геномите на познати бактерија и габи, како и за споредување на повеќе геноми или за мапирање на геномите на нови организми.Од голема важност е да се секвенционираат цели геноми на бактерија и габи со цел да се генерираат точни референтни геноми, да се направи микробиолошка идентификација и други компаративни студии на геномот.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
-
Габичен геном
Технологиите на биомаркери обезбедуваат истражување на геномот, фин геном и целосен геном на пена на габи во зависност од специфичната цел на истражувањето.Секвенционирањето на геномот, склопувањето и функционалната прибелешка може да се постигнат со комбинирање на секвенционирање од следната генерација + секвенционирање од трета генерација за да се постигне склопување на геном на високо ниво.Технологијата Hi-C, исто така, може да се користи за да се олесни склопувањето на геномот на ниво на хромозом.
Платформа:Продолжение на PacBio II
Nanopor PromethION P48
Illumina NovaSeq 6000
-
Целосен геном на бактерии
Биомаркер Технолоџис обезбедува услуга за секвенционирање за конструирање на целосен геном на бактерии со нула празнина.Главниот работен тек на комплетната конструкција на геномот на бактерии вклучува секвенционирање од трета генерација, склопување, функционална прибелешка и напредна биоинформатска анализа што исполнува специфични истражувачки цели.Посеопфатното профилирање на геномот на бактериите го поттикнува откривањето на фундаменталните механизми кои се во основата на нивните биолошки процеси, што исто така може да обезбеди вредна референца за геномски истражувања кај повисоките еукариотски видови
Платформа:Nanopor PromethION P48 + Illumina NovaSeq 6000
Продолжение на PacBio II
