Секвенционирање на мала РНК - Illumina
Карактеристики
● Подготовка на библиотека за избор на големина.
● Биоинформатичка анализа фокусирана на предвидување и цели на miRNA.
Предности на услугата
●Обемна експертизаОбработевме над 300 примероци, опфаќајќи различни типови примероци. Внесуваме богатство од експертиза во секој проект.
●Ригорозна контрола на квалитетотНие имплементираме основни контролни точки во сите фази, од подготовка на примероци до подготовка на библиотека, секвенционирање и биоинформатика. Нашето прецизно следење гарантира испорака на конзистентно висококвалитетни резултати.
●Сеопфатна биоинформатичка анализа:Овозможува идентификација и на познати и на нови miRNA, идентификација на целите на miRNA и соодветна функционална анотација и збогатување со повеќе бази на податоци (KEGG, GO).
●Поддршка по продажбатаРазбираме колку е важно да бидеме присутни, затоа нашата посветеност се протега и по завршувањето на проектот со 3-месечен постпродажен период на услуга. Во овој период, нудиме следење на проектот, помош при решавање проблеми и сесии со прашања и одговори за да одговориме на сите прашања поврзани со резултатите.
Потребни примероци и испорака
| Библиотека | Платформа | Препорачани податоци | Квалитет на податоци |
| Избрана големина | Илумина SE50 | 10M-20M читања | Q30≥85% |
Примерок Потребни ...
Нуклеотиди:
| Концентрација (ng/μl) | Количина (μg) | Чистота | Интегритет |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Ограничена или никаква контаминација со протеини или ДНК е прикажана на гелот. | RIN≥6,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; ограничено или без покачување на базалната линија |
● Растенија:
Корен, стебло или ливче: 450 мг
Лист или семе: 300 мг
Овошје: 1,2 г
● Животно:
Срце или црева: 450 мг
Високи органи или мозок: 240 мг
Мускули: 600 мг
Коски, коса или кожа: 1,5 г
● Членконоги:
Инсекти: 9 г
Ракови: 450 мг
● Цела крв: 2 цевки
● Клетки: 106 клетки
● Серум и плазма:6 мл
Препорачана достава на примероци
Контејнер: центрифугална епрувета од 2 ml (не се препорачува употреба на лимена фолија)
Означување на примероци: Групирај+повтори на пр. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Испорака:
1. Сув мраз: Примероците треба да се спакуваат во кеси и да се закопуваат во сув мраз.
2. РНК-стабилни епрувети: Примероците на РНК може да се сушат во епрувета за стабилизација на РНК (на пр. RNAstable®) и да се испратат на собна температура.
Тек на работа на услугата
Дизајн на експеримент
Достава на примероци
Екстракција на РНК
Изградба на библиотека
Секвенционирање
Анализа на податоци
Постпродажни услуги
Биоинформатика
● Контрола на квалитетот на суровите податоци
● Класификација на мала РНК
● анализа на експресија на miRNA и диференцијална експресија
● анотација на целниот ген на miRNA и диференцијално експресиран целен ген на miRNA
● Анотација на целниот ген и диференцијално експресирано збогатување на функцијата на miRNA генот
Идентификација на miRNA: структура и длабочина
Диференцијална експресија на miRNA – хиерархиско групирање
Функционална анотација на целта на диференцијално експресирани miRNAs
Истражете ги истражувачките достигнувања олеснети од услугите за секвенционирање на sRNA на BMKGene преку курирана колекција на публикации.
Чен, Х. и др. (2023) „Вирусните инфекции ја инхибираат биосинтезата на сапонини и фотосинтезата кај Panax notoginseng“,Физиологија и биохемија на растенијата, 203, стр. 108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Ли, Х. и др. (2023) „Протеинот FREE1 што содржи растителен FYVE домен се поврзува со компонентите на микропроцесорот за да ја потисне биогенезата на miRNA“,Извештаи на EMBO, 24 (1). doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Ју, Ј. и др. (2023) „МикроРНК Ame-Bantam-3p го контролира развојот на ларвалните кукли со таргетирање на генот 8 за повеќекратни домени слични на епидермалниот фактор на раст (megf8) кај медоносната пчела, Apis mellifera“,Меѓународно списание за молекуларни науки, 24(6), стр. 5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al. (2018) „Интегрираната анализа на MiRNA и гените поврзани со квалитетот на месото открива дека Gga-MiR-140-5p влијае на интрамускулната таложење на масти кај кокошките“,Клеточна физиологија и биохемија, 46 (6), стр. 2421-2433. doi: 10.1159/000489649.
