Секвенционирање на мала РНК-Илумина
Карактеристики
● Избор на големина на РНК пред подготовка на библиотеката
● Биоинформатска анализа фокусирана околу предвидувањето на miRNA и нивните цели
Предности на услугата
●Сеопфатна биоинформатичка анализа:овозможување идентификација на познати и нови miRNA, идентификација на цели на miRNA и соодветна функционална прибелешка и збогатување со повеќе бази на податоци (KEGG, GO)
●Ригорозна контрола на квалитетот: ги имплементираме основните контролни точки во сите фази, од подготовка на примерок и библиотека до секвенционирање и биоинформатика.Овој прецизен мониторинг обезбедува испорака на конзистентно висококвалитетни резултати.
●Пост-продажна поддршка: Нашата посветеност се протега надвор од завршувањето на проектот со 3-месечен период на услуга по продажбата.Во ова време, нудиме следење на проектот, помош за решавање проблеми и сесии за прашања и одговори за да одговориме на какви било прашања поврзани со резултатите.
●Широка експертиза: со досие за успешно затворање на повеќе проекти за sRNA кои покриваат над 100 видови во различни истражувачки домени, нашиот тим носи богато искуство во секој проект.
Примерок барања и испорака
| Библиотека | Платформа | Препорачани податоци | КК на податоци |
| Избрана е големина | Illumina SE50 | 10M-20M се чита | Q30≥85% |
Барања за примероци:
Нуклеотиди:
| Конц.(ng/μl) | Количина (μg) | Чистота | Интегритет |
| ≥ 80 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Ограничена или никаква контаминација на протеини или ДНК е прикажана на гелот. | RIN≥6,5; 5,0≥28S/18S≥1,0; ограничена или без основна елевација |
● Растенија:
Корен, стебло или ливче: 450 mg
Лист или семе: 300 mg
Овошје: 1,2 гр
● Животно:
Срце или црево: 450 mg
Висцера или мозок: 240 mg
Мускули: 600 mg
Коски, коса или кожа: 1,5 g
● Членконоги:
Инсекти: 9гр
Рака: 450 mg
● Цела крв: 2 цевки
● Клетки: 106 клетките
● Серум и плазма:6 мл
Препорачана испорака на примероци
Контејнер:
Центрифуга епрувета од 2 ml (не се препорачува лимена фолија)
Обележување на примерокот: Група+реплика на пр. A1, A2, A3;Б1, Б2, Б3... ...
Испорака:
1.Сува мраз: Примероците треба да се пакуваат во вреќи и да се закопаат во сув мраз.
2.РНК стабилни цевки: РНК примероците може да се сушат во епрувета за стабилизација на РНК (на пр. RNAstable®) и да се испратат на собна температура.
Тек на услужна работа
Дизајн на експеримент
Испорака на примероци
Екстракција на РНК
Изградба на библиотека
Секвенционирање
Анализа на податоци
Услуги по продажба
Биоинформатика
Идентификација на miRNA: структура и длабочина
Диференцијално изразување на miRNA – хиерархиско кластерирање
Функционална прибелешка на целта на диференцијално изразените miRNAs
Истражете ги истражувачките достигнувања олеснети од услугите за секвенционирање на sRNA на BMKGene преку курирана колекција на публикации.
Чен, Х. и сор.(2023) „Вирусни инфекции ја инхибираат биосинтезата и фотосинтезата на сапонин во Panax notoginseng“, Физиологија и биохемија на растенијата, 203, стр.108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Ли, Х. и сор.(2023) „Растителниот протеин FREE1 што содржи домен FYVE се поврзува со микропроцесорски компоненти за да ја потисне биогенезата на miRNA“, известува EMBO, 24(1).doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Ју, Ј. и сор.(2023) „МикроРНК Ame-Bantam-3p го контролира развојот на ларвалната пупала со таргетирање на повеќекратни домени 8 слични на фактор на епидермален раст (megf8) во пчелата, Apis mellifera“, Меѓународен весник за молекуларни науки, 24 (6), стр. .5726. дои: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Џанг, М. и сор.(2018) „Интегрираната анализа на MiRNA и гените поврзани со квалитетот на месото открива дека Gga-MiR-140-5p влијае на интрамускулно таложење на маснотии кај кокошките“, Клеточна физиологија и биохемија, 46(6), стр. 2421-2433.doi: 10.1159/000489649.
