Цело секвенционирање на транскриптом – Илумина
Карактеристики
● Двојна библиотека за секвенција на целосниот транскриптом: осиромашување на rRNA проследено со подготовка на библиотеката PE150 и избор на големина проследено со подготовка на библиотеката SE50
● Целосна биоинформатичка анализа на mRNA, lncRNA, circRNA и miRNA во одделни извештаи за биоинформатика
● Заедничка анализа на целиот израз на РНК во комбиниран извештај, вклучително и анализа на цеРНА мрежите.
Предности на услугата
●Длабинска анализа на регулаторните мрежи: анализата на мрежата на ceRNA е овозможена со заедничко секвенционирање на mRNA, lncRNA, circRNA и miRNA и со исцрпувачки биоинформатски работен тек.
●Сеопфатна прибелешка: користиме повеќе бази на податоци за функционално да ги прибележиме диференцијално изразените гени (DEG) и да ја извршиме соодветната анализа на збогатување, обезбедувајќи увид во клеточните и молекуларните процеси кои се во основата на одговорот на транскриптом.
●Широка експертиза: со досие за успешно затворање на преку 2000 цели транскриптомски проекти во различни домени на истражување, нашиот тим носи богато искуство за секој проект.
●Ригорозна контрола на квалитетот: ги имплементираме основните контролни точки во сите фази, од подготовка на примерок и библиотека до секвенционирање и биоинформатика.Овој прецизен мониторинг обезбедува испорака на конзистентно висококвалитетни резултати.
● Сеопфатна прибелешка: користиме повеќе бази на податоци за функционално да ги прибележиме диференцијално изразените гени (DEG) и да ја извршиме соодветната анализа на збогатување, обезбедувајќи увид во клеточните и молекуларните процеси кои се во основата на одговорот на транскриптом.
●Пост-продажна поддршка: Нашата посветеност се протега надвор од завршувањето на проектот со 3-месечен период на услуга по продажбата.Во ова време, нудиме следење на проектот, помош за решавање проблеми и сесии за прашања и одговори за да одговориме на какви било прашања поврзани со резултатите
Примерок барања и испорака
| Библиотека | Стратегија за секвенционирање | Препорачани податоци | Контрола на квалитет |
| rRNA е исцрпена | Illumina PE150 | 16 GB | Q30≥85% |
| Избрана е големина | Illumina SE50 | 10-20 милиони читања |
Барања за примероци:
Нуклеотиди:
| Конц.(ng/μl) | Количина (μg) | Чистота | Интегритет |
| ≥ 100 | ≥ 1 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Ограничена или никаква контаминација на протеини или ДНК е прикажана на гелот. | Растенија: RIN≥6,5 Животно: RIN≥7.0 5,0≥28S/18S≥1,0; ограничена или без основна елевација |
Препорачана испорака на примероци
Контејнер:
Центрифуга епрувета од 2 ml (не се препорачува лимена фолија)
Обележување на примерокот: Група+реплика на пр. A1, A2, A3;Б1, Б2, Б3... ...
Испорака:
1.Сува мраз: Примероците треба да се пакуваат во вреќи и да се закопаат во сув мраз.
2.РНК стабилни цевки: РНК примероците може да се сушат во епрувета за стабилизација на РНК (на пр. RNAstable®) и да се испратат на собна температура.
Тек на услужна работа
Дизајн на експеримент
Испорака на примероци
Екстракција на РНК
Изградба на библиотека
Секвенционирање
Анализа на податоци
Услуги по продажба
Биоинформатика
Преглед на изразување на РНК
Диференцијално изразени гени
ceRNA анализа
Диференцијално изразени miRNA и сродни РНК
Истражете го напредокот во истражувањето олеснет од целокупните услуги за секвенционирање на транскриптоми на BMKGene преку курирана колекција на публикации.
Даи, Ј. и сор.(2022) „Сеопфатни изразни профили на mRNAs, lncRNAs и miRNAs во болеста Кашин-Бек идентификувани со секвенционирање на РНК“, Molecular Omics, 18(2), стр. 154-166.doi: 10.1039/D1MO00370D.
Лиу, Н. Нан и сор.(2022) „Анализа на целосни транскриптоми на ладно отпорност на Apis cerana во планината Чангбаи за време на презимувачкиот период.“, Gene, 830, стр. 146503-146503.doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
Ванг, XJ и сор.(2022) „Приоритизација заснована на мулти-омика на интеграција на конкурентни мрежи за регулација на ендогени РНК кај малите клеточни бели дробови: молекуларни карактеристики и кандидати за лекови“, Граници во онкологијата, 12, стр.904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Ксу, П. и сор.(2022) „Интегрираната анализа на профилите на изразување на lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA открива нови сознанија за потенцијалните механизми како одговор на нематодите со коренски јазли во кикирики“, BMC Genomics, 23(1), стр. 1-12.doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURES/7.
Јан, З. и сор.(2022) „Секвенционирањето на РНК со цел транскриптом ги истакнува молекуларните механизми поврзани со одржувањето на квалитетот по бербата во брокулата со црвено LED зрачење“, Постбербена биологија и технологија, 188, стр.111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
