16S/18S/ITS ആംപ്ലിക്കൺ സീക്വൻസിംഗ്-NGS
സേവന സവിശേഷതകൾ
● സീക്വൻസിങ് പ്ലാറ്റ്ഫോം: ഇല്ലുമിന നോവസെക്.
● മറ്റ് ആംപ്ലിഫിക്കേഷൻ ലക്ഷ്യങ്ങൾക്കൊപ്പം 16S, 18S, ITS എന്നിവയുടെ ഹ്രസ്വ മേഖലകളുടെ ആംപ്ലിഫിക്കേഷൻ.
● ആംപ്ലിക്കോണിൻ്റെ ഫ്ലെക്സിബിൾ ചോയ്സുകൾ.
● ഒന്നിലധികം ആംപ്ലിഫിക്കേഷൻ ടാർഗെറ്റുകളുള്ള മുൻ പ്രോജക്റ്റ് അനുഭവം.
സേവന നേട്ടങ്ങൾ
●ഒറ്റപ്പെടൽ രഹിത:പാരിസ്ഥിതിക സാമ്പിളുകളിൽ സൂക്ഷ്മജീവികളുടെ ഘടന വേഗത്തിൽ തിരിച്ചറിയൽ.
●ഉയർന്ന റെസല്യൂഷൻ: പരിസ്ഥിതി സാമ്പിളുകളിൽ കുറഞ്ഞ സമൃദ്ധമായ ഘടകങ്ങളിൽ.
●വ്യാപകമായി ബാധകമാണ്: വൈവിധ്യമാർന്ന സൂക്ഷ്മജീവ സമൂഹ പഠനങ്ങൾ.
●സമഗ്രമായ ബയോ ഇൻഫോർമാറ്റിക് വിശകലനം: ഡാറ്റാബേസ്, വ്യാഖ്യാനം, OTU/ASV എന്നിവയിൽ വൈവിധ്യമാർന്ന വിശകലനങ്ങളുള്ള ഏറ്റവും പുതിയ QIIME2 പാക്കേജ് (മൈക്രോബയൽ ഇക്കോളജിയിലേക്കുള്ള അളവ് ഉൾക്കാഴ്ച).
●വിപുലമായ വൈദഗ്ധ്യം: പ്രതിവർഷം 150,000 ആംപ്ലിക്കൺ സീക്വൻസിംഗ് പ്രോജക്ടുകൾ നടത്തുമ്പോൾ, BMKGENE ഒരു ദശാബ്ദത്തിലേറെ അനുഭവവും ഉയർന്ന വൈദഗ്ധ്യമുള്ള വിശകലന സംഘം, സമഗ്രമായ ഉള്ളടക്കം, മികച്ച വിൽപ്പനാനന്തര പിന്തുണ എന്നിവ നൽകുന്നു.
സേവന സവിശേഷതകൾ
| ലൈബ്രറി | സീക്വൻസിങ് സ്ട്രാറ്റജി | ഡാറ്റ ശുപാർശ ചെയ്യുന്നു |
| ആംപ്ലിക്കൺ | ഇല്ലുമിന PE250 | 50/100/300K ടാഗുകൾ (ജോഡികൾ വായിക്കുക) |
സേവന ആവശ്യകതകൾ
| ഏകാഗ്രത (ng/µL) | ആകെ തുക (ng) | വോളിയം (µL) |
| ≥1 | ≥200 | ≥20 |
● മണ്ണ്/ചെളി: 1-2 ഗ്രാം
● കുടൽ ഉള്ളടക്കം-മൃഗം: 0.5-2 ഗ്രാം
● കുടലിലെ ഉള്ളടക്കങ്ങൾ-പ്രാണികൾ: 0.1-0.25 ഗ്രാം
● ചെടിയുടെ ഉപരിതലം (സമ്പുഷ്ടമായ അവശിഷ്ടം): 0.1-0.5 ഗ്രാം
● അഴുകൽ ചാറു സമ്പുഷ്ടമായ അവശിഷ്ടം): 0.1-0.5 ഗ്രാം
● മലം (വലിയ മൃഗങ്ങൾ): 0.5-2 ഗ്രാം
● മലം (മൗസ്): 3-5 ധാന്യങ്ങൾ
● പൾമണറി ആൽവിയോളാർ ലാവേജ് ദ്രാവകം: ഫിൽട്ടർ പേപ്പർ
● വജൈനൽ സ്വാബ്: 5-6 സ്വാബ്
● ത്വക്ക്/ജനനേന്ദ്രിയ സ്വാബ്/ഉമിനീർ/വാക്കാലുള്ള മൃദുവായ ടിഷ്യു/ഫറിഞ്ചിയൽ സ്വാബ്/മലാശയ സ്വാബ്: 2-3 സ്വാബ്
● ഉപരിതല സൂക്ഷ്മാണുക്കൾ: ഫിൽട്ടർ പേപ്പർ
● വാട്ടർബോഡി/എയർ/ബയോഫിലിം: ഫിൽട്ടർ പേപ്പർ
● എൻഡോഫൈറ്റുകൾ: 1-2 ഗ്രാം
● ഡെൻ്റൽ പ്ലാക്ക്: 0.5-1 ഗ്രാം
സർവീസ് വർക്ക് ഫ്ലോ
സാമ്പിൾ ഡെലിവറി
ലൈബ്രറി നിർമ്മാണം
സീക്വൻസിങ്
ഡാറ്റ വിശകലനം
വിൽപ്പനാനന്തര സേവനങ്ങൾ
ഇനിപ്പറയുന്ന വിശകലനം ഉൾപ്പെടുന്നു:
- അസംസ്കൃത ഡാറ്റ ഗുണനിലവാര നിയന്ത്രണം
- OTU ക്ലസ്റ്ററിംഗ് /ഡി-നോയിസ്(ASV)
- OTU വ്യാഖ്യാനം
- ആൽഫ വൈവിധ്യ വിശകലനം: ഷാനൺ, സിംസൺ, എസിഇ എന്നിവയുൾപ്പെടെ ഒന്നിലധികം സൂചികകൾ.
- ബീറ്റ വൈവിധ്യ വിശകലനം
- ഇൻ്റർ ഗ്രൂപ്പ് വിശകലനം
- പരസ്പര ബന്ധ വിശകലനം: പാരിസ്ഥിതിക ഘടകങ്ങളും ബാഹ്യ ഘടനയും വൈവിധ്യവും തമ്മിൽ
- 16S ഫങ്ഷണൽ ജീൻ പ്രവചനം
ടാക്സോണമിക് വിതരണത്തിൻ്റെ ഹിസ്റ്റോഗ്രാം
ടാക്സോണമിക് സമൃദ്ധി ക്ലസ്റ്ററിംഗ് ഹീറ്റ് മാപ്പ്
ആൽഫ ഡൈവേഴ്സിറ്റി അനാലിസിസ്: അപൂർവ്വമായ കർവ്
ബീറ്റ വൈവിധ്യ വിശകലനം: എൻഎംഡിഎസ്
ഇൻ്റർഗ്രൂപ്പ് വിശകലനം: LEFSE ബയോമാർക്കർ കണ്ടെത്തൽ
ക്യൂറേറ്റ് ചെയ്ത പ്രസിദ്ധീകരണങ്ങളുടെ ശേഖരത്തിലൂടെ ഇല്ലുമിനയ്ക്കൊപ്പം BMKGene-ൻ്റെ ആംപ്ലിക്കൺ സീക്വൻസിംഗ് സേവനങ്ങൾ സുഗമമാക്കിയ പുരോഗതികൾ പര്യവേക്ഷണം ചെയ്യുക.
ഡോങ്, സി. തുടങ്ങിയവർ. (2022) 'അസംബ്ലി, കോർ മൈക്രോബയോട്ട, ആൻഡ് ഫംഗ്ഷൻ ഓഫ് ദി റൈസോസ്ഫിയർ സോയിൽ ആൻഡ് ബാർക്ക് മൈക്രോബയോട്ട ഇൻ യൂകോമിയ അൾമോയ്ഡസ്', ഫ്രോണ്ടിയേഴ്സ് ഇൻ മൈക്രോബയോളജി, 13. doi: 10.3389/FMICB.2022.855317/FULL.
ലി, Y. et al. (2023) 'എലികളിലെ ഗാർഡ്നെറല്ല വാഗിനാലിസ്-ഇൻഡ്യൂസ്ഡ് ബാക്ടീരിയൽ വാഗിനോസിസ് ചികിത്സയ്ക്കുള്ള സിന്തറ്റിക് ബാക്ടീരിയൽ കൺസോർഷ്യ ട്രാൻസ്പ്ലാൻറേഷൻ', മൈക്രോബയോം, 11(1), പേജ്. 1–14. doi: 10.1186/s40168-023-01497-y
Yang, J., Fu, Y. and Liu, H. (2022) 'ഭൂമി അധിഷ്ഠിത അടച്ച ബയോറെജെനറേറ്റീവ് ലൈഫ് സപ്പോർട്ട് പരീക്ഷണത്തിനിടെ ശേഖരിച്ച വായു പൊടിയുടെ മൈക്രോബയോമുകൾ "ലൂണാർ പാലസ് 365"', എൻവയോൺമെൻ്റൽ മൈക്രോബയോംസ്, 17(1), pp. 1-20. doi: 10.1186/S40793-022-00399-0/FIGURES/8.
Yin, S. et al. (2022) 'നൈട്രജൻ പരിവർത്തനവുമായി ബന്ധപ്പെട്ട ഫങ്ഷണൽ ജീനുകളുടെ ഫീഡ്സ്റ്റോക്ക്-ആശ്രിത സമൃദ്ധി കമ്പോസ്റ്റിംഗിലെ നൈട്രജൻ നഷ്ടം നിയന്ത്രിക്കുന്നു', ബയോറിസോഴ്സ് ടെക്നോളജി, 361, പേജ്. 127678. doi: 10.1016/J.BIORTECH.2022.127678.
