മെറ്റാട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം സീക്വൻസിങ്
സേവന സവിശേഷതകൾ
● rRNA ശോഷണം തുടർന്ന് ദിശാസൂചനയുള്ള mRNA ലൈബ്രറി തയ്യാറാക്കൽ.
● Illumina NovaSeq-ൽ സീക്വൻസിങ്.
സേവന നേട്ടങ്ങൾ
●സങ്കീർണ്ണമായ മൈക്രോബയൽ കമ്മ്യൂണിറ്റികളുടെ മാറ്റങ്ങൾ പഠിക്കുക:ഇത് ട്രാൻസ്ക്രിപ്ഷൻ തലത്തിൽ സംഭവിക്കുകയും സാധ്യതയുള്ള പുതിയ ജീനുകൾ പര്യവേക്ഷണം ചെയ്യുകയും ചെയ്യുന്നു.
●ഹോസ്റ്റുമായോ പരിസ്ഥിതിയുമായോ ഉള്ള മൈക്രോബയൽ കമ്മ്യൂണിറ്റി ഇടപെടലുകൾ വിശദീകരിക്കുന്നു.
●സമഗ്രമായ ബയോ ഇൻഫോർമാറ്റിക് വിശകലനം: ഇത് കമ്മ്യൂണിറ്റി ടാക്സോണമിക്, ഫങ്ഷണൽ കോമ്പോസിഷനുകൾ, ഡിഫറൻഷ്യൽ ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ വിശകലനം എന്നിവയെക്കുറിച്ചുള്ള ഉൾക്കാഴ്ചകൾ നൽകുന്നു.
●വിപുലമായ ജീൻ വ്യാഖ്യാനം:മൈക്രോബയൽ കമ്മ്യൂണിറ്റികളുടെ വിജ്ഞാനപ്രദമായ ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ വിവരങ്ങൾക്കായി കാലികമായ ജീൻ ഫംഗ്ഷൻ ഡാറ്റാബേസുകൾ ഉപയോഗിക്കുന്നു.
●വിൽപ്പനാനന്തര പിന്തുണ:ഞങ്ങളുടെ പ്രതിബദ്ധത 3 മാസത്തെ വിൽപ്പനാനന്തര സേവന കാലയളവിനൊപ്പം പ്രോജക്റ്റ് പൂർത്തീകരണത്തിനപ്പുറം വ്യാപിക്കുന്നു. ഈ സമയത്ത്, ഞങ്ങൾ പ്രോജക്റ്റ് ഫോളോ-അപ്പ്, ട്രബിൾഷൂട്ടിംഗ് സഹായം, ഫലങ്ങളുമായി ബന്ധപ്പെട്ട ഏത് ചോദ്യങ്ങളും പരിഹരിക്കുന്നതിന് ചോദ്യോത്തര സെഷനുകൾ എന്നിവ വാഗ്ദാനം ചെയ്യുന്നു.
സേവന സവിശേഷതകൾ
| സീക്വൻസിങ് പ്ലാറ്റ്ഫോം | സീക്വൻസിങ് സ്ട്രാറ്റജി | ഡാറ്റ ശുപാർശ ചെയ്യുന്നു | ഡാറ്റ ഗുണനിലവാര നിയന്ത്രണം |
| ഇല്ലുമിന നോവസെക് | PE150 | 12 ജിബി | Q30≥85% |
സാമ്പിൾ ആവശ്യകതകൾ
| ഏകാഗ്രത (ng/µL) | ആകെ തുക (µg) | വോളിയം (µL) | OD260/280 | OD260/230 | RIN |
| ≥50 | ≥1.0 | ≥20 | 1.8-2.0 | 1.0-2.5 | ≥6.5 |
സർവീസ് വർക്ക് ഫ്ലോ
സാമ്പിൾ ഡെലിവറി
ലൈബ്രറി നിർമ്മാണം
സീക്വൻസിങ്
ഡാറ്റ വിശകലനം
വിൽപ്പനാനന്തര സേവനങ്ങൾ
ഇനിപ്പറയുന്ന വിശകലനം ഉൾപ്പെടുന്നു:
● സീക്വൻസിങ് ഡാറ്റ ക്വാളിറ്റി കൺട്രോൾ
● ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ് അസംബ്ലി
● ടാക്സോണമിക് വ്യാഖ്യാനവും സമൃദ്ധിയും
● പ്രവർത്തനപരമായ വ്യാഖ്യാനവും സമൃദ്ധിയും
● എക്സ്പ്രഷൻ ക്വാണ്ടിഫിക്കേഷനും ഡിഫറൻഷ്യൽ അനാലിസിസും
ഓരോ സാമ്പിളിൻ്റെയും വർഗ്ഗീകരണ വിതരണം:
ബീറ്റ വൈവിധ്യ വിശകലനം: UPGMA
പ്രവർത്തനപരമായ വ്യാഖ്യാനം - GO സമൃദ്ധി
ഡിഫറൻഷ്യൽ ടാക്സോണമി സമൃദ്ധി - LEFSE
പ്രസിദ്ധീകരണങ്ങളുടെ ക്യൂറേറ്റ് ചെയ്ത ശേഖരത്തിലൂടെ BMKGene-ൻ്റെ മെറ്റാ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമിക്സ് സീക്വൻസിംഗ് സേവനങ്ങൾ സുഗമമാക്കിയ പുരോഗതികൾ പര്യവേക്ഷണം ചെയ്യുക.
ലു, Z. et al. (2023) 'ബാക്ടീറോയ്ഡേൽസ് എന്ന ക്രമത്തിലുള്ള ലാക്റ്റേറ്റ്-ഉപയോഗിക്കുന്ന ബാക്ടീരിയകളുടെ ആസിഡ് ടോളറൻസ് ഉയർന്ന സാന്ദ്രതയുള്ള ഭക്ഷണക്രമവുമായി പൊരുത്തപ്പെടുന്ന ആടുകളിലെ റുമിനൽ അസിഡോസിസ് തടയാൻ സഹായിക്കുന്നു',മൃഗങ്ങളുടെ പോഷകാഹാരം, 14, പേജ്. 130-140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.
ഗാനം, Z. et al. (2017) 'ഉയർന്ന ത്രൂപുട്ട് ആംപ്ലിക്കോണുകളും മെറ്റാട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമിക്സ് സീക്വൻസിംഗും വഴി പരമ്പരാഗത സോളിഡ്-സ്റ്റേറ്റ് ഫെർമെൻ്റേഷനിൽ കോർ ഫങ്ഷണൽ മൈക്രോബയോട്ട അൺറാവലിംഗ്',മൈക്രോബയോളജിയിലെ അതിരുകൾ, 8 (JUL). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL.
വാങ്, ഡബ്ല്യു. തുടങ്ങിയവർ. (2022) 'ഫൈറ്റോപത്തോജെനിക് ആൾട്ടർനേറിയ ഫംഗസിൻ്റെ മെറ്റാട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമിക്സ് സർവേയിൽ നിന്ന് കണ്ടെത്തിയ നോവൽ മൈക്കോവൈറസ്',വൈറസുകൾ, 14(11), പേ. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.
വെയ്, ജെ. തുടങ്ങിയവർ. (2022) 'പാരലൽ മെറ്റാട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം വിശകലനം, വണ്ടുകളും അവയുടെ ഗട്ട് സിംബയൻ്റുകളാലും സസ്യ ദ്വിതീയ മെറ്റബോളിറ്റുകളുടെ അപചയം വെളിപ്പെടുത്തുന്നു',തന്മാത്ര പരിസ്ഥിതി ശാസ്ത്രം, 31(15), പേജ്. 3999–4016. doi: 10.1111/MEC.16557.
