-
സിംഗിൾ ന്യൂക്ലിയസ് ആർഎൻഎ സീക്വൻസിങ്
സിംഗിൾ സെൽ ക്യാപ്ചറിംഗിലെ പുരോഗതിയും ഹൈ-ത്രൂപുട്ട് സീക്വൻസിംഗുമായി സംയോജിപ്പിച്ച് വ്യക്തിഗത ലൈബ്രറി നിർമ്മാണ സാങ്കേതികവിദ്യയും സെൽ-ബൈ-സെൽ അടിസ്ഥാനത്തിൽ ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ പഠനങ്ങളെ അനുവദിക്കുന്നു.സങ്കീർണ്ണമായ സെൽ പോപ്പുലേഷനുകളിൽ ആഴമേറിയതും പൂർണ്ണവുമായ സിസ്റ്റം വിശകലനം ഇത് പ്രാപ്തമാക്കുന്നു, അതിൽ എല്ലാ കോശങ്ങളുടെയും ശരാശരി എടുത്ത് അവയുടെ വൈവിധ്യത്തെ മറയ്ക്കുന്നത് വലിയതോതിൽ ഒഴിവാക്കുന്നു.
എന്നിരുന്നാലും, ചില കോശങ്ങൾ സിംഗിൾ-സെൽ സസ്പെൻഷനാക്കി മാറ്റാൻ അനുയോജ്യമല്ല, അതിനാൽ മറ്റ് സാമ്പിൾ തയ്യാറാക്കൽ രീതികൾ ആവശ്യമാണ് - ടിഷ്യൂകളിൽ നിന്ന് ന്യൂക്ലിയസ് വേർതിരിച്ചെടുക്കൽ, അതായത്, ടിഷ്യൂകളിൽ നിന്നോ കോശത്തിൽ നിന്നോ ന്യൂക്ലിയസ് നേരിട്ട് വേർതിരിച്ചെടുത്ത് സിംഗിൾ-ന്യൂക്ലിയസ് സസ്പെൻഷനായി തയ്യാറാക്കുന്നു. സെൽ സീക്വൻസിങ്.
BMK 10× Genomics Chromium TM അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള സിംഗിൾ-സെൽ RNA സീക്വൻസിങ് സേവനം നൽകുന്നു.രോഗപ്രതിരോധ കോശ വ്യത്യാസം, ട്യൂമർ വൈവിധ്യം, ടിഷ്യു വികസനം തുടങ്ങിയ രോഗങ്ങളുമായി ബന്ധപ്പെട്ട പഠനങ്ങളിൽ ഈ സേവനം വ്യാപകമായി ഉപയോഗിച്ചുവരുന്നു.
സ്പേഷ്യൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം ചിപ്പ്: 10× ജീനോമിക്സ്
പ്ലാറ്റ്ഫോം: Illumina NovaSeq പ്ലാറ്റ്ഫോം
-
പ്ലാന്റ്/ആനിമൽ ഹോൾ ജീനോം സീക്വൻസിങ്
സിംഗിൾ ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് പോളിമോർഫിസം (എസ്എൻപി), ഇൻസെർഷൻ ഡിലീഷൻ (ഇൻഡെൽ), സ്ട്രക്ചർ വേരിയേഷൻ (എസ്വി), കോപ്പി നമ്പർ വേരിയേഷൻ (സിഎൻവി) എന്നിവയുൾപ്പെടെ മുഴുവൻ ജീനോമിലും പൊതുവായതും അപൂർവവുമായ മ്യൂട്ടേഷനുകൾ വെളിപ്പെടുത്താൻ ഡബ്ല്യുജിഎസ് എന്നും അറിയപ്പെടുന്ന ഹോൾ ജീനോം റീ-സീക്വൻസിങ് സാധ്യമാക്കുന്നു. ).എസ്‌എൻ‌പികളേക്കാൾ വ്യതിയാന അടിത്തറയുടെ വലിയൊരു ഭാഗം എസ്‌വികൾ നിർമ്മിക്കുകയും ജീനോമിൽ വലിയ സ്വാധീനം ചെലുത്തുകയും ചെയ്യുന്നു, ഇത് ജീവജാലങ്ങളിൽ കാര്യമായ സ്വാധീനം ചെലുത്തുന്നു.വലിയ ശകലങ്ങളും സങ്കീർണ്ണമായ വ്യതിയാനങ്ങളും കൂടുതൽ കൃത്യമായി തിരിച്ചറിയാൻ ലോങ്ങ്-റീഡ് റെസീക്വൻസിങ് അനുവദിക്കുന്നു, കാരണം ടാൻഡം റിപ്പീറ്റുകൾ, ജിസി/എടി സമ്പന്നമായ പ്രദേശങ്ങൾ, ഹൈപ്പർ-വേരിയബിൾ മേഖലകൾ എന്നിവ പോലുള്ള സങ്കീർണ്ണമായ പ്രദേശങ്ങളിൽ ക്രോമസോമുകൾ കടന്നുപോകുന്നത് വളരെ എളുപ്പമാക്കുന്നു.
പ്ലാറ്റ്ഫോം: ഇല്ലുമിന, പാക്ബയോ, നാനോപോർ
-
BMKMANU S1000 സ്പേഷ്യൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ്
സ്പേഷ്യൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമിക്സ് ശാസ്ത്രീയ നവീകരണത്തിന്റെ മുൻനിരയിൽ നിൽക്കുന്നു, ടിഷ്യൂകൾക്കുള്ളിലെ സങ്കീർണ്ണമായ ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ പാറ്റേണുകൾ അവയുടെ സ്പേഷ്യൽ സന്ദർഭം നിലനിർത്തിക്കൊണ്ട് പരിശോധിക്കാൻ ഗവേഷകരെ പ്രാപ്തരാക്കുന്നു.വിവിധ പ്ലാറ്റ്‌ഫോമുകൾക്കിടയിൽ, BMKGene BMKManu S1000 സ്പേഷ്യൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം ചിപ്പ് വികസിപ്പിച്ചെടുത്തു.മെച്ചപ്പെടുത്തിയ റെസല്യൂഷൻ5µM, ഉപസെല്ലുലാർ ശ്രേണിയിൽ എത്തി, പ്രവർത്തനക്ഷമമാക്കുന്നുമൾട്ടി-ലെവൽ റെസലൂഷൻ ക്രമീകരണങ്ങൾ.S1000 ചിപ്പ്, ഏകദേശം 2 ദശലക്ഷം സ്പോട്ടുകൾ ഫീച്ചർ ചെയ്യുന്നു, സ്പേഷ്യൽ ബാർകോഡ് ക്യാപ്ചർ പ്രോബുകൾ ലോഡുചെയ്‌ത മുത്തുകൾ കൊണ്ട് പാളികളുള്ള മൈക്രോവെല്ലുകൾ ഉപയോഗിക്കുന്നു.സ്പേഷ്യൽ ബാർകോഡുകളാൽ സമ്പുഷ്ടമായ ഒരു cDNA ലൈബ്രറി, S1000 ചിപ്പിൽ നിന്ന് തയ്യാറാക്കുകയും പിന്നീട് Illumina NovaSeq പ്ലാറ്റ്‌ഫോമിൽ ക്രമപ്പെടുത്തുകയും ചെയ്യുന്നു.സ്പേഷ്യൽ ബാർകോഡുള്ള സാമ്പിളുകളുടെയും യുഎംഐകളുടെയും സംയോജനം സൃഷ്ടിക്കുന്ന ഡാറ്റയുടെ കൃത്യതയും പ്രത്യേകതയും ഉറപ്പാക്കുന്നു.BMKManu S1000 ചിപ്പിന്റെ തനതായ ആട്രിബ്യൂട്ട് അതിന്റെ ബഹുമുഖതയിലാണ്, വിവിധ ടിഷ്യൂകളിലേക്കും വിശദാംശങ്ങളുടെ തലങ്ങളിലേക്കും നന്നായി ട്യൂൺ ചെയ്യാൻ കഴിയുന്ന മൾട്ടി-ലെവൽ റെസലൂഷൻ ക്രമീകരണങ്ങൾ വാഗ്ദാനം ചെയ്യുന്നു.ഈ അഡാപ്റ്റബിലിറ്റി, വൈവിധ്യമാർന്ന സ്പേഷ്യൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമിക്സ് പഠനങ്ങൾക്കുള്ള മികച്ച ചോയിസായി ചിപ്പിനെ സ്ഥാപിക്കുന്നു, കുറഞ്ഞ ശബ്ദത്തിൽ കൃത്യമായ സ്പേഷ്യൽ ക്ലസ്റ്ററിംഗ് ഉറപ്പാക്കുന്നു.
BMKManu S1000 ചിപ്പും മറ്റ് സ്പേഷ്യൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമിക്സ് സാങ്കേതികവിദ്യകളും ഉപയോഗിച്ച്, ഗവേഷകർക്ക് കോശങ്ങളുടെ സ്പേഷ്യൽ ഓർഗനൈസേഷനെക്കുറിച്ചും ടിഷ്യൂകൾക്കുള്ളിൽ സംഭവിക്കുന്ന സങ്കീർണ്ണമായ തന്മാത്രാ ഇടപെടലുകളെക്കുറിച്ചും നന്നായി മനസ്സിലാക്കാൻ കഴിയും. ഓങ്കോളജി, ന്യൂറോ സയൻസ്, ഡെവലപ്‌മെന്റ് ബയോളജി, ഇമ്മ്യൂണോളജി, ബൊട്ടാണിക്കൽ സ്റ്റഡീസ്.
പ്ലാറ്റ്ഫോം: BMKManu S1000 ചിപ്പ്, Illumina NovaSeq
-
10x ജീനോമിക്സ് വിസിയം സ്പേഷ്യൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം
സ്പേഷ്യൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമിക്സ് എന്നത് ഒരു അത്യാധുനിക സാങ്കേതിക വിദ്യയാണ്, അത് ടിഷ്യൂകൾക്കുള്ളിലെ ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ പാറ്റേണുകളെ അവയുടെ സ്പേഷ്യൽ സന്ദർഭം നിലനിർത്തിക്കൊണ്ട് അന്വേഷിക്കാൻ ഗവേഷകരെ അനുവദിക്കുന്നു.ഈ ഡൊമെയ്‌നിലെ ഒരു ശക്തമായ പ്ലാറ്റ്ഫോം 10x ജീനോമിക്സ് വിസിയവും ഇലുമിന സീക്വൻസിംഗും ആണ്.10X വിസിയത്തിന്റെ തത്വം ടിഷ്യൂ സെക്ഷനുകൾ സ്ഥാപിക്കുന്ന ഒരു പ്രത്യേക ക്യാപ്ചർ ഏരിയയുള്ള ഒരു പ്രത്യേക ചിപ്പിലാണ്.ഈ ക്യാപ്ചർ ഏരിയയിൽ ബാർകോഡ് ചെയ്ത പാടുകൾ അടങ്ങിയിരിക്കുന്നു, അവ ഓരോന്നും ടിഷ്യുവിനുള്ളിലെ ഒരു പ്രത്യേക സ്പേഷ്യൽ ലൊക്കേഷനുമായി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു.ടിഷ്യുവിൽ നിന്ന് പിടിച്ചെടുത്ത ആർഎൻഎ തന്മാത്രകൾ റിവേഴ്സ് ട്രാൻസ്ക്രിപ്ഷൻ പ്രക്രിയയിൽ യുണീക് മോളിക്യുലാർ ഐഡന്റിഫയറുകൾ (യുഎംഐ) ഉപയോഗിച്ച് ലേബൽ ചെയ്യുന്നു.ഈ ബാർകോഡ് ചെയ്ത പാടുകളും UMI-കളും ഒരു സെൽ റെസല്യൂഷനിൽ കൃത്യമായ സ്പേഷ്യൽ മാപ്പിംഗും ജീൻ എക്സ്പ്രഷന്റെ അളവും പ്രാപ്തമാക്കുന്നു.സ്പേഷ്യൽ ബാർകോഡുള്ള സാമ്പിളുകളുടെയും യുഎംഐകളുടെയും സംയോജനം സൃഷ്ടിക്കുന്ന ഡാറ്റയുടെ കൃത്യതയും പ്രത്യേകതയും ഉറപ്പാക്കുന്നു.ഈ സ്പേഷ്യൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമിക്സ് സാങ്കേതികവിദ്യ ഉപയോഗിക്കുന്നതിലൂടെ, ഗവേഷകർക്ക് കോശങ്ങളുടെ സ്പേഷ്യൽ ഓർഗനൈസേഷനെക്കുറിച്ചും ടിഷ്യൂകൾക്കുള്ളിൽ സംഭവിക്കുന്ന സങ്കീർണ്ണമായ തന്മാത്രാ ഇടപെടലുകളെക്കുറിച്ചും ആഴത്തിലുള്ള ധാരണ നേടാനാകും, ഓങ്കോളജി, ന്യൂറോ സയൻസ്, ഡെവലപ്‌മെന്റൽ ബയോളജി, ഇമ്മ്യൂണോളജി എന്നിവയുൾപ്പെടെ ഒന്നിലധികം മേഖലകളിലെ ജൈവ പ്രക്രിയകൾക്ക് അടിസ്ഥാനമായ സംവിധാനങ്ങളെക്കുറിച്ച് അമൂല്യമായ ഉൾക്കാഴ്ചകൾ വാഗ്ദാനം ചെയ്യുന്നു. , ബൊട്ടാണിക്കൽ പഠനങ്ങൾ.
പ്ലാറ്റ്ഫോം: 10X ജീനോമിക്സ് വിസിയം, ഇല്ലുമിന നോവസെക്
-
മുഴുനീള mRNA സീക്വൻസിങ്-നാനോപോർ
NGS-അധിഷ്ഠിത mRNA സീക്വൻസിങ് ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ ക്വാണ്ടിഫിക്കേഷനുള്ള ഒരു ബഹുമുഖ ഉപകരണമായി വർത്തിക്കുമ്പോൾ, ഹ്രസ്വമായ വായനകളെ ആശ്രയിക്കുന്നത് സങ്കീർണ്ണമായ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമിക് വിശകലനങ്ങളിൽ അതിന്റെ ഫലപ്രാപ്തിയെ നിയന്ത്രിക്കുന്നു.നേരെമറിച്ച്, നാനോപോർ സീക്വൻസിംഗ് ദീർഘനേരം വായിക്കുന്ന സാങ്കേതികവിദ്യ ഉപയോഗിക്കുന്നു, ഇത് മുഴുനീള mRNA ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റുകളുടെ ക്രമം പ്രാപ്തമാക്കുന്നു.ഇതര വിഭജനം, ജീൻ ഫ്യൂഷനുകൾ, പോളി-അഡെനൈലേഷൻ, എംആർഎൻഎ ഐസോഫോമുകളുടെ അളവ് എന്നിവയെക്കുറിച്ചുള്ള സമഗ്രമായ പര്യവേക്ഷണം ഈ സമീപനം സഹായിക്കുന്നു.
നാനോപോർ സീക്വൻസിങ് നാനോപോർ സിംഗിൾ മോളിക്യൂൾ തൽസമയ വൈദ്യുത സിഗ്നലുകളെ ആശ്രയിക്കുന്നു.മോട്ടോർ പ്രോട്ടീനുകളാൽ നയിക്കപ്പെടുന്ന, ഡബിൾ സ്ട്രാൻഡഡ് ഡിഎൻഎ ഒരു ബയോഫിലിമിൽ ഉൾച്ചേർത്ത നാനോപോർ പ്രോട്ടീനുകളുമായി ബന്ധിപ്പിക്കുന്നു, വോൾട്ടേജ് വ്യത്യാസത്തിൽ നാനോപോർ ചാനലിലൂടെ കടന്നുപോകുമ്പോൾ അത് വിച്ഛേദിക്കുന്നു.ഡിഎൻഎ സ്‌ട്രാൻഡിലെ വ്യത്യസ്‌ത അടിത്തറകൾ സൃഷ്ടിക്കുന്ന വ്യതിരിക്തമായ വൈദ്യുത സിഗ്നലുകൾ കൃത്യവും നിരന്തരവുമായ ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് സീക്വൻസിംഗ് സുഗമമാക്കിക്കൊണ്ട് തത്സമയം കണ്ടെത്തുകയും തരംതിരിക്കുകയും ചെയ്യുന്നു.ഈ നൂതന സമീപനം ഹ്രസ്വ-വായന പരിമിതികളെ മറികടക്കുകയും സങ്കീർണ്ണമായ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമിക് പഠനങ്ങൾ ഉൾപ്പെടുന്ന സങ്കീർണ്ണമായ ജീനോമിക് വിശകലനത്തിന് ചലനാത്മക പ്ലാറ്റ്ഫോം നൽകുകയും ചെയ്യുന്നു.
പ്ലാറ്റ്ഫോം: നാനോപോർ പ്രൊമിതിയോൺ P48
-
മുഴുനീള mRNA സീക്വൻസിങ് -PacBio
NGS-അധിഷ്ഠിത mRNA സീക്വൻസിംഗ് ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ അളക്കുന്നതിനുള്ള ഒരു ബഹുമുഖ ഉപകരണമാണെങ്കിലും, ഹ്രസ്വ വായനകളെ ആശ്രയിക്കുന്നത് സങ്കീർണ്ണമായ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമിക് വിശകലനങ്ങളിൽ അതിന്റെ ഉപയോഗത്തെ നിയന്ത്രിക്കുന്നു.മറുവശത്ത്, PacBio സീക്വൻസിംഗ് (Iso-Seq) ദീർഘനേരം വായിക്കുന്ന സാങ്കേതികവിദ്യ ഉപയോഗിക്കുന്നു, ഇത് മുഴുനീള mRNA ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റുകളുടെ ക്രമം പ്രാപ്തമാക്കുന്നു.ഈ സമീപനം ബദൽ വിഭജനം, ജീൻ ഫ്യൂഷനുകൾ, പോളി-അഡിനൈലേഷൻ എന്നിവയുടെ സമഗ്രമായ പര്യവേക്ഷണം സുഗമമാക്കുന്നു, എന്നിരുന്നാലും ഉയർന്ന അളവിലുള്ള ഡാറ്റ ആവശ്യമുള്ളതിനാൽ ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ ക്വാണ്ടിഫിക്കേഷന്റെ പ്രാഥമിക തിരഞ്ഞെടുപ്പല്ല ഇത്.
PacBio സീക്വൻസിംഗ് സാങ്കേതികവിദ്യ ഒറ്റ-തന്മാത്ര, തത്സമയ (SMRT) സീക്വൻസിംഗിനെ ആശ്രയിക്കുന്നു, ഇത് മുഴുനീള mRNA ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റുകൾ ക്യാപ്ചർ ചെയ്യുന്നതിൽ ഒരു പ്രത്യേക നേട്ടം നൽകുന്നു.ഈ നൂതന സമീപനത്തിൽ സീറോ-മോഡ് വേവ് ഗൈഡുകൾ (ZMWs), മൈക്രോ ഫാബ്രിക്കേറ്റഡ് കിണറുകൾ എന്നിവയുടെ ഉപയോഗം ഉൾപ്പെടുന്നു, അത് സീക്വൻസിംഗിൽ ഡിഎൻഎ പോളിമറേസ് പ്രവർത്തനത്തിന്റെ തത്സമയ നിരീക്ഷണം സാധ്യമാക്കുന്നു.ഈ ZMW-കൾക്കുള്ളിൽ, PacBio-യുടെ DNA പോളിമറേസ്, ഡിഎൻഎയുടെ ഒരു പൂരക സ്ട്രാൻഡ് സമന്വയിപ്പിക്കുന്നു, ഇത് മുഴുവൻ mRNA ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റുകളിലും വ്യാപിക്കുന്ന ദീർഘമായ വായനകൾ സൃഷ്ടിക്കുന്നു.സർക്കുലർ കൺസെൻസസ് സീക്വൻസിംഗ് (CCS) മോഡിലെ PacBio ഓപ്പറേഷൻ ഒരേ തന്മാത്രയെ ആവർത്തിച്ച് ക്രമീകരിച്ചുകൊണ്ട് കൃത്യത വർദ്ധിപ്പിക്കുന്നു.ജനറേറ്റുചെയ്‌ത ഹൈഫൈ റീഡുകൾക്ക് എൻ‌ജി‌എസുമായി താരതമ്യപ്പെടുത്താവുന്ന കൃത്യതയുണ്ട്, ഇത് സങ്കീർണ്ണമായ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമിക് സവിശേഷതകളുടെ സമഗ്രവും വിശ്വസനീയവുമായ വിശകലനത്തിന് കൂടുതൽ സംഭാവന നൽകുന്നു.പ്ലാറ്റ്ഫോം: PacBio സീക്വൽ II
-
യൂക്കറിയോട്ടിക് mRNA സീക്വൻസിങ്-ഇല്ലുമിന
mRNA സീക്വൻസിങ് പ്രത്യേക വ്യവസ്ഥകളിൽ സെല്ലുകൾക്കുള്ളിലെ എല്ലാ mRNA ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റുകളുടെയും സമഗ്രമായ പ്രൊഫൈലിങ്ങിനെ പ്രാപ്തമാക്കുന്നു.ഈ അത്യാധുനിക സാങ്കേതികവിദ്യ, സങ്കീർണ്ണമായ ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ പ്രൊഫൈലുകൾ, ജീൻ ഘടനകൾ, വൈവിധ്യമാർന്ന ജൈവ പ്രക്രിയകളുമായി ബന്ധപ്പെട്ട തന്മാത്രാ സംവിധാനങ്ങൾ എന്നിവ അനാവരണം ചെയ്യുന്ന ഒരു ശക്തമായ ഉപകരണമായി വർത്തിക്കുന്നു.അടിസ്ഥാന ഗവേഷണം, ക്ലിനിക്കൽ ഡയഗ്‌നോസ്റ്റിക്‌സ്, ഡ്രഗ് ഡെവലപ്‌മെന്റ് എന്നിവയിൽ വ്യാപകമായി സ്വീകരിച്ച എംആർഎൻഎ സീക്വൻസിംഗ് സെല്ലുലാർ ഡൈനാമിക്‌സിന്റെയും ജനിതക നിയന്ത്രണത്തിന്റെയും സങ്കീർണതകളിലേക്ക് ഉൾക്കാഴ്ച നൽകുന്നു.
പ്ലാറ്റ്ഫോം: ഇല്ലുമിന നോവസെക് എക്സ്
-
നോൺ-റഫറൻസ് അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള mRNA സീക്വൻസിങ്-ഇല്ലുമിന
mRNA സീക്വൻസിങ് പ്രത്യേക വ്യവസ്ഥകളിൽ സെല്ലുകൾക്കുള്ളിലെ എല്ലാ mRNA ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റുകളുടെയും സമഗ്രമായ പ്രൊഫൈലിങ്ങിനെ പ്രാപ്തമാക്കുന്നു.ഈ അത്യാധുനിക സാങ്കേതികവിദ്യ, സങ്കീർണ്ണമായ ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ പ്രൊഫൈലുകൾ, ജീൻ ഘടനകൾ, വൈവിധ്യമാർന്ന ജൈവ പ്രക്രിയകളുമായി ബന്ധപ്പെട്ട തന്മാത്രാ സംവിധാനങ്ങൾ എന്നിവ അനാവരണം ചെയ്യുന്ന ഒരു ശക്തമായ ഉപകരണമായി വർത്തിക്കുന്നു.അടിസ്ഥാന ഗവേഷണം, ക്ലിനിക്കൽ ഡയഗ്‌നോസ്റ്റിക്‌സ്, ഡ്രഗ് ഡെവലപ്‌മെന്റ് എന്നിവയിൽ വ്യാപകമായി സ്വീകരിച്ച എംആർഎൻഎ സീക്വൻസിംഗ് സെല്ലുലാർ ഡൈനാമിക്‌സിന്റെയും ജനിതക നിയന്ത്രണത്തിന്റെയും സങ്കീർണതകളിലേക്ക് ഉൾക്കാഴ്ച നൽകുന്നു.
പ്ലാറ്റ്ഫോം: ഇല്ലുമിന നോവസെക് എക്സ്
-
ദൈർഘ്യമേറിയ നോൺ-കോഡിംഗ് സീക്വൻസിങ്-ഇല്ലുമിന
ലോംഗ് നോൺ-കോഡിംഗ് ആർഎൻഎകൾ (എൽ‌എൻ‌സി‌ആർ‌എൻ‌എ) 200 ന്യൂക്ലിയോടൈഡുകളിൽ കൂടുതൽ നീളമുള്ള ആർ‌എൻ‌എകളാണ്, അവ ഏറ്റവും കുറഞ്ഞ കോഡിംഗ് സാധ്യതയുള്ളതും കോഡിംഗ് അല്ലാത്ത ആർ‌എൻ‌എയിലെ പ്രധാന ഘടകങ്ങളുമാണ്.ന്യൂക്ലിയസിലും സൈറ്റോപ്ലാസ്മിലും കാണപ്പെടുന്ന ഈ ആർഎൻഎകൾ എപ്പിജെനെറ്റിക്, ട്രാൻസ്‌ക്രിപ്‌ഷണൽ, പോസ്റ്റ്-ട്രാൻസ്‌ക്രിപ്‌ഷണൽ റെഗുലേഷൻ എന്നിവയിൽ നിർണായക പങ്ക് വഹിക്കുന്നു, സെല്ലുലാർ, മോളിക്യുലാർ പ്രക്രിയകൾ രൂപപ്പെടുത്തുന്നതിൽ അവയുടെ പ്രാധാന്യം അടിവരയിടുന്നു.സെൽ ഡിഫറൻഷ്യേഷൻ, ഒന്റോജെനിസിസ്, ഹ്യൂമൻ ഡിസീസ് എന്നിവയിൽ ശക്തമായ ഒരു ഉപകരണമാണ് LncRNA സീക്വൻസിങ്.
പ്ലാറ്റ്ഫോം: Illumina NovaSeq
-
ചെറിയ RNA സീക്വൻസിങ്-ഇല്ലുമിന
സാധാരണയായി 200 ന്യൂക്ലിയോടൈഡുകൾക്ക് താഴെ നീളമുള്ള ചെറിയ ആർഎൻഎ (sRNA) തന്മാത്രകളിൽ മൈക്രോആർഎൻഎകൾ (മൈആർഎൻഎകൾ), ചെറിയ ഇടപെടൽ ആർഎൻഎകൾ (സിആർഎൻഎകൾ), പിവി-ഇന്ററാക്ടിംഗ് ആർഎൻഎകൾ (പിആർഎൻഎകൾ) എന്നിവ ഉൾപ്പെടുന്നു.ഇവയിൽ, ഏകദേശം 20-24 ന്യൂക്ലിയോടൈഡുകൾ നീളമുള്ള മൈആർഎൻഎകൾ, വിവിധ സെല്ലുലാർ പ്രക്രിയകളിലെ സുപ്രധാനമായ നിയന്ത്രണ റോളുകൾക്ക് പ്രത്യേകിച്ചും ശ്രദ്ധേയമാണ്.ടിഷ്യു-നിർദ്ദിഷ്ടവും ഘട്ടം-നിർദ്ദിഷ്ടവുമായ എക്സ്പ്രഷൻ പാറ്റേണുകൾ ഉപയോഗിച്ച്, miRNA-കൾ വിവിധ സ്പീഷീസുകളിലുടനീളം ഉയർന്ന സംരക്ഷണം പ്രകടിപ്പിക്കുന്നു.
പ്ലാറ്റ്ഫോം: Illumina NovaSeq
-
സർക്ആർഎൻഎ സീക്വൻസിങ്-ഇല്ലുമിന
വൃത്താകൃതിയിലുള്ള RNA സീക്വൻസിങ് (circRNA-seq) എന്നത് വൃത്താകൃതിയിലുള്ള RNA-കളെ പ്രൊഫൈൽ ചെയ്യുകയും വിശകലനം ചെയ്യുകയും ചെയ്യുന്നതാണ്, ഇത് കാനോനിക്കൽ അല്ലാത്ത വിഭജന സംഭവങ്ങൾ കാരണം അടച്ച ലൂപ്പുകളായി മാറുന്ന ആർഎൻഎ തന്മാത്രകളുടെ ഒരു ക്ലാസ്, ഈ ആർഎൻഎയ്ക്ക് വർദ്ധിച്ച സ്ഥിരത നൽകുന്നു.ചില സർക്ആർഎൻഎകൾ മൈക്രോആർഎൻഎ സ്പോഞ്ചുകളായി പ്രവർത്തിക്കുകയും മൈക്രോആർഎൻഎകളെ വേർതിരിക്കുകയും അവയുടെ ടാർഗെറ്റ് എംആർഎൻഎകളെ നിയന്ത്രിക്കുന്നതിൽ നിന്ന് തടയുകയും ചെയ്യുന്നതായി തെളിയിക്കപ്പെട്ടിട്ടുണ്ടെങ്കിലും, മറ്റ് സർക്ആർഎൻഎകൾ പ്രോട്ടീനുകളുമായി ഇടപഴകുകയോ ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ മോഡുലേറ്റ് ചെയ്യുകയോ സെല്ലുലാർ പ്രക്രിയകളിൽ പങ്കുവഹിക്കുകയോ ചെയ്യാം.സർക്ആർഎൻഎ എക്സ്പ്രഷൻ വിശകലനം ഈ തന്മാത്രകളുടെ നിയന്ത്രിത റോളുകളെക്കുറിച്ചും വിവിധ സെല്ലുലാർ പ്രക്രിയകൾ, വികസന ഘട്ടങ്ങൾ, രോഗാവസ്ഥകൾ എന്നിവയിൽ അവയുടെ പ്രാധാന്യത്തെക്കുറിച്ചും ഉള്ള ഉൾക്കാഴ്ചകൾ നൽകുന്നു, ഇത് ജീൻ എക്സ്പ്രഷന്റെ പശ്ചാത്തലത്തിൽ ആർഎൻഎ നിയന്ത്രണത്തിന്റെ സങ്കീർണ്ണതയെക്കുറിച്ച് ആഴത്തിൽ മനസ്സിലാക്കാൻ സഹായിക്കുന്നു.
-
മുഴുവൻ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ് സീക്വൻസിംഗ് - ഇല്ലുമിന
കോഡിംഗും (mRNA) നോൺ-കോഡിംഗ് ആർഎൻഎകളും (lncRNA, circRNA, miRNA) ഉൾക്കൊള്ളുന്ന, വൈവിധ്യമാർന്ന RNA തന്മാത്രകളെ പ്രൊഫൈൽ ചെയ്യുന്നതിനുള്ള ഒരു സമഗ്രമായ സമീപനമാണ് ഹോൾ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം സീക്വൻസിംഗ് വാഗ്ദാനം ചെയ്യുന്നത്.സെല്ലുലാർ പ്രക്രിയകളെക്കുറിച്ചുള്ള സമഗ്രമായ ധാരണയെ അനുവദിക്കുന്ന ഒരു നിശ്ചിത നിമിഷത്തിൽ ഈ സാങ്കേതികത പ്രത്യേക സെല്ലുകളുടെ പൂർണ്ണമായ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റം പിടിച്ചെടുക്കുന്നു."മൊത്തം ആർഎൻഎ സീക്വൻസിങ്" എന്നും അറിയപ്പെടുന്നു, ഇത് ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം തലത്തിൽ സങ്കീർണ്ണമായ റെഗുലേറ്ററി നെറ്റ്‌വർക്കുകൾ അനാവരണം ചെയ്യാൻ ലക്ഷ്യമിടുന്നു, മത്സരിക്കുന്ന എൻഡോജെനസ് ആർഎൻഎ (സിആർഎൻഎ), ജോയിന്റ് ആർഎൻഎ വിശകലനം എന്നിവ പോലുള്ള ആഴത്തിലുള്ള വിശകലനം സാധ്യമാക്കുന്നു.ഇത് പ്രവർത്തനപരമായ സ്വഭാവരൂപീകരണത്തിലേക്കുള്ള പ്രാരംഭ ഘട്ടത്തെ അടയാളപ്പെടുത്തുന്നു, പ്രത്യേകിച്ചും സർക്ആർഎൻഎ-മൈആർഎൻഎ-എംആർഎൻഎ-അധിഷ്ഠിത സിആർഎൻഎ ഇടപെടലുകൾ ഉൾപ്പെടുന്ന റെഗുലേറ്ററി നെറ്റ്‌വർക്കുകൾ അനാവരണം ചെയ്യുന്നതിൽ.
