-
മുഴുനീള mRNA സീക്വൻസിങ്-നാനോപോർ
സമഗ്രമായ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം വിശകലനത്തിനുള്ള അമൂല്യമായ ഉപകരണമാണ് ആർഎൻഎ സീക്വൻസിങ്.സംശയമില്ല, പരമ്പരാഗത ഷോർട്ട്-റീഡ് സീക്വൻസിങ് ഇവിടെ നിരവധി സുപ്രധാന വികസനം കൈവരിച്ചു.എന്നിരുന്നാലും, പൂർണ്ണ ദൈർഘ്യമുള്ള ഐസോഫോം ഐഡന്റിഫിക്കേഷനുകൾ, അളവ്, പിസിആർ ബയസ് എന്നിവയിൽ ഇത് പലപ്പോഴും പരിമിതികൾ നേരിടുന്നു.
നാനോപോർ സീക്വൻസിംഗ് മറ്റ് സീക്വൻസിംഗ് പ്ലാറ്റ്‌ഫോമുകളിൽ നിന്ന് സ്വയം വേറിട്ടുനിൽക്കുന്നു, ന്യൂക്ലിയോടൈഡുകൾ ഡിഎൻഎ സിന്തസിസ് കൂടാതെ നേരിട്ട് വായിക്കുകയും പതിനായിരക്കണക്കിന് കിലോബേസിൽ ദീർഘനേരം വായിക്കുകയും ചെയ്യുന്നു.ഇത് ഡയറക്ട് റീഡ്-ഔട്ട് ക്രോസിംഗ് ഫുൾ-ലെങ്ത് ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റുകൾക്കും ഐസോഫോം-ലെവൽ പഠനങ്ങളിലെ വെല്ലുവിളികളെ നേരിടാനും പ്രാപ്തമാക്കുന്നു.
പ്ലാറ്റ്ഫോം：നാനോപോർ പ്രൊമെതിഒൻ
പുസ്തകശാല:cDNA-PCR
-
ഡി നോവോ മുഴുനീള ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ് സീക്വൻസിങ് -PacBio
ഡി നോവോമുഴുനീള ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ് സീക്വൻസിംഗ്, എന്നും അറിയപ്പെടുന്നുഡി നോവോIso-Seq PacBio സീക്വൻസറിന്റെ റീഡ് ലെങ്ത് പ്രയോജനപ്പെടുത്തുന്നു, ഇത് പൂർണ്ണ ദൈർഘ്യമുള്ള cDNA തന്മാത്രകളെ ഇടവേളകളില്ലാതെ ക്രമപ്പെടുത്തുന്നത് സാധ്യമാക്കുന്നു.ഇത് ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ് അസംബ്ലി ഘട്ടങ്ങളിൽ ഉണ്ടാകുന്ന പിശകുകൾ പൂർണ്ണമായും ഒഴിവാക്കുകയും ഐസോഫോം-ലെവൽ റെസല്യൂഷനോടുകൂടിയ യൂണിജീൻ സെറ്റുകൾ നിർമ്മിക്കുകയും ചെയ്യുന്നു.ഈ യൂണിജീൻ സെറ്റുകൾ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം തലത്തിൽ "റഫറൻസ് ജീനോം" ആയി ശക്തമായ ജനിതക വിവരങ്ങൾ നൽകുന്നു.കൂടാതെ, അടുത്ത തലമുറ സീക്വൻസിങ് ഡാറ്റയുമായി സംയോജിപ്പിച്ച്, ഈ സേവനം ഐസോഫോം-ലെവൽ എക്‌സ്‌പ്രഷന്റെ കൃത്യമായ അളവെടുപ്പ് ശക്തമാക്കുന്നു.
പ്ലാറ്റ്ഫോം: PacBio സീക്വൽ IIലൈബ്രറി: SMRT ബെൽ ലൈബ്രറി -
യൂക്കറിയോട്ടിക് mRNA സീക്വൻസിങ്-ഇല്ലുമിന
mRNA സീക്വൻസിംഗ് പ്രത്യേക വ്യവസ്ഥകളിൽ സെല്ലുകളിൽ നിന്ന് ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ് ചെയ്ത എല്ലാ mRNA-കളുടെയും പ്രൊഫൈലിംഗ് സാധ്യമാക്കുന്നു.ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ പ്രൊഫൈൽ, ജീൻ ഘടനകൾ, ചില ജൈവ പ്രക്രിയകളുടെ തന്മാത്രാ സംവിധാനങ്ങൾ എന്നിവ വെളിപ്പെടുത്തുന്നതിനുള്ള ശക്തമായ സാങ്കേതികവിദ്യയാണിത്.ഇന്നുവരെ, അടിസ്ഥാന ഗവേഷണം, ക്ലിനിക്കൽ ഡയഗ്‌നോസ്റ്റിക്‌സ്, ഡ്രഗ് ഡെവലപ്‌മെന്റ് മുതലായവയിൽ mRNA സീക്വൻസിംഗ് വ്യാപകമായി ഉപയോഗിച്ചുവരുന്നു.
പ്ലാറ്റ്ഫോം: Illumina NovaSeq 6000
-
നോൺ-റഫറൻസ് അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള mRNA സീക്വൻസിങ്-ഇല്ലുമിന
ചില പ്രത്യേക ഫംഗ്‌ഷനുകൾ സജീവമാകുന്ന നിശ്ചിത കാലയളവിൽ മെസഞ്ചർ ആർഎൻഎ (എംആർഎൻഎ) ഫോം യൂക്കറിയോട്ട് പിടിച്ചെടുക്കാൻ എംആർഎൻഎ സീക്വൻസിങ് അടുത്ത തലമുറ സീക്വൻസിങ് ടെക്നിക് (എൻജിഎസ്) സ്വീകരിക്കുന്നു.ഏറ്റവും ദൈർഘ്യമേറിയ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റിനെ 'യൂണിജീൻ' എന്ന് വിളിക്കുകയും തുടർന്നുള്ള വിശകലനത്തിനുള്ള റഫറൻസ് സീക്വൻസായി ഉപയോഗിക്കുകയും ചെയ്തു, ഇത് റഫറൻസില്ലാതെ സ്പീഷിസിന്റെ തന്മാത്രാ സംവിധാനവും നിയന്ത്രണ ശൃംഖലയും പഠിക്കുന്നതിനുള്ള ഫലപ്രദമായ മാർഗമാണ്.
ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ് ഡാറ്റ അസംബ്ലിക്കും യൂണിജീൻ ഫംഗ്ഷണൽ വ്യാഖ്യാനത്തിനും ശേഷം
(1)എസ്എൻപി വിശകലനം, എസ്എസ്ആർ വിശകലനം, സിഡിഎസ് പ്രവചനം, ജീൻ ഘടന എന്നിവ മുൻകൂട്ടി തയ്യാറാക്കും.
(2) ഓരോ സാമ്പിളിലെയും യൂണിജീൻ എക്‌സ്‌പ്രഷന്റെ അളവ് നിർണ്ണയിക്കും.
(3) സാമ്പിളുകൾ (അല്ലെങ്കിൽ ഗ്രൂപ്പുകൾ) തമ്മിലുള്ള വ്യത്യസ്തമായി പ്രകടിപ്പിക്കുന്ന യൂണിജീനുകൾ ഏകീകൃത ആവിഷ്കാരത്തെ അടിസ്ഥാനമാക്കി കണ്ടെത്തും
(4) വ്യത്യസ്തമായി പ്രകടിപ്പിക്കുന്ന യൂണിജീനുകളുടെ ക്ലസ്റ്ററിംഗ്, പ്രവർത്തനപരമായ വ്യാഖ്യാനം, സമ്പുഷ്ടീകരണ വിശകലനം എന്നിവ നടത്തും.
-
നീണ്ട നോൺ-കോഡിംഗ് സീക്വൻസിങ്-ഇല്ലുമിന
ലോംഗ് നോൺ-കോഡിംഗ് ആർ‌എൻ‌എകൾ (എൽ‌എൻ‌സിആർ‌എൻ‌എകൾ) 200 എൻ‌ടിയിൽ കൂടുതൽ നീളമുള്ള ഒരു തരം ആർഎൻഎ തന്മാത്രകളാണ്, അവ വളരെ കുറഞ്ഞ കോഡിംഗ് സാധ്യതയുള്ളവയാണ്.നോൺ-കോഡിംഗ് ആർഎൻഎകളിലെ പ്രധാന അംഗമെന്ന നിലയിൽ LncRNA പ്രധാനമായും ന്യൂക്ലിയസിലും പ്ലാസ്മയിലും കാണപ്പെടുന്നു.സീക്വൻസിങ് ടെക്‌നോളജിയിലും ബയോ ഇൻഫോർറ്റിക്‌സിലുമുള്ള വികസനം നിരവധി നോവൽ എൽഎൻസിആർഎൻഎകളെ തിരിച്ചറിയാനും ജീവശാസ്ത്രപരമായ പ്രവർത്തനങ്ങളുമായി ബന്ധപ്പെടുത്താനും സഹായിക്കുന്നു.എപിജെനെറ്റിക് റെഗുലേഷൻ, ട്രാൻസ്ക്രിപ്ഷൻ റെഗുലേഷൻ, പോസ്റ്റ്-ട്രാൻസ്ക്രിപ്ഷൻ റെഗുലേഷൻ എന്നിവയിൽ lncRNA വ്യാപകമായി ഉൾപ്പെട്ടിട്ടുണ്ടെന്ന് സഞ്ചിത തെളിവുകൾ സൂചിപ്പിക്കുന്നു.
-
ചെറിയ RNA സീക്വൻസിങ്-ഇല്ലുമിന
മൈക്രോ RNA (miRNA), ചെറിയ ഇടപെടൽ RNA (siRNA), പിവി-ഇന്ററാക്ടിംഗ് RNA (piRNA) എന്നിവയുൾപ്പെടെ സാധാരണയായി 200nt-ൽ താഴെ നീളമുള്ള നോൺ-കോഡിംഗ് RNA തന്മാത്രകളുടെ ഒരു വിഭാഗത്തെയാണ് ചെറിയ RNA സൂചിപ്പിക്കുന്നത്.
മൈക്രോആർഎൻഎ (മൈആർഎൻഎ) എന്നത് 20-24nt നീളമുള്ള എൻഡോജെനസ് ചെറിയ ആർഎൻഎയുടെ ഒരു വിഭാഗമാണ്, ഇത് കോശങ്ങളിൽ വിവിധ പ്രധാന നിയന്ത്രണ റോളുകൾ വഹിക്കുന്നു.miRNA പല ജീവിത പ്രക്രിയകളിൽ ഉൾപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു, അത് ടിഷ്യു വെളിപ്പെടുത്തുന്നു - നിർദ്ദിഷ്ടവും ഘട്ടവും - നിർദ്ദിഷ്ട പ്രകടനവും വ്യത്യസ്ത സ്പീഷീസുകളിൽ വളരെ സംരക്ഷിക്കപ്പെടുന്നു.
-
സർക്ആർഎൻഎ സീക്വൻസിങ്-ഇല്ലുമിന
ഒരു നിശ്ചിത സമയത്ത് പ്രത്യേക സെല്ലുകളാൽ ട്രാൻസ്‌ക്രൈബ് ചെയ്യപ്പെടുന്ന കോഡിംഗും (mRNA), നോൺ-കോഡിംഗ് RNA-കളും (lncRNA, circRNA, miRNA എന്നിവയുൾപ്പെടെ) എല്ലാത്തരം RNA തന്മാത്രകളും പ്രൊഫൈൽ ചെയ്യുന്നതിനാണ് ഹോൾ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം സീക്വൻസിംഗ് രൂപകൽപ്പന ചെയ്തിരിക്കുന്നത്."മൊത്തം RNA സീക്വൻസിങ്" എന്നും അറിയപ്പെടുന്ന ഹോൾ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ് സീക്വൻസിംഗ്, ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ് തലത്തിൽ സമഗ്രമായ റെഗുലേറ്ററി നെറ്റ്‌വർക്കുകൾ വെളിപ്പെടുത്താൻ ലക്ഷ്യമിടുന്നു.NGS സാങ്കേതികവിദ്യ പ്രയോജനപ്പെടുത്തി, ceRNA വിശകലനത്തിനും സംയുക്ത RNA വിശകലനത്തിനും മുഴുവൻ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം ഉൽപ്പന്നങ്ങളുടെ സീക്വൻസുകളും ലഭ്യമാണ്, ഇത് പ്രവർത്തനപരമായ സ്വഭാവരൂപീകരണത്തിലേക്കുള്ള ആദ്യപടി നൽകുന്നു.സർക്ആർഎൻഎ-മിആർഎൻഎ-എംആർഎൻഎ അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള സിആർഎൻഎയുടെ നിയന്ത്രണ ശൃംഖല വെളിപ്പെടുത്തുന്നു.
-
മുഴുവൻ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ് സീക്വൻസിങ് - ഇല്ലുമിന
ഒരു നിശ്ചിത സമയത്ത് പ്രത്യേക സെല്ലുകളാൽ ട്രാൻസ്‌ക്രൈബ് ചെയ്യപ്പെടുന്ന കോഡിംഗും (mRNA), നോൺ-കോഡിംഗ് RNA-കളും (lncRNA, circRNA, miRNA എന്നിവയുൾപ്പെടെ) എല്ലാത്തരം RNA തന്മാത്രകളും പ്രൊഫൈൽ ചെയ്യുന്നതിനാണ് ഹോൾ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം സീക്വൻസിംഗ് രൂപകൽപ്പന ചെയ്തിരിക്കുന്നത്."മൊത്തം RNA സീക്വൻസിങ്" എന്നും അറിയപ്പെടുന്ന ഹോൾ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ് സീക്വൻസിംഗ്, ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ് തലത്തിൽ സമഗ്രമായ റെഗുലേറ്ററി നെറ്റ്‌വർക്കുകൾ വെളിപ്പെടുത്താൻ ലക്ഷ്യമിടുന്നു.NGS സാങ്കേതികവിദ്യ പ്രയോജനപ്പെടുത്തി, ceRNA വിശകലനത്തിനും സംയുക്ത RNA വിശകലനത്തിനും മുഴുവൻ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം ഉൽപ്പന്നങ്ങളുടെ സീക്വൻസുകളും ലഭ്യമാണ്, ഇത് പ്രവർത്തനപരമായ സ്വഭാവരൂപീകരണത്തിലേക്കുള്ള ആദ്യപടി നൽകുന്നു.സർക്ആർഎൻഎ-മിആർഎൻഎ-എംആർഎൻഎ അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള സിആർഎൻഎയുടെ നിയന്ത്രണ ശൃംഖല വെളിപ്പെടുത്തുന്നു.
-
പ്രോകാരിയോട്ടിക് ആർഎൻഎ സീക്വൻസിങ്
മാറിക്കൊണ്ടിരിക്കുന്ന സെല്ലുലാർ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം വിശകലനം ചെയ്തുകൊണ്ട് ഒരു നിശ്ചിത നിമിഷത്തിൽ ആർഎൻഎയുടെ സാന്നിധ്യവും അളവും വെളിപ്പെടുത്താൻ പ്രോകാരിയോട്ടിക് ആർഎൻഎ സീക്വൻസിംഗ് അടുത്ത തലമുറ സീക്വൻസിംഗ് (NGS) ഉപയോഗിക്കുന്നു.ഞങ്ങളുടെ കമ്പനിയുടെ പ്രോകാരിയോട്ടിക് ആർഎൻഎ സീക്വൻസിംഗ്, റഫറൻസ് ജീനോമുകളുള്ള പ്രോകാരിയോട്ടുകളെ പ്രത്യേകമായി ലക്ഷ്യമിടുന്നു, നിങ്ങൾക്ക് ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം പ്രൊഫൈലിംഗ്, ജീൻ ഘടന വിശകലനം മുതലായവ നൽകുന്നു. അടിസ്ഥാന ശാസ്ത്ര ഗവേഷണം, മയക്കുമരുന്ന് ഗവേഷണം, വികസനം എന്നിവയിലും മറ്റും ഇത് വ്യാപകമായി പ്രയോഗിക്കപ്പെടുന്നു.
പ്ലാറ്റ്ഫോം: Illumina NovaSeq 6000
-
മെറ്റാട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം സീക്വൻസിങ്
മെറ്റാട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം സീക്വൻസിംഗ് പ്രകൃതിദത്ത ചുറ്റുപാടുകൾക്കുള്ളിൽ (അതായത് മണ്ണ്, വെള്ളം, കടൽ, മലം, കുടൽ) സൂക്ഷ്മാണുക്കളുടെ (യൂക്കറിയോട്ടുകളും പ്രോകാരിയോട്ടുകളും) ജീൻ പ്രകടനത്തെ തിരിച്ചറിയുന്നു. പ്രത്യേകിച്ചും, സങ്കീർണ്ണമായ സൂക്ഷ്മജീവ സമൂഹങ്ങളുടെ മുഴുവൻ ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ പ്രൊഫൈലിംഗ്, ടാക്സോണമിക് വിശകലനം എന്നിവ നേടുന്നതിന് ഈ സേവനം നിങ്ങളെ അനുവദിക്കുന്നു. ജീവിവർഗങ്ങൾ, വ്യത്യസ്തമായി പ്രകടിപ്പിക്കുന്ന ജീനുകളുടെ പ്രവർത്തനപരമായ സമ്പുഷ്ടീകരണ വിശകലനം, കൂടാതെ മറ്റു പലതും.
പ്ലാറ്റ്ഫോം: Illumina NovaSeq 6000
