-
PacBio-Бүрэн хэмжээний транскриптом (Лавлах бус)
Amplicon (16S/18S/ITS) платформ нь бичил биетний олон янз байдлын төслийн шинжилгээний олон жилийн туршлагатай бөгөөд стандартчилагдсан суурь шинжилгээ, хувь хүний шинжилгээг агуулсан: суурь шинжилгээ нь одоогийн бичил биетний судалгааны үндсэн шинжилгээний агуулгыг хамардаг, шинжилгээний агуулга нь баялаг бөгөөд цогц, мөн шинжилгээний үр дүнг төслийн тайлан хэлбэрээр танилцуулсан;Хувь хүний шинжилгээний агуулга нь олон янз байдаг.Шинжилгээний үндсэн тайлан, судалгааны зорилгын дагуу дээжийг сонгож, параметрүүдийг уян хатан байдлаар тохируулж, хувийн шаардлагыг хэрэгжүүлэх боломжтой.Windows үйлдлийн систем, энгийн бөгөөд хурдан.
-
PacBio-Бүрэн хэмжээний транскриптом (Лавлах бус)
Pacific Biosciences (PacBio) изоформ дарааллын өгөгдлийг оролт болгон авч, энэ програм нь бүрэн хэмжээний транскриптийн дарааллыг (угсралтгүйгээр) тодорхойлох боломжтой.Лавлагаа геномын эсрэг бүрэн хэмжээний дарааллыг зурагласнаар транскриптийг мэдэгдэж буй ген, транскрипт, кодлох бүс гэх мэтээр оновчтой болгож болно. Энэ тохиолдолд өөр залгалт гэх мэт мРНХ-ийн бүтцийг илүү нарийвчлалтай тодорхойлох боломжтой болно.NGS транскриптомын дарааллын өгөгдөлтэй хамтарсан дүн шинжилгээ хийх нь транскриптийн түвшинд илүү дэлгэрэнгүй тайлбар хийх, илэрхийлэлд илүү нарийвчлалтай тоон тогтоох боломжийг олгодог бөгөөд энэ нь доод урсгалын дифференциал илэрхийлэл болон функциональ шинжилгээнд ихээхэн ач тустай байдаг.
-
Хэрэгслийн хэрэгсэл
BMKCloud нь анагаах ухаан, хөдөө аж ахуй, байгаль орчин гэх мэт янз бүрийн салбарын судлаачдын итгэлийг хүлээсэн геномын программыг нэг цэгийн шийдлээр хангадаг тэргүүлэх биоинформатик платформ юм. BMKCloud нь биоинформатик шинжилгээний платформ, багаж хэрэгслийг багтаасан нэгдсэн, найдвартай, үр ашигтай үйлчилгээ үзүүлэх үүрэгтэй. , тооцоолох нөөц, олон нийтийн мэдээллийн сан, биоинформатик онлайн курс гэх мэт. BMKCloud нь генийн тайлбар, хувьслын генетик хэрэгсэл, ncRNA, өгөгдлийн чанарын хяналт, угсралт, уялдуулах, өгөгдөл олборлох, мутаци, статистик, дүрс үүсгэгч, дараалал гэх мэт байнга ашиглагддаг био мэдээллийн хэрэгслүүдтэй. шинжилгээ гэх мэт.
-
жижиг РНХ
Жижиг РНХ нь миРНХ, сиРНХ, пиРНХ зэрэг дунджаар 18-30 нт урттай богино кодчилдоггүй РНХ-ийн төрөл юм.Эдгээр жижиг РНХ нь мРНХ-ийн задрал, орчуулгыг дарангуйлах, гетерохроматин үүсэх гэх мэт янз бүрийн биологийн үйл явцад оролцдог гэж мэдээлсэн. SmallRNA дарааллын шинжилгээг амьтан/ургамлын хөгжил, өвчин, вирус гэх мэт судалгаанд өргөнөөр ашигласан. дарааллын шинжилгээний платформ нь стандарт шинжилгээ, дэвшилтэт өгөгдөл олборлолтоос бүрдэнэ.РНХ-ийн дарааллын өгөгдөл дээр үндэслэн стандарт шинжилгээ нь миРНХ-ийг тодорхойлох, урьдчилан таамаглах, миРНХ-ийн зорилтот генийг урьдчилан таамаглах, тэмдэглэгээ хийх, экспрессийн шинжилгээ хийх боломжтой.Нарийвчилсан шинжилгээ нь тохируулсан миРНХ-ийн хайлт, олборлолт, Венн диаграм үүсгэх, miRNA болон зорилтот генийн сүлжээг бий болгох боломжийг олгодог.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS нь Biomarker Technologies-ийн арвин туршлага дээр үндэслэн боловсруулсан геномын дахин дараалал тогтоох шинжилгээний платформ юм.Ашиглахад хялбар энэхүү платформ нь Illumina платформ болон BGI дарааллын платформоос үүсгэсэн ДНХ-ийн дарааллын өгөгдөлд тохирох цөөн хэдэн үндсэн параметрийг тохируулснаар нэгдсэн шинжилгээний ажлын урсгалыг хурдан гаргах боломжийг олгодог.Энэхүү платформ нь өндөр хүчин чадалтай тооцоолох сервер дээр байрлуулсан бөгөөд энэ нь маш хязгаарлагдмал хугацаанд өндөр үр ашигтай өгөгдөлд дүн шинжилгээ хийх боломжийг олгодог.Хувийн өгөгдөл олборлолтыг стандарт шинжилгээний үндсэн дээр хийх боломжтой, үүнд мутацлагдсан генийн хайлт, ПГУ-ын праймер дизайн гэх мэт.
-
мРНХ(Лавлагаа)
Транскриптом нь геномын генетик мэдээлэл ба биологийн үйл ажиллагааны протеомын хоорондох холбоос юм.Транскрипцийн түвшний зохицуулалт нь организмын зохицуулалтын хамгийн чухал бөгөөд хамгийн өргөн судлагдсан хэлбэр юм.Транскриптомын дараалал нь нэг нуклеотидын нарийвчлалтайгаар транскриптомын дарааллыг ямар ч үед, ямар ч нөхцөлд хийж болно. Энэ нь генийн транскрипцийн түвшинг динамикаар тусгаж, ховор, хэвийн транскриптийг нэгэн зэрэг тодорхойлж, тоон үзүүлэлтийг гаргаж, бүтцийн мэдээллээр хангадаг. тусгай хуулбарын дээж.
Одоогийн байдлаар транскриптомын дараалал тогтоох технологи нь амьтан, ургамлын хөгжлийг зохицуулах, хүрээлэн буй орчны дасан зохицох, дархлааны харилцан үйлчлэл, генийн нутагшуулах, төрөл зүйлийн генетик хувьсал, хавдар, удамшлын өвчнийг илрүүлэх зэрэг агрономи, анагаах ухаан болон бусад судалгааны салбарт өргөн хэрэглэгдэж байна.
-
Метагеномик (NGS)
Энэхүү шинжилгээний платформ нь олон жилийн туршлага дээр үндэслэн бууны метагеномын өгөгдөлд дүн шинжилгээ хийхэд зориулагдсан болно.Энэ нь өгөгдөл боловсруулах, зүйлийн түвшний судалгаа, генийн функцын түвшний судалгаа, метагеномын холболт гэх мэт нийтлэг хэрэгцээтэй төрөл бүрийн метагеномикийн шинжилгээг агуулсан нэгдсэн ажлын урсгалаас бүрддэг. Үүнээс гадна ген, зүйлийн асуулга зэрэг стандарт шинжилгээний ажлын урсгалын дагуу захиалгат өгөгдөл олборлох хэрэгслийг ашиглах боломжтой. , параметрийн тохиргоо, хувь хүний дүрс үүсгэх гэх мэт.
-
LncRNA
Урт кодчилдоггүй РНХ (lncRNA) нь уургийг кодлох чадваргүй, 200 нт-ээс урт урттай транскриптийн нэг төрөл юм.Хуримтлагдсан нотолгоо нь ихэнх lncRNA-ууд ажиллах чадвартай байдаг.Өндөр хүчин чадалтай дэс дарааллын технологи, биоинформатик шинжилгээний хэрэгслүүд нь lncRNA-ийн дараалал, байршлын мэдээллийг илүү үр дүнтэй илрүүлэх боломжийг бидэнд олгож, зохицуулах чухал үүрэгтэй lncRNA-г илрүүлэхэд хүргэдэг.BMKCloud нь үйлчлүүлэгчдээ хурдан, найдвартай, уян хатан lncRNA шинжилгээнд хүрэхийн тулд lncRNA дарааллын шинжилгээний платформоор хангаж байгаадаа баяртай байна.
-
GWAS
Геномын өргөн хүрээний нийгэмлэгийн судалгаа (GWAS) нь тодорхой шинж чанартай (фенотип) холбоотой генетикийн хувилбаруудыг (генотип) тодорхойлох зорилготой.GWA судалгаа нь олон тооны хүмүүсийн геномын бүхэл бүтэн геномоор дамждаг генетик маркеруудыг судалж, популяцийн түвшинд статистик дүн шинжилгээ хийх замаар генотип-фенотипийн холбоог урьдчилан таамагладаг.Бүтэн геномын дараалал нь бүх генетикийн хувилбаруудыг илрүүлэх боломжтой.Фенотипийн өгөгдөлтэй хослуулан GWAS-ийг фенотиптэй холбоотой SNP, QTL болон нэр дэвшигч генийг тодорхойлохын тулд боловсруулж болох бөгөөд энэ нь орчин үеийн амьтан/ургамлын үржлийг хүчтэй дэмждэг.SLAF бол геномын хэмжээнд тархсан маркер болох SNP-ийг илрүүлдэг өөрөө боловсруулсан хялбаршуулсан геномын дарааллын стратеги юм.Эдгээр SNP-ийг молекул генетикийн маркер болгон зорилтот шинж чанаруудтай холбоо тогтоох судалгаанд боловсруулж болно.Энэ нь удамшлын өөрчлөлттэй холбоотой нарийн төвөгтэй шинж чанаруудыг тодорхойлох зардал багатай стратеги юм.
-
Nanopore Бүрэн хэмжээний транскриптомик
Организм дахь цогц ба хувьсах өөр изоформууд нь генийн илэрхийлэл, уургийн олон янз байдлыг зохицуулах генетикийн чухал механизм юм.Транскриптийн бүтцийг нарийн тодорхойлох нь генийн илэрхийллийн зохицуулалтын хэв маягийг гүнзгий судлах үндэс суурь болдог.Nanopore секвенцийн платформ нь транскриптомийн судалгааг изоформын түвшинд амжилттай хүргэсэн.Энэхүү шинжилгээний платформ нь Nanopore платформ дээр үүсгэгдсэн RNA-Seq өгөгдлийг лавлагаа геномын үндсэн дээр шинжлэхэд зориулагдсан бөгөөд энэ нь генийн түвшин болон транскриптийн түвшинд чанарын болон тоон шинжилгээг хийдэг.
