Бүтээгдэхүүн

Прокариот РНХ-ийн дараалал

Прокариот РНХ-ийн дараалал нь өөрчлөгдөж буй эсийн транскриптомд дүн шинжилгээ хийх замаар тухайн агшинд РНХ-ийн оршихуй, тоо хэмжээг илрүүлэхийн тулд дараагийн үеийн дараалал (NGS) -ийг ашигладаг.Манай компанийн прокариот РНХ-ийн дараалал нь лавлагаа геном бүхий прокариотуудад тусгайлан чиглэж, танд транскриптомын профайлыг тогтоох, генийн бүтцийн шинжилгээ гэх мэтээр хангадаг. Энэ нь шинжлэх ухааны суурь судалгаа, эмийн судалгаа, хөгжүүлэлт болон бусад олон салбарт өргөн хэрэглэгдэж ирсэн.

Платформ: Illumina NovaSeq платформ

Бидэнтэй холбоо барина уу

Үйлчилгээний дэлгэрэнгүй мэдээлэл

Үйлчилгээний үзүүлэлтүүд

Платформ: Illumina NovaSeq платформ, PE150

Номын сангийн төрөл: 350bp cDNA сан оруулах (оргил тархалтаас хамаарна)

Дарааллын стратеги: Хосолсон-Төгсгөл 150 bp

Санал болгож буй өгөгдлийн хэмжээ: 2 Гб түүхий өгөгдөл/дээж

Биоинформатик

(1) Мэдээллийн чанарын хяналтыг дараалалд оруулах: Нуклеотидын тархалт, Үндсэн чанарын тархалт, rRNA харьцааны үнэлгээ;

(2) дэс дарааллын дүн шинжилгээ: Алины үр дүнгийн статистик, дарааллын ханалт, дарааллын хамрах хүрээ;

(3) Лавлагааны геномын тайлбар (NR, Swiss-Prot, Pfam, COG, GO, KEGG);

(4) Илэрхийллийн шинжилгээ: Илэрхийллийн тархалт (Хоёр ба түүнээс дээш дээжтэй), Түүвэр хоорондын илэрхийллийн шинжилгээ (Венн шинжилгээ, Корреляцийн шинжилгээ, PCA шинжилгээ);

(5) Дифференциал илэрхийллийн шинжилгээ (Хоёр ба түүнээс дээш дээжтэй);

(6) Генийн багцын шинжилгээ: Веннийн шинжилгээ, Кластерын шинжилгээ, Функцийн тэмдэглэгээний шинжилгээ (COG, GO, KEGG), Функцийн баяжуулалтын шинжилгээ (GO, KEGG), Функцийн баяжуулалтын хөвч график, Ипатын шинжилгээ;

(7) sRNA шинжилгээ: sRNA-ийн таамаглал, sRNA-ийн тайлбар (Blast, sRNAMap, sRNATarBase, SIPHT, Rfam), sRNA-ийн хоёрдогч бүтцийн таамаглал, sRNA зорилтот генийн таамаглал;

(8) Транскриптийн бүтцийн шинжилгээ: Опероны шинжилгээ, Транскрипцийн эхлэл ба төгсгөлийн сайтуудын таамаглал, UTR тэмдэглэгээ ба шинжилгээ, Промотерийн дарааллын таамаглал, SNP/InDel шинжилгээ (SNP/InDel тайлбар, SNP/InDel бүс нутгийн тархалт, SNP статистик).