-
Бүрэн хэмжээний мРНХ-ийн дараалал-Нанопор
РНХ-ийн дараалал нь транскриптомын цогц шинжилгээ хийхэд үнэлж баршгүй хэрэгсэл болсон.Богино уншлагын уламжлалт дараалал нь энд олон чухал хөгжилд хүрсэн нь эргэлзээгүй.Гэсэн хэдий ч энэ нь ихэвчлэн бүрэн хэмжээний изоформыг тодорхойлох, тоон үзүүлэлт, ПГУ-ын хэвийх байдалд хязгаарлалттай тулгардаг.
Нанопорын дараалал нь нуклеотидууд нь ДНХ-ийн нийлэгжилтгүйгээр шууд уншигдаж, хэдэн арван килобазад урт уншилт үүсгэдэг гэдгээрээ бусад дарааллын платформуудаас ялгардаг.Энэ нь бүрэн хэмжээний хуулбарыг шууд унших, изоформ түвшний судалгаанд тулгарч буй бэрхшээлийг шийдвэрлэх боломжийг олгодог.
Платформ:Nanopore PromethION
Номын сан:cDNA-ПГУ
-
De novo Бүрэн хэмжээний транскриптомын дараалал -PacBio
De novoбүрэн хэмжээний транскриптомын дараалал гэж нэрлэдэгDe novoIso-Seq нь унших уртаараа PacBio секвенжерийн давуу талыг ашигладаг бөгөөд энэ нь бүрэн хэмжээний cDNA молекулуудыг ямар ч завсарлагагүйгээр дараалалд оруулах боломжийг олгодог.Энэ нь транскриптийг угсрах үе шатанд үүссэн аливаа алдаанаас бүрэн зайлсхийж, изоформ түвшний нарийвчлалтай унигений багцуудыг байгуулдаг.Энэхүү унигений багц нь транскриптомын түвшинд "лавлагаа геном" болох хүчирхэг генетик мэдээллийг өгдөг.Нэмж дурдахад, энэ үйлчилгээ нь дараагийн үеийн дарааллын өгөгдөлтэй хослуулан изоформын түвшний илэрхийлэлийг үнэн зөв тооцоолох боломжийг олгодог.
Платформ: PacBio Sequel IIНомын сан: SMRT хонхны номын сан -
Эукариот мРНХ-ийн дараалал-Illumina
мРНХ-ийн дараалал нь тодорхой нөхцөлд эсээс хуулбарлагдсан бүх мРНХ-ийн профайлыг тодорхойлох боломжийг олгодог.Энэ нь генийн илэрхийлэл, генийн бүтэц, биологийн тодорхой үйл явцын молекулын механизмыг илрүүлэх хүчирхэг технологи юм.Өнөөдрийг хүртэл мРНХ-ийн дарааллыг суурь судалгаа, эмнэлзүйн оношлогоо, эм боловсруулах гэх мэт өргөн хүрээнд ашиглаж байна.
Платформ: Illumina NovaSeq 6000
-
Лавлагаа бус mRNA дараалал-Illumina
мРНХ-ийн дараалал нь дараагийн үеийн дарааллын техникийг (NGS) ашигладаг бөгөөд зарим тусгай функцууд идэвхжиж байгаа тодорхой хугацаанд эукариотын элч РНХ (мРНХ)-ийг барьж авдаг.Хамгийн урт хуулбарыг 'Unigene' гэж нэрлэсэн бөгөөд дараагийн шинжилгээнд жишиг дараалал болгон ашигласан нь тухайн зүйлийн молекулын механизм, зохицуулалтын сүлжээг лавлагаагүйгээр судлах үр дүнтэй хэрэгсэл юм.
Транскриптомын өгөгдлийн цуглуулга ба унигений функциональ тайлбарын дараа
(1) SNP шинжилгээ, SSR шинжилгээ, CDS таамаглал, генийн бүтцийг урьдчилан бэлтгэнэ.
(2) Дээж тус бүр дэх унигений илэрхийллийн тоон үзүүлэлтийг хийнэ.
(3) Дээж (эсвэл бүлгүүд) хоорондын ялгавартай илэрхийлэгдсэн унигенийг унигений илэрхийлэлд үндэслэн илрүүлэх болно.
(4) Дифференциалаар илэрхийлэгдсэн унигенүүдийн бөөгнөрөл, функциональ тайлбар, баяжуулалтын шинжилгээг хийнэ.
-
Урт кодчилолгүй дараалал-Illumina
Урт кодчилдоггүй РНХ (lncRNAs) нь 200 н-ээс дээш урттай РНХ молекулуудын нэг төрөл бөгөөд кодлох чадвар нь маш бага байдаг.LncRNA нь кодчилдоггүй РНХ-ийн гол гишүүний хувьд голчлон цөм болон плазмд байдаг.Дараалал тогтоох технологи, биоинформатикийн хөгжил нь олон тооны шинэ lncRNA-г тодорхойлох, тэдгээрийг биологийн функцтэй холбох боломжийг олгодог.Хуримтлагдсан нотолгоо нь lncRNA нь эпигенетик зохицуулалт, транскрипцийн зохицуулалт, транскрипцийн дараах зохицуулалтад өргөнөөр оролцдог болохыг харуулж байна.
-
Жижиг РНХ-ийн дараалал-Illumina
Жижиг РНХ гэдэг нь микро РНХ (миРНХ), жижиг интерференцийн РНХ (siRNA), пиви-харилцаж буй РНХ (piRNA) зэрэг 200 нт-ээс бага урттай кодчилдоггүй РНХ молекулуудын ангиллыг хэлдэг.
МикроРНХ (миРНХ) нь 20-24 н урттай эндоген жижиг РНХ-ийн анги бөгөөд эсэд янз бүрийн чухал зохицуулалтын үүрэг гүйцэтгэдэг.миРНХ нь амьдралын олон үйл явцад оролцдог бөгөөд эд эсийн өвөрмөц болон үе шаттай өвөрмөц илэрхийлэлийг илрүүлдэг бөгөөд янз бүрийн зүйлүүдэд маш их хадгалагддаг.
-
circRNA дараалал-Illumina
Бүхэл бүтэн транскриптомын дараалал нь тодорхой хугацаанд тодорхой эсүүдээр хөрвүүлсэн кодчилол (mRNA) болон кодлогддоггүй РНХ (lncRNA, circRNA, miRNA гэх мэт) зэрэг бүх төрлийн РНХ молекулын профайлд зориулагдсан."Нийт РНХ дараалал" гэж нэрлэгддэг транскриптомын бүхэл дараалал нь транскриптомын түвшний зохицуулалтын иж бүрэн сүлжээг илрүүлэх зорилготой.NGS технологийн давуу талыг ашиглан бүхэл транскриптомын бүтээгдэхүүний дарааллыг ceRNA шинжилгээ болон хамтарсан РНХ-ийн шинжилгээнд ашиглах боломжтой бөгөөд энэ нь функциональ шинж чанарыг тодорхойлох эхний алхам болдог.ЦиркРНХ-миРНХ-мРНХ дээр суурилсан ceRNA-ийн зохицуулалтын сүлжээг илчлэх.
-
Бүхэл бүтэн транскриптомын дараалал - Illumina
Бүхэл бүтэн транскриптомын дараалал нь тодорхой хугацаанд тодорхой эсүүдээр хөрвүүлсэн кодчилол (mRNA) болон кодлогддоггүй РНХ (lncRNA, circRNA, miRNA гэх мэт) зэрэг бүх төрлийн РНХ молекулын профайлд зориулагдсан."Нийт РНХ дараалал" гэж нэрлэгддэг транскриптомын бүхэл дараалал нь транскриптомын түвшний зохицуулалтын иж бүрэн сүлжээг илрүүлэх зорилготой.NGS технологийн давуу талыг ашиглан бүхэл транскриптомын бүтээгдэхүүний дарааллыг ceRNA шинжилгээ болон хамтарсан РНХ-ийн шинжилгээнд ашиглах боломжтой бөгөөд энэ нь функциональ шинж чанарыг тодорхойлох эхний алхам болдог.ЦиркРНХ-миРНХ-мРНХ дээр суурилсан ceRNA-ийн зохицуулалтын сүлжээг илчлэх.
-
Прокариот РНХ-ийн дараалал
Прокариот РНХ-ийн дараалал нь өөрчлөгдөж буй эсийн транскриптомд дүн шинжилгээ хийх замаар тухайн агшинд РНХ байгаа эсэх, тоо хэмжээг илрүүлэхийн тулд дараагийн үеийн дараалал (NGS) -ийг ашигладаг.Манай компанийн прокариот РНХ-ийн дараалал нь лавлагаа геном бүхий прокариотуудад тусгайлан чиглэгдэж, транскриптомын профайлыг тогтоох, генийн бүтцийн шинжилгээ гэх мэтээр хангадаг. Энэ нь шинжлэх ухааны суурь судалгаа, эмийн судалгаа, хөгжүүлэлт болон бусад олон салбарт өргөн хэрэглэгддэг.
Платформ: Illumina NovaSeq 6000
-
Метатранскриптомын дараалал
Метатранскриптомын дараалал нь байгалийн орчинд (хөрс, ус, далай, ялгадас, гэдэс дотор) микробын (эукариот ба прокариотуудын аль алиных нь) генийн илэрхийлэлийг тодорхойлдог. Ялангуяа энэ үйлчилгээ нь нарийн төвөгтэй бичил биетний бүлгүүдийн генийн экспрессийн профайлыг олж авах, ангилал зүйн шинжилгээ хийх боломжийг олгодог. зүйлийн төрөл, өөр өөр илэрхийлэлтэй генийн функциональ баяжуулалтын шинжилгээ гэх мэт.
Платформ: Illumina NovaSeq 6000
