उत्पादने

पूर्ण-लांबीचे mRNA सिक्वेन्सिंग-नॅनोपोर

एनजीएस-आधारित एमआरएनए सिक्वेन्सिंग हे जनुक अभिव्यक्तीचे प्रमाण निश्चित करण्यासाठी एक बहुमुखी साधन आहे, परंतु लहान वाचनांवर अवलंबून राहिल्याने जटिल ट्रान्सक्रिप्टोमिक विश्लेषणांमध्ये त्याची प्रभावीता मर्यादित होते. दुसरीकडे, नॅनोपोर सिक्वेन्सिंगमध्ये दीर्घ-वाचन तंत्रज्ञानाचा वापर केला जातो, ज्यामुळे पूर्ण-लांबीच्या एमआरएनए ट्रान्सक्रिप्टचे अनुक्रमण शक्य होते. हा दृष्टिकोन पर्यायी स्प्लिसिंग, जीन फ्यूजन, पॉली-एडेनिलेशन आणि एमआरएनए आयसोफॉर्म्सचे परिमाणीकरण यांचे व्यापक अन्वेषण सुलभ करतो.

नॅनोपोर सिक्वेन्सिंग, ही पद्धत नॅनोपोर सिंगल-मॉलिक्युल रिअल-टाइम इलेक्ट्रिकल सिग्नलवर अवलंबून असते, रिअल-टाइममध्ये परिणाम प्रदान करते. मोटर प्रथिनांच्या मार्गदर्शनाखाली, डबल-स्ट्रँडेड डीएनए बायोफिल्ममध्ये एम्बेड केलेल्या नॅनोपोर प्रथिनांशी बांधला जातो, व्होल्टेज फरकाखाली नॅनोपोर चॅनेलमधून जाताना तो उलगडतो. डीएनए स्ट्रँडवरील वेगवेगळ्या बेसद्वारे निर्माण होणारे विशिष्ट इलेक्ट्रिकल सिग्नल रिअल-टाइममध्ये शोधले जातात आणि वर्गीकृत केले जातात, ज्यामुळे अचूक आणि सतत न्यूक्लियोटाइड सिक्वेन्सिंग सुलभ होते. हा नाविन्यपूर्ण दृष्टिकोन शॉर्ट-रीड मर्यादांवर मात करतो आणि जटिल ट्रान्सक्रिप्टोमिक अभ्यासांसह जटिल जीनोमिक विश्लेषणासाठी एक गतिमान व्यासपीठ प्रदान करतो, ज्याचे परिणाम त्वरित होतात.

प्लॅटफॉर्म: नॅनोपोर प्रोमेथिऑन ४८

आमच्याशी संपर्क साधा

सेवा तपशील

बायोइन्फॉरमॅटिक्स

डेमो निकाल

वैशिष्ट्यीकृत प्रकाशने

वैशिष्ट्ये

● पॉली-ए mRNA चे कॅप्चर त्यानंतर cDNA संश्लेषण आणि ग्रंथालय तयारी

● पूर्ण लांबीच्या उताऱ्यांचा क्रम

● संदर्भ जीनोमशी संरेखनावर आधारित जैवमाहिती विश्लेषण

● बायोइन्फॉर्मेटिक विश्लेषणामध्ये केवळ जीन आणि आयसोफॉर्म-स्तरावर अभिव्यक्तीच नाही तर lncRNA, जीन फ्यूजन, पॉली-एडेनिलेशन आणि जीन स्ट्रक्चरचे विश्लेषण देखील समाविष्ट आहे.

सेवा फायदे

●आयसोफॉर्म पातळीवर अभिव्यक्तीचे परिमाणीकरण: संपूर्ण जनुक अभिव्यक्तीचे विश्लेषण करताना लपवता येणारे बदल उघड करून, तपशीलवार आणि अचूक अभिव्यक्ती विश्लेषण सक्षम करणे.

●कमी डेटा मागणी:नेक्स्ट-जनरेशन सिक्वेन्सिंग (NGS) च्या तुलनेत, नॅनोपोर सिक्वेन्सिंगमध्ये कमी डेटा आवश्यकता असतात, ज्यामुळे कमी डेटासह जीन एक्सप्रेशन क्वांटिफिकेशन सॅच्युरेशनच्या समतुल्य पातळीची अनुमती मिळते.

●अभिव्यक्ती परिमाणीकरणाची उच्च अचूकता: जीन आणि आयसोफॉर्म दोन्ही पातळीवर

●अतिरिक्त ट्रान्सक्रिप्टोमिक माहितीची ओळख: पर्यायी पॉलीएडेनिलेशन, फ्यूजन जीन्स आणि एलसीएनआरएनए आणि त्यांचे लक्ष्य जीन्स

●व्यापक कौशल्य: आमचा संघ प्रत्येक प्रकल्पात भरपूर अनुभव घेऊन येतो, त्यांनी ८५० हून अधिक नॅनोपोर पूर्ण-लांबीचे ट्रान्सक्रिप्टोम प्रकल्प पूर्ण केले आहेत आणि ८,००० हून अधिक नमुने प्रक्रिया केली आहेत.

●विक्रीनंतरचा आधार: आमची वचनबद्धता प्रकल्प पूर्ण होण्यापलीकडे जाऊन ३ महिन्यांच्या विक्री-पश्चात सेवा कालावधीसह विस्तारित आहे. या काळात, आम्ही निकालांशी संबंधित कोणत्याही प्रश्नांचे निराकरण करण्यासाठी प्रकल्प पाठपुरावा, समस्यानिवारण सहाय्य आणि प्रश्नोत्तर सत्रे ऑफर करतो.

नमुना आवश्यकता आणि वितरण

ग्रंथालय	अनुक्रम धोरण	शिफारस केलेला डेटा	गुणवत्ता नियंत्रण
पॉली ए समृद्ध	नॅनोपोर प्रोमेथिऑन ४८	६/१२ जीबी	सरासरी गुणवत्ता स्कोअर: Q10

नमुना आवश्यकता:

न्यूक्लियोटाइड्स:

संक्षेप (ng/μl)

रक्कम (μg)

पवित्रता

सचोटी

≥ १००

≥ १.०

OD260/280=1.7-2.5

OD260/230=0.5-2.5

जेलवर मर्यादित किंवा कोणतेही प्रथिने किंवा डीएनए दूषितता दिसून येत नाही.

वनस्पतींसाठी: RIN≥7.0;

प्राण्यांसाठी: RIN≥७.५;

५.०≥२८एस/१८एस≥१.०;

मर्यादित किंवा बेसलाइन उंची नाही

● वनस्पती:

मूळ, खोड किंवा पाकळी: ४५० मिग्रॅ

पाने किंवा बिया: ३०० मिग्रॅ

फळे: १.२ ग्रॅम

● प्राणी:

हृदय किंवा आतडे: ३०० मिग्रॅ

व्हिसेरा किंवा मेंदू: २४० मिग्रॅ

स्नायू: ४५० मिग्रॅ

हाडे, केस किंवा त्वचा: १ ग्रॅम

● आर्थ्रोपॉड्स:

कीटक: ६ ग्रॅम

क्रस्टेसिया: ३०० मिग्रॅ

● संपूर्ण रक्त: १ ट्यूब

● पेशी: १०⁶पेशी

शिफारस केलेले नमुना वितरण

कंटेनर: २ मिली सेंट्रीफ्यूज ट्यूब (टिन फॉइलची शिफारस केलेली नाही)

नमुना लेबलिंग: गट+प्रतिकृती उदा. A1, A2, A3; B1, B2, B3.

शिपमेंट:

१. सुक्या बर्फाचे नमुने पिशव्यांमध्ये पॅक करून कोरड्या बर्फात पुरावे लागतात.

२. आरएनएस्टेबल ट्यूब: आरएनए नमुने आरएनए स्टॅबिलायझेशन ट्यूबमध्ये (उदा. आरएनएस्टेबल®) वाळवले जाऊ शकतात आणि खोलीच्या तापमानात पाठवले जाऊ शकतात.

सेवा कार्यप्रवाह

न्यूक्लियोटाइड्स:

नमुना वितरण

ग्रंथालय बांधकाम

अनुक्रम

डेटा विश्लेषण

विक्रीनंतरच्या सेवा

सेवा कार्यप्रवाह

ऊती:

प्रयोग डिझाइन

नमुना वितरण

आरएनए निष्कर्षण

ग्रंथालय बांधकाम

अनुक्रम

डेटा विश्लेषण

विक्रीनंतरच्या सेवा

मागील: पूर्ण-लांबीचे mRNA अनुक्रम -PacBio

पुढे: वनस्पती/प्राणी संपूर्ण जीनोम अनुक्रमण

● कच्चा डेटा प्रक्रिया

● उतारा ओळख

● पर्यायी जोडणी

● जनुक पातळी आणि आयसोफॉर्म पातळीमध्ये अभिव्यक्तीचे प्रमाणीकरण

● भिन्न अभिव्यक्ती विश्लेषण

● फंक्शन अ‍ॅनोटेशन आणि समृद्धीकरण (DEGs आणि DETs)

पर्यायी स्प्लिसिंग विश्लेषण पर्यायी पॉलीएडेनिलेशन विश्लेषण (एपीए)

lncRNA अंदाज

नवीन जनुकांचे भाष्य

डीईटीचे क्लस्टरिंग

DEGs मध्ये प्रथिने-प्रथिने नेटवर्क

BMKGene च्या Nanopore पूर्ण-लांबीच्या mRNA सिक्वेन्सिंग सेवांद्वारे प्रकाशनांच्या क्युरेट केलेल्या संग्रहाद्वारे सुलभ केलेल्या प्रगतीचा शोध घ्या.

गॉन्ग, बी. एट अल. (२०२३) 'ग्लिओमामध्ये ऑन्कोजीन म्हणून सेक्रेटरी काइनेज FAM20C चे एपिजेनेटिक आणि ट्रान्सक्रिप्शनल सक्रियकरण', जर्नल ऑफ जेनेटिक्स अँड जीनोमिक्स, ५०(६), पृ. ४२२–४३३. doi: १०.१०१६/J.JGG.२०२३.०१.००८.

तो, झेड. आणि इतर (२०२३) 'IFN-γ ला प्रतिसाद देणाऱ्या लिम्फोसाइट्सच्या पूर्ण-लांबीच्या ट्रान्सक्रिप्टोम सिक्वेन्सिंगमुळे फ्लाउंडरमध्ये (पॅरालिचथिस ऑलिव्हॅसियस) Th1-स्क्यूड इम्यून रिस्पॉन्स दिसून येतो', फिश अँड शेलफिश इम्यूनोलॉजी, १३४, पृष्ठ १०८६३६. doi: १०.१०१६/J.FSI.२०२३.१०८६३६.

मा, वाय. एट अल. (२०२३) 'नेमोपिलेमा नोमुराई विष ओळखण्यासाठी पॅकबायो आणि ओएनटी आरएनए सिक्वेन्सिंग पद्धतींचे तुलनात्मक विश्लेषण', जीनोमिक्स, ११५(६), पृष्ठ ११०७०९. doi: १०.१०१६/J.YGENO.२०२३.११०७०९.

यू, डी. एट अल. (२०२३) 'नॅनो-सेक विश्लेषण hUMSC पासून मिळवलेल्या एक्सोसोम्स आणि मायक्रोव्हेसिकल्समधील भिन्न कार्यात्मक प्रवृत्ती प्रकट करते', स्टेम सेल रिसर्च अँड थेरपी, १४(१), पृ. १–१३. doi: १०.११८६/S१३२८७-०२३-०३४९१-५/टेबल्स/६.