उत्पादने

*येथे दाखवलेले डेमो परिणाम सर्व बायोमार्कर टेक्नॉलॉजीसह प्रकाशित केलेल्या जीनोमचे आहेत

1.चा हाय-सी संवाद उष्णता नकाशाकॅम्पटोथेका एक्युमिनाटाजीनोमनकाशावर दर्शविल्याप्रमाणे, परस्परसंवादाची तीव्रता रेषीय अंतराशी नकारात्मकरित्या संबंधित आहे, जी अत्यंत अचूक गुणसूत्र-स्तरीय असेंब्ली दर्शवते.(अँकरिंग रेशो: 96.03%)

कांग एम एट अल.,निसर्ग संप्रेषण, २०२१

2.Hi-C ने दरम्यानच्या व्युत्क्रमांचे प्रमाणीकरण सुलभ केलेगॉसिपियम हिरसुटमL. TM-1 A06 आणिजी. आर्बोरियमChr06

यांग झेड आणि इतर.,नेचर कम्युनिकेशन्स, २०१९

3.कसावा जीनोम SC205 चे असेंबली आणि बायलेलिक भेद.हाय-सी हीटमॅपने होमोलोगस क्रोमोसोममध्ये स्पष्ट विभाजन दाखवले आहे.

Hu W et al.,आण्विक वनस्पती, २०२१

4. दोन फिकस प्रजातींच्या जीनोम असेंब्लीवर हाय-सी हीटमॅप:F.microcarpa(अँकरिंग रेशो: 99.3%) आणिF.hispida (अँकरिंग रेशो: 99.7%)

झांग एक्स आणि इतर.,सेल, २०२०

बीएमके केस

वटवृक्षाचे जीनोम आणि परागकण वास्प

प्रकाशित: सेल, २०२०

अनुक्रम धोरण:

F. मायक्रोकार्पा जीनोम: अंदाजे.84 X PacBio RSII (36.87 Gb) + Hi-C (44 Gb)

एफ. हिस्पिडाजीनोम: अंदाजे.97 X PacBio RSII (36.12 Gb) + Hi-C (60 Gb)

युप्रिस्टिना व्हर्टिसिलाटाजीनोम: अंदाजे.170 X PacBio RSII (65 Gb)

मुख्य परिणाम

1. दोन वटवृक्षाचे जीनोम आणि एक परागकण वास्प जीनोम PacBio अनुक्रमणिका, Hi-C आणि लिंकेज नकाशा वापरून तयार केले गेले.
(१)F. मायक्रोकार्पाजीनोम: 908 Kb च्या contig N50, BUSCO स्कोअर 95.6% सह 426 Mb (अनुमानित जीनोम आकाराच्या 97.7%) ची असेंब्ली स्थापित केली गेली.Hi-C द्वारे एकूण 423 Mb अनुक्रम 13 गुणसूत्रांवर अँकर केले गेले.जीनोम एनोटेशनने 29,416 प्रोटीन-कोडिंग जीन्स प्राप्त केले.
(२)एफ हिस्पिडाजीनोम: 360 Mb चे असेंब्ली (अनुमानित जीनोम आकाराच्या 97.3%) 492 Kb च्या contig N50 आणि BUSCO स्कोअर 97.4% सह उत्पन्न होते.Hi-C द्वारे एकूण 359 Mb अनुक्रम 14 गुणसूत्रांवर अँकर केले गेले होते आणि उच्च-घनता लिंकेज नकाशाशी अगदी एकसारखे होते.
(३)युप्रिस्टिना व्हर्टिसिलाटाजीनोम: 387 Mb (अनुमानित जीनोम आकार: 382 Mb) चे असेंब्ली 3.1 Mb च्या contig N50 आणि 97.7% च्या BUSCO स्कोअरसह स्थापित केले गेले.

2. तुलनात्मक जीनोमिक्स विश्लेषणाने दोन मधील रचना भिन्नता मोठ्या संख्येने प्रकट केलीफिकसजीनोम, ज्याने अनुकूली उत्क्रांती अभ्यासासाठी अमूल्य अनुवांशिक संसाधन प्रदान केले.या अभ्यासाने, प्रथमच, जीनोमिक-स्तरावर फिग-वॉस्प सह-उत्क्रांतीबद्दल अंतर्दृष्टी प्रदान केली.

दोनच्या जीनोमिक वैशिष्ट्यांवर सर्कस आकृतीफिकसजीनोम, क्रोमोसोम्स, सेगमेंटल डुप्लिकेशन्स (SDs), ट्रान्सपोसन्स (LTR, TEs, DNA TEs), जनुक अभिव्यक्ती आणि सिंटेनी

Y गुणसूत्र आणि लिंग निर्धारण उमेदवार जीनची ओळख