उत्पादने

1.हिस्टोग्राम: प्रजाती वितरण

2. केईजीजी चयापचय मार्गांवर भाष्य केलेले कार्यात्मक जीन्स

3.उष्णता नकाशा: सापेक्ष जनुक विपुलतेवर आधारित भिन्न कार्ये4. CARD प्रतिजैविक प्रतिरोधक जनुकांचे सर्कोस

बीएमके केस

माती-खारफुटीच्या मुळाशी प्रतिजैविक प्रतिरोधक जनुकांचा आणि जीवाणूजन्य रोगजनकांचा प्रसार

प्रकाशित:जर्नल ऑफ हॅझर्डस मटेरियल, 2021

अनुक्रम धोरण:

साहित्य: खारफुटीच्या मुळाशी संबंधित नमुन्यांच्या चार तुकड्यांचे डीएनए अर्क: न लावलेली माती, रायझोस्फियर, एपिस्फियर आणि एंडोस्फियर कंपार्टमेंट
प्लॅटफॉर्म: Illumina HiSeq 2500
लक्ष्य: मेटाजेनोम
16S rRNA जनुक V3-V4 प्रदेश

मुख्य परिणाम

मातीपासून वनस्पतींमध्ये प्रतिजैविक प्रतिरोधक जनुकांच्या (ARGs) प्रसाराचा अभ्यास करण्यासाठी खारफुटीच्या रोपांच्या माती-मूळ सातत्यावरील मेटाजेनोमिक अनुक्रम आणि मेटाबारकोडिंग प्रोफाइलिंगची प्रक्रिया केली गेली.मेटाजेनोमिक डेटावरून असे दिसून आले की 91.4% प्रतिजैविक प्रतिरोधक जीन्स सामान्यतः वर नमूद केलेल्या चारही मातीच्या कप्प्यांमध्ये ओळखल्या गेल्या, ज्याने एक सतत फॅशन दर्शविला.16S rRNA amplicon अनुक्रमाने 29,285 अनुक्रम व्युत्पन्न केले, जे 346 प्रजातींचे प्रतिनिधित्व करतात.अॅम्प्लिकॉन सिक्वेन्सिंगद्वारे प्रजाती प्रोफाइलिंगसह एकत्रित केल्याने, हा प्रसार रूट-संबंधित मायक्रोबायोटापासून स्वतंत्र असल्याचे आढळले, तथापि, अनुवांशिक घटकांच्या मोबाइलद्वारे ते सुलभ केले जाऊ शकते.या अभ्यासाने जमिनीतून जमिनीतून वनस्पतींमध्ये ARGs आणि रोगजनकांचा प्रवाह एकमेकांशी जोडलेल्या माती-मूळ सातत्य द्वारे ओळखला गेला.

संदर्भ

वांग, सी. , हु, आर. , स्ट्राँग, पीजे , झुआंग, डब्ल्यू. , आणि शू, एल. .(२०२०).मातीच्या बाजूने प्रतिजैविक प्रतिरोधक जनुकांचा आणि जिवाणू रोगजनकांचा प्रसार – खारफुटीच्या मुळांच्या सातत्य.घातक सामग्रीचे जर्नल, 408, १२४९८५.