mRNA-seq (NGS) – नवीन

mRNA सिक्वेन्सिंग विशिष्ट परिस्थितीत पेशींमधील सर्व mRNA ट्रान्सक्रिप्ट्सचे प्रोफाइलिंग करण्यास अनुमती देते आणि विविध संशोधन क्षेत्रांमध्ये हे व्यापकपणे वापरले जाणारे तंत्रज्ञान आहे. BMKCloud De novo mRNA-seq पाइपलाइन ही संदर्भ जीनोम उपलब्ध नसताना पॉली-ए समृद्ध सिक्वेन्सिंग लायब्ररींचे विश्लेषण करण्यासाठी डिझाइन केलेली आहे. पाइपलाइन गुणवत्ता नियंत्रणाने सुरू होते, त्यानंतरनवीनचट्रान्सक्रिप्ट असेंब्ली आणि युनिजीन सेट निवड. युनिजीन स्ट्रक्चर विश्लेषण कोडिंग सिक्वेन्स (CDS) आणि सिंपल सिक्वेन्स रिपीट्स (SSR) चा अंदाज लावते. त्यानंतर, डिफरेंशियल एक्सप्रेशन विश्लेषण चाचणी केलेल्या परिस्थितींमध्ये डिफरेंशियलली एक्सप्रेस्ड जीन्स (DEGs) शोधते, त्यानंतर जैविक अंतर्दृष्टी काढण्यासाठी फंक्शनल एनोटेशन आणि DEGs चे समृद्धीकरण केले जाते.