BMKCloud Log in
条形 बॅनर-03

बातम्या

जीनोम उत्क्रांती

जीनोम डी नोव्हो
असेंबली|लिंग निर्धारण संपूर्ण क्रमवारीची कामे आणि आंशिक बायोइन्फॉरमॅटिक सेवा बायोमार्कर टेक्नॉलॉजीज द्वारे प्रदान केल्या गेल्या.

गोषवारा

"सीड्रॅगनच्या आयकॉनिक फिनोटाइपमध्ये पानांसारखे उपांग, दात नसलेले नळीचे तोंड आणि खुल्या "ब्रूड पॅच" वर फलित अंडी उष्मायनाचा समावेश असलेली पुरुष गर्भधारणा समाविष्ट आहे.आम्ही सामान्य सीड्रॅगन (फिलोप्टेरिक्स टॅनिओलॅटस) आणि त्याच्या जवळच्या संबंधित प्रजाती, अॅलिगेटर पाइपफिश (सिंग्नाथोइड्स बायक्युलेटस) चे नर आणि मादी जीनोम्स डी नोव्हो-अनुक्रमित केले.उत्क्रांतीवादी नॉव्हेल्टीमधील ट्रान्सक्रिप्शन प्रोफाइल, पानांसारखे परिशिष्ट, दर्शविते की सामान्यत: पंख विकासामध्ये गुंतलेल्या जनुकांचा संच तसेच संभाव्य ऊतक दुरुस्ती आणि रोगप्रतिकारक संरक्षण जनुकांसाठी ट्रान्स स्क्रिप्टचे संवर्धन केले गेले आहे.scpp5 साठी झेब्राफिश उत्परिवर्ती, जे सर्व सिंग्नाथिड्समध्ये हरवलेले आहे, त्यांना घशाचे दात नसलेले किंवा विकृत असल्याचे आढळून आले, या गृहितकाला आधार दिला की scpp5 च्या नुकसानामुळे सिंग्नाथिड्समध्ये दात गळतात.कॉमन सीड्रॅगन आणि अॅलिगेटर पाइपफिशद्वारे सामायिक केलेल्या पुरुष-विशिष्ट amhr2y जनुकाचे एन्कोडिंग करणारे पुटेटिव्ह लिंग-निर्धारित लोकस ओळखले गेले. "

साहित्य आणि पद्धती:

साहित्य

Fआमचा सामान्य सीड्रॅगन (पी. टेनिओलाटस) आणि दोन मगर पाइपफिश (एस. बायक्युलेटस) नमुने.दोन सामान्य सीड्रॅगन (एक नर आणि एक मादी) आणि दोन अॅलिगेटर पाइपफिश (एक नर आणि एक मादी) व्यक्ती संपूर्ण-जीनोम अनुक्रमासाठी वापरल्या गेल्या आणि दोन इतर नर सामान्य सीड्रॅगन व्यक्तींचा जीनोम अनुक्रमणासाठी वापर केला गेला.

जीनोम सिक्वेन्सिंग धोरण

270/350 bp लायब्ररी (Hiseq 2500) + Pacbio 20Kb (Sequel) किंवा Nanopore 30 Kb (MinION)+ Hi-C (NovaSeq 6000). अनुक्रम, आणि दोन इतर पुरुष सामान्य सीड्रॅगन व्यक्ती जीनोम रिसक्वेंसिंगसाठी वापरल्या गेल्या.

ट्रान्सक्रिप्टोम सिक्वेन्सिंग

Fकिंवा सामान्य सीड्रॅगन, मेंदू, डोळा, गिल, यकृत, हृदय, मूत्रपिंड, मेसेंटरी, आतडे, स्नायू, पंख, त्वचा, पानांसारखे उपांग, टेस्टिस आणि अंडाशय गोळा केले गेले.

जीनोम डी नोवो असेंब्ली स्ट्रॅटेजी

Cअनु (सुधारणा) + WTDBG2 (विधानसभा) + Pilon(पोलिश) + Lachesis (Hi-C).

मुख्य परिणाम

Fig.-1.-मुख्य-वैशिष्ट्ये-ची-सामान्य-सीड्रॅगन-P.-taeniolatus-आणि-Alligator-pipefish-S

अंजीर. 1. सामान्य सीड्रॅगन (पी. टेनिओलॅटस) आणि मगर पाइपफिश (एस. बायक्युलेटस) आणि त्यांच्या फायलोजेनेटिक पोझिशन्सची प्रमुख वैशिष्ट्ये.

अंजीर.-2.-आकृतिविज्ञान-आणि-अनुवांशिक-श्रृंगार-पान-समान-अपेंडेज-इन-द-कॉमन-सीड्रॅगन-पी

अंजीर 2. सामान्य सीड्रॅगन (पी. टेनिओलॅटस) मधील पानांसारख्या उपांगांचे आकृतिविज्ञान आणि अनुवांशिक रचना.

अंजीर.-3.-पुटेटिव्ह-लिंग-निर्धारण-जनुक-इन-द-सामान्य-सीड्रॅगन-पी.-टेनिओलाटस-आणि-अलिगेटर-पाइपफिश-एस.-बायक्यूलेटस

अंजीर. 3. कॉमन सीड्रॅगन (पी. टेनिओलॅटस) आणि अॅलिगेटर पाइपफिश (एस. बायक्युलेटस) मधील पुटेटिव्ह लिंग निर्धारण जनुक.

अंजीर.-4

अंजीर. 4. झेब्राफिश scpp5 homozygous mutants मध्ये फॅरेंजियल टूथ फेनोटाइप.


पोस्ट वेळ: जानेवारी-08-2022

तुमचा संदेश आम्हाला पाठवा: