-
पूर्ण-लांबीचे mRNA अनुक्रम-नॅनोपोर
सर्वसमावेशक ट्रान्सक्रिप्टोम विश्लेषणासाठी आरएनए अनुक्रम हे एक अमूल्य साधन आहे.निःसंशयपणे, पारंपारिक शॉर्ट-रीड सिक्वेन्सिंगने येथे अनेक महत्त्वपूर्ण विकास साधले.तरीसुद्धा, पूर्ण-लांबीच्या आयसोफॉर्म ओळख, परिमाण, पीसीआर पूर्वाग्रह यामध्ये अनेकदा मर्यादा येतात.
नॅनोपोर सिक्वेन्सिंग स्वतःला इतर सिक्वेन्सिंग प्लॅटफॉर्मपेक्षा वेगळे करते, ज्यामध्ये न्यूक्लियोटाइड्स डीएनए संश्लेषणाशिवाय थेट वाचले जातात आणि दहा किलोबेसवर दीर्घ वाचन तयार करतात.हे पूर्ण-लांबीच्या उतार्‍यांचे थेट वाचन करण्यास आणि आयसोफॉर्म-स्तरीय अभ्यासातील आव्हानांना सामोरे जाण्यास सक्षम करते.
प्लॅटफॉर्म:नॅनोपोर प्रोमेथिओन
लायब्ररी:cDNA-PCR
-
डी नोवो फुल-लेन्थ ट्रान्सक्रिप्टोम सिक्वेन्सिंग -PacBio
डी नोव्होपूर्ण-लांबीचे ट्रान्सक्रिप्टोम अनुक्रम, या नावाने देखील ओळखले जातेडी नोव्होIso-Seq वाचन लांबीमध्ये PacBio sequencer चे फायदे घेते, ज्यामुळे पूर्ण-लांबीच्या cDNA रेणूंचा कोणताही खंड न पडता अनुक्रम करणे शक्य होते.हे ट्रान्सक्रिप्ट असेंब्ली स्टेप्समध्ये व्युत्पन्न झालेल्या कोणत्याही त्रुटी पूर्णपणे टाळते आणि आयसोफॉर्म-लेव्हल रिझोल्यूशनसह युनिजीन सेट तयार करते.हा युनिजीन संच ट्रान्सक्रिप्टोम स्तरावर "संदर्भ जीनोम" म्हणून शक्तिशाली अनुवांशिक माहिती प्रदान करतो.याव्यतिरिक्त, पुढील पिढीच्या अनुक्रमांक डेटासह एकत्रित करून, ही सेवा isoform-स्तरीय अभिव्यक्तीचे अचूक प्रमाणीकरण करण्यास सक्षम करते.
प्लॅटफॉर्म: PacBio सिक्वेल IIलायब्ररी: SMRT बेल लायब्ररी -
युकेरियोटिक एमआरएनए सिक्वेन्सिंग-इलुमिना
mRNA सिक्वेन्सिंग विशिष्ट परिस्थितीत पेशींमधून ट्रान्सक्रिप्ट केलेल्या सर्व mRNA चे प्रोफाइलिंग सक्षम करते.जनुक अभिव्यक्ती प्रोफाइल, जनुक संरचना आणि विशिष्ट जैविक प्रक्रियांच्या आण्विक यंत्रणा प्रकट करण्यासाठी हे एक शक्तिशाली तंत्रज्ञान आहे.आजपर्यंत, mRNA अनुक्रम मूलभूत संशोधन, क्लिनिकल डायग्नोस्टिक्स, औषध विकास इत्यादींमध्ये मोठ्या प्रमाणावर वापरले गेले आहे.
प्लॅटफॉर्म: Illumina NovaSeq 6000
-
गैर-संदर्भ आधारित mRNA अनुक्रम-इलुमिना
mRNA सिक्वेन्सिंग नेक्स्ट-जनरेशन सिक्वेन्सिंग तंत्र (NGS) चा अवलंब करून मेसेंजर RNA(mRNA) फॉर्म युकेरियोट विशिष्ट कालावधीत कॅप्चर करते ज्यामध्ये काही विशेष कार्ये सक्रिय होतात.कापलेल्या सर्वात लांब प्रतिलिपीला 'युनिजीन' असे म्हणतात आणि त्यानंतरच्या विश्लेषणासाठी संदर्भ अनुक्रम म्हणून वापरले जाते, जे संदर्भाशिवाय प्रजातींच्या आण्विक यंत्रणा आणि नियामक नेटवर्कचा अभ्यास करण्यासाठी एक प्रभावी माध्यम आहे.
ट्रान्सक्रिप्टम डेटा असेंब्ली आणि युनिजीन फंक्शनल एनोटेशन नंतर
(1)SNP विश्लेषण, SSR विश्लेषण, CDS अंदाज आणि जनुकांची रचना पूर्वनिर्मित केली जाईल.
(2)प्रत्येक नमुन्यातील युनिजीन अभिव्यक्तीचे प्रमाणीकरण केले जाईल.
(३) नमुने (किंवा गट) दरम्यान भिन्नपणे व्यक्त केलेले युनिजीन युनिजीन अभिव्यक्तीच्या आधारे शोधले जातील
(४) क्लस्टरिंग, फंक्शनल एनोटेशन आणि विभेदकपणे व्यक्त केलेल्या युनिजीन्सचे संवर्धन विश्लेषण केले जाईल
-
लांब नॉन-कोडिंग अनुक्रम-इलुमिना
लाँग नॉन-कोडिंग RNAs (lncRNAs) हे 200 nt पेक्षा जास्त लांबीचे RNA रेणू आहेत, जे अत्यंत कमी कोडिंग क्षमतेने वैशिष्ट्यीकृत आहेत.LncRNA, नॉन-कोडिंग RNA मध्ये एक प्रमुख सदस्य म्हणून, मुख्यतः न्यूक्लियस आणि प्लाझ्मामध्ये आढळतो.सिक्वेन्सिंग टेक्नॉलॉजी आणि बायोइन्फॉर्मटिक्समधील विकासामुळे असंख्य कादंबरी lncRNAs ओळखणे शक्य होते आणि त्यांना जैविक कार्यांशी जोडले जाते.संचयी पुरावे सूचित करतात की lncRNA एपिजेनेटिक नियमन, ट्रान्सक्रिप्शन नियमन आणि पोस्ट-ट्रान्सक्रिप्शन नियमन यामध्ये मोठ्या प्रमाणावर गुंतलेले आहे.
-
लहान आरएनए सिक्वेन्सिंग-इलुमिना
लहान RNA म्हणजे नॉन-कोडिंग RNA रेणूंचा एक वर्ग ज्याची लांबी साधारणपणे 200nt पेक्षा कमी असते, ज्यात सूक्ष्म RNA (miRNA), लहान हस्तक्षेप RNA (siRNA), आणि piwi-interacting RNA (piRNA).
मायक्रोआरएनए (miRNA) हा अंतर्जात लहान आरएनएचा एक वर्ग आहे ज्याची लांबी सुमारे 20-24nt आहे, जी पेशींमध्ये विविध महत्त्वपूर्ण नियामक भूमिका बजावते.miRNA अनेक जीवन प्रक्रियांमध्ये सामील आहे जे ऊतक प्रकट करतात - विशिष्ट आणि स्टेज - विशिष्ट अभिव्यक्ती आणि विविध प्रजातींमध्ये अत्यंत संरक्षित.
-
circRNA अनुक्रम-इलुमिना
संपूर्ण ट्रान्सक्रिप्टोम सिक्वेन्सिंग हे सर्व प्रकारचे RNA रेणू प्रोफाईल करण्यासाठी डिझाइन केले आहे, ज्यामध्ये कोडिंग (mRNA) आणि नॉन-कोडिंग RNA (lncRNA, circRNA आणि miRNA सह) विशिष्ट पेशींद्वारे एका विशिष्ट वेळी लिप्यंतरण केले जाते.संपूर्ण ट्रान्सक्रिप्टोम सिक्वेन्सिंग, ज्याला "टोटल आरएनए सिक्वेन्सिंग" असेही म्हटले जाते, त्याचे उद्दिष्ट ट्रान्सक्रिप्टोम स्तरावर सर्वसमावेशक नियामक नेटवर्क उघड करणे हे आहे.NGS तंत्रज्ञानाचा फायदा घेऊन, संपूर्ण ट्रान्सक्रिप्टोम उत्पादनांचे अनुक्रम ceRNA विश्लेषण आणि संयुक्त RNA विश्लेषणासाठी उपलब्ध आहेत, जे कार्यात्मक वैशिष्ट्यीकरणाच्या दिशेने पहिले पाऊल प्रदान करते.circRNA-miRNA-mRNA आधारित ceRNA चे नियामक नेटवर्क उघड करणे.
-
संपूर्ण ट्रान्सक्रिप्टोम सिक्वेन्सिंग - इलुमिना
संपूर्ण ट्रान्सक्रिप्टोम सिक्वेन्सिंग हे सर्व प्रकारचे RNA रेणू प्रोफाईल करण्यासाठी डिझाइन केले आहे, ज्यामध्ये कोडिंग (mRNA) आणि नॉन-कोडिंग RNA (lncRNA, circRNA आणि miRNA सह) विशिष्ट पेशींद्वारे एका विशिष्ट वेळी लिप्यंतरण केले जाते.संपूर्ण ट्रान्सक्रिप्टोम सिक्वेन्सिंग, ज्याला "टोटल आरएनए सिक्वेन्सिंग" असेही म्हटले जाते, त्याचे उद्दिष्ट ट्रान्सक्रिप्टोम स्तरावर सर्वसमावेशक नियामक नेटवर्क उघड करणे हे आहे.NGS तंत्रज्ञानाचा फायदा घेऊन, संपूर्ण ट्रान्सक्रिप्टोम उत्पादनांचे अनुक्रम ceRNA विश्लेषण आणि संयुक्त RNA विश्लेषणासाठी उपलब्ध आहेत, जे कार्यात्मक वैशिष्ट्यीकरणाच्या दिशेने पहिले पाऊल प्रदान करते.circRNA-miRNA-mRNA आधारित ceRNA चे नियामक नेटवर्क उघड करणे.
-
प्रोकेरियोटिक आरएनए अनुक्रम
बदलत्या सेल्युलर ट्रान्सक्रिप्टोमचे विश्लेषण करून, दिलेल्या क्षणी आरएनएची उपस्थिती आणि प्रमाण प्रकट करण्यासाठी प्रोकेरियोटिक आरएनए अनुक्रम पुढील पिढीचे अनुक्रम (एनजीएस) वापरते.आमच्या कंपनीचे प्रोकेरियोटिक RNA अनुक्रम, विशेषत: संदर्भ जीनोमसह प्रोकेरियोट्सचे उद्दिष्ट आहे, तुम्हाला ट्रान्सक्रिप्टोम प्रोफाइलिंग, जनुक संरचना विश्लेषण इ. हे मूलभूत विज्ञान संशोधन, औषध संशोधन आणि विकास आणि बरेच काही यासाठी मोठ्या प्रमाणावर लागू केले गेले आहे.
प्लॅटफॉर्म: Illumina NovaSeq 6000
-
मेटाट्रान्सक्रिप्टोम सिक्वेन्सिंग
मेटाट्रान्सक्रिप्टोम सिक्वेन्सिंग नैसर्गिक वातावरणात (जसे की माती, पाणी, समुद्र, विष्ठा आणि आतडे.) सूक्ष्मजंतू (युकेरियोट्स आणि प्रोकेरियोट्स दोन्ही) च्या जनुक अभिव्यक्तीची ओळख पटवते. विशेषत: या सेवा आपल्याला जटिल सूक्ष्मजीव समुदायांचे संपूर्ण जीन अभिव्यक्ती प्रोफाइलिंग प्राप्त करण्यास अनुमती देते, वर्गीकरण. प्रजातींचे, वेगळ्या पद्धतीने व्यक्त केलेल्या जनुकांचे कार्यात्मक संवर्धन विश्लेषण आणि बरेच काही.
प्लॅटफॉर्म: Illumina NovaSeq 6000
