संपूर्ण ट्रान्सक्रिप्टोम सिक्वेन्सिंग - इलुमिना
वैशिष्ट्ये
● संपूर्ण ट्रान्सक्रिप्टोम अनुक्रमित करण्यासाठी दुहेरी लायब्ररी: rRNA कमी होणे त्यानंतर PE150 लायब्ररीची तयारी आणि आकाराची निवड त्यानंतर SE50 लायब्ररीची तयारी
● mRNA, lncRNA, circRNA आणि miRNA चे संपूर्ण बायोइन्फॉरमॅटिक्स विश्लेषण स्वतंत्र बायोइन्फर्मेटिक्स अहवालांमध्ये
● ceRNA नेटवर्क विश्लेषणासह एकत्रित अहवालातील सर्व RNA अभिव्यक्तीचे संयुक्त विश्लेषण.
सेवा फायदे
●नियामक नेटवर्कचे सखोल विश्लेषण: ceRNA नेटवर्क विश्लेषण mRNA, lncRNA, circRNA आणि miRNA च्या संयुक्त अनुक्रमाने आणि संपूर्ण जैव सूचनात्मक कार्यप्रवाहाद्वारे सक्षम केले जाते.
●सर्वसमावेशक भाष्य: आम्ही डिफरेन्शियल एक्‍सप्रेस्ड जीन्स (DEGs) ची कार्यक्षमतेने भाष्य करण्यासाठी एकाधिक डेटाबेस वापरतो आणि संबंधित संवर्धन विश्लेषण करतो, ट्रान्स्क्रिप्टोम प्रतिसाद अंतर्निहित सेल्युलर आणि आण्विक प्रक्रियांवर अंतर्दृष्टी प्रदान करतो.
●विस्तृत कौशल्य: विविध संशोधन डोमेनमध्ये 2000 हून अधिक संपूर्ण ट्रान्सक्रिप्टम प्रकल्प यशस्वीरित्या बंद करण्याच्या ट्रॅक रेकॉर्डसह, आमचा कार्यसंघ प्रत्येक प्रकल्पासाठी भरपूर अनुभव घेऊन येतो.
●कठोर गुणवत्ता नियंत्रण: आम्ही नमुना आणि लायब्ररीच्या तयारीपासून अनुक्रम आणि बायोइन्फॉरमॅटिक्सपर्यंत सर्व टप्प्यांवर कोर नियंत्रण बिंदू लागू करतो.हे सूक्ष्म निरीक्षण सातत्याने उच्च-गुणवत्तेचे परिणाम प्रदान करते.
● सर्वसमावेशक भाष्य: आम्ही डिफरेन्शियल एक्‍सप्रेस्ड जीन्स (DEGs) ची कार्यक्षमतेने भाष्य करण्यासाठी एकाधिक डेटाबेस वापरतो आणि संबंधित संवर्धन विश्लेषण करतो, ट्रान्स्क्रिप्टोम प्रतिसाद अंतर्निहित सेल्युलर आणि आण्विक प्रक्रियांवर अंतर्दृष्टी प्रदान करतो.
●पोस्ट-विक्री समर्थन: आमची वचनबद्धता 3 महिन्यांच्या विक्री-पश्चात सेवा कालावधीसह प्रकल्प पूर्ण होण्यापलीकडे आहे.या वेळी, आम्ही परिणामांशी संबंधित कोणत्याही शंकांचे निराकरण करण्यासाठी प्रकल्प पाठपुरावा, समस्यानिवारण सहाय्य आणि प्रश्नोत्तर सत्रे ऑफर करतो
नमुना आवश्यकता आणि वितरण
| लायब्ररी | अनुक्रम धोरण | डेटाची शिफारस केली आहे | गुणवत्ता नियंत्रण |
| rRNA कमी झाले | Illumina PE150 | 16 Gb | Q30≥85% |
| आकार निवडला | इलुमिना SE50 | 10-20M वाचन |
नमुना आवश्यकता:
न्यूक्लियोटाइड्स:
| Conc.(ng/μl) | रक्कम (μg) | पवित्रता | सचोटी |
| ≥ १०० | ≥ १ | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 जेलवर मर्यादित किंवा कोणतेही प्रथिने किंवा डीएनए दूषित नाही. | वनस्पती: RIN≥6.5 प्राणी: RIN≥7.0 5.0≥28S/18S≥1.0; मर्यादित किंवा बेसलाइन उंची नाही |
शिफारस केलेले नमुना वितरण
कंटेनर:
2 मिली सेंट्रीफ्यूज ट्यूब (टिन फॉइलची शिफारस केलेली नाही)
नमुना लेबलिंग: गट+प्रतिकृती उदा. A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
शिपमेंट:
1.ड्राय-बर्फ: नमुने पिशव्यामध्ये पॅक करणे आणि कोरड्या बर्फात पुरणे आवश्यक आहे.
2.RNAstable tubes: RNA नमुने RNA स्थिरीकरण ट्यूब (उदा. RNAstable®) मध्ये वाळवले जाऊ शकतात आणि खोलीच्या तापमानात पाठवले जाऊ शकतात.
सेवा कार्य प्रवाह
प्रयोग डिझाइन
नमुना वितरण
आरएनए काढणे
ग्रंथालय बांधकाम
अनुक्रम
डेटा विश्लेषण
विक्रीनंतर सेवा
बायोइन्फॉरमॅटिक्स
आरएनए अभिव्यक्ती विहंगावलोकन
भिन्नपणे व्यक्त केलेली जीन्स
ceRNA विश्लेषण
वेगळ्या पद्धतीने व्यक्त केलेले miRNA आणि संबंधित RNA
प्रकाशनांच्या क्युरेट केलेल्या संग्रहाद्वारे BMKGene'च्या संपूर्ण ट्रान्सक्रिप्टोम सिक्वेन्सिंग सेवांद्वारे सुलभ केलेल्या संशोधन प्रगतीचे अन्वेषण करा.
दाई, वाय. वगैरे.(2022) 'कशिन-बेक रोगातील mRNAs, lncRNAs आणि miRNAs चे व्यापक अभिव्यक्ती प्रोफाइल आरएनए-सिक्वेंसिंगद्वारे ओळखले गेले', आण्विक ओमिक्स, 18(2), pp. 154-166.doi: 10.1039/D1MO00370D.
लिऊ, एन. नान आणि इतर.(२०२२) 'फुल लेन्थ ट्रान्स्क्रिप्टोम्स अॅनालिसिस ऑफ एपिस सेराना ऑफ शीत-प्रतिरोधक चांगबाई माउंटन इन ओव्हर विंटरिंग पीरियड.', जीन, 830, पीपी. 146503–146503.doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
वांग, एक्सजे इत्यादी.(२०२२) 'मल्टी-ओमिक्स इंटिग्रेशन-बेस्ड प्रायोरिटायझेशन ऑफ कॉम्पीटिंग एंडोजेनस आरएनए रेग्युलेशन नेटवर्क इन स्मॉल सेल लंग कॅन्सर: मॉलिक्युलर कॅरॅक्टरिस्टिक्स अँड ड्रग कॅन्डिडेट्स', फ्रंटियर्स इन ऑन्कोलॉजी, 12, पी.904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xu, P. et al.(2022) 'lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA अभिव्यक्ती प्रोफाइल्सचे एकात्मिक विश्लेषण शेंगदाणामधील रूट-नॉट नेमाटोड्सच्या प्रतिसादात संभाव्य यंत्रणेतील नवीन अंतर्दृष्टी प्रकट करते', BMC जीनोमिक्स, 23(1), pp. 1-12.doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURES/7.
यान, झेड आणि इतर.(२०२२) 'होल-ट्रान्सक्रिप्टोम आरएनए सिक्वेन्सिंग ब्रोकोलीमध्ये लाल एलईडी इरॅडिएशनद्वारे कापणीनंतरच्या गुणवत्तेच्या देखरेखीशी संबंधित आण्विक यंत्रणा हायलाइट करते', पोस्टहार्वेस्ट बायोलॉजी अँड टेक्नॉलॉजी, 188, पी.111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
